• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

RNA合成酵素複合体の分子構造進化基盤

Research Project

Project/Area Number 26251009
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

富田 耕造  国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 上級主任研究員 (00345274)

Project Period (FY) 2014-06-27 – 2017-03-31
KeywordsRNA / tRNA / 構造解析
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、研究計画に記した真正細菌 Aquifex aeolicus由来のA付加酵素と3’末端様式あるいはアクセプターヘリックスの長さが異なったtRNA各種(3’末端がC74C75A76のもの、A76、C75A76が欠けたもの、さらにアクセプターヘリックが6bpあるいは8bpで3’末端のA76が欠けたもの)との二者複合体、さらにその二者複合体にCTPあるいはATPを加えた三者複合体などの結晶を作成し、構造解析を行った。最終的に十二種類の結晶構造を決定した。
これらの構造解析から、A付加酵素にはtRNAの結合部位が一か所のみ存在し、L字型三次元構造をとるtRNAのTPsiCループおよびDループの両方がA付加酵素のC末端側に形成されるテールドメインとボディードメイン間のくぼみに結合し、tRNAの三次元構造が酵素によって認識されていることが明らかになった。さらに、このC末端の酵素のくぼみを起点として酵素がtRNAの上部のアクセプターTPsiCへリックスの長さを測り、3’末端のAが欠けたtRNAの3’末端のみが、活性触媒ポッケトに到達できることが明らかになった。これらの一連の構造解析、および構造を基にした生化学解析から、A付加酵素がC74C75をtRNAへ付加することができず、末端のA76のみを付加することができる詳細な分子基盤が明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度の研究計画に記載した研究実施計画の真正細菌由来の鋳型非依存的RNA合成酵素のうちA付加酵素の特異性の分子メカニズムの詳細を明らかにできたため。

Strategy for Future Research Activity

今後は、真正細菌由来のCCA付加酵素についてtRNA複合体のX線結晶構造解析、機能解析を進め、クラスIIに属するCCA-、A-、CC-付加酵素の特異性の差異の詳細な分子基盤を明らかにしていく。

  • Research Products

    (5 results)

All 2015 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Measurement of acceptor-TΨC helix length of tRNA for terminal A76-addition by A-adding enzyme2015

    • Author(s)
      Yamashita S, Martinez A, Tomita K
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 23 Pages: 830-842

    • DOI

      doi:10.1016/j.str.2015.03.013

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Molecular Basis of A-addition by Aquifex aeolicus A-adding enzyme2015

    • Author(s)
      Seisuke Yamashita, Kozo Tomita
    • Organizer
      10th International Symposium on Aminoacyl-tRNA Synthetases 2015AARS
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2015-10-17 – 2015-10-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] U6 snRNA特異的TUTase (TUT1)によるU6 snRNA認識機構2015

    • Author(s)
      高木悠友子、山下征輔、富田 耕造
    • Organizer
      第17回 日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌 ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15 – 2015-07-17
  • [Presentation] Aquifex aeolicus A付加酵素によるA付加反応の分子基盤2015

    • Author(s)
      山下征輔、富田 耕造
    • Organizer
      第17回 日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌 ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15 – 2015-07-17
  • [Remarks] RNA合成酵素がRNAの長さを測る物差しとして機能

    • URL

      http://www.tomita-lab.net/20150423-2/

URL: 

Published: 2017-01-06  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi