• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2014 Fiscal Year Annual Research Report

チャネル機能発現における膜上集合・離散動態の新しい機構の解明

Research Project

Project/Area Number 26253014
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

老木 成稔  福井大学, 医学部, 教授 (10185176)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 炭竈 享司  福井大学, 医学部, 特命助教 (30579412)
岩本 真幸  福井大学, 医学部, 助教 (40452122)
角野 歩  福井大学, 医学部, 特別研究員 (80717140)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsチャネル / 細胞膜 / 集合・離散 / ゲーティング
Outline of Annual Research Achievements

イオンチャネルは他の膜蛋白質と同様、細胞膜上を動き回り、チャネル間で集合・離散を繰り返し、同種のチャネル同志が密な集合体を形成することがある。しかし、集合・離散状態でチャネル機能がどう変化するかということに関する報告はない。その理由は、チャネル一分子の機能状態と集合・離散を同時に捉える実験手法がなかったからである。最近私達は原子間力顕微鏡により、チャネル個々のゲート開閉構造を初めて捉えることに成功し、開閉に伴って膜上で集合・離散することを発見した。本研究ではこの成果をもとに、チャネルのどのような構造変化が膜上での集合・離散を引き起こすのかその分子機構を解明する。チャネル機能発現に集合・離散が密接に関わるという未知の局面を明らかにし、チャネル生理機能の新しい調節機構を提案したい。
チャネルの膜上での機能を明らかにするために、従来私たちが使ってきた脂質平面膜法を改良し、顕微鏡での観察と膜の特性を変えることのできる方法を開発した。特にこの方法では膜脂質組成をリーフレットごとに変えるだけでなく、膜の曲率を変えることができ、チャネルのゲーティングや集合・離散における機械的な影響を検討することができる。さらにさまざまな物質を使って膜の曲率を変えた実験も開始している。これとは平行して原子間力顕微鏡の高空間・時間分解能の測定を目指している。一方、計算機シミュレーション(分子動力学法)を使って、チャネルを透過するイオンの新しい振る舞いを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

チャネルの膜上での振舞いを明らかにするための新しい方法を開発し、論文として発表した。この方法により、チャネルの機能を測定しながら膜上での集合・離散を蛍光色素などで観察することができる。特にこの方法では膜の曲率を変化させることができるので、チャネルのゲーティング状態と膜上空間分布の関係を明らかにすることができる。またチャネルの膜上のオリエンテーションを制御する方法を開発しつつあり、これを原子間力顕微鏡(AFM)で高分解能で観察している。一方、チャネルの膜上での動態は高速AFMを適用することにより、従来の観察よりはるかに時間分解能の高い動態を捉えられる。さらにチャネルの開ゲート状態におけるイオン透過特性の特徴を明らかにすることに成功し、論文を投稿中である。

Strategy for Future Research Activity

AFMの測定が高分解能になるにしたがって、さまざまな実験上の困難が現れてきた。しかしこの課題を解決することが本プロジェクトのブレークスルーにつながるはずであり、集中して実験を進める。これらの問題は基本的なリポソーム作成法や脂質平面膜法、さらにチャネル蛋白への変異導入などの基本的技術を組み合わせることによって解決の糸口をたどりつつある。本年度は平行して進めている技術的課題を克服し、新しい結果を得ることである。これによって来年度の統合的過程に進めることができる。

  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] pH-dependent promotion of phospholipid flip-flop by the KcsA potassium channel.2016

    • Author(s)
      Nakao, H., Ikeda, K., Iwamoto, M., Shimizu, H., Oiki, S., Ishihara, Y., Nakano, M.
    • Journal Title

      BBA Biomemb.

      Volume: 1848 Pages: 145-150

    • DOI

      org/10.1016/j.bbamem.2014.10.001

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 膜内KcsAカリウムチャネルの原子間力顕微鏡による構造・動態解析2016

    • Author(s)
      角野歩、山本大輔、炭竃享司、岩本真幸、出羽毅久、*老木成稔
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 55 Pages: 5-10

    • DOI

      10.2142/biophys.55.005

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Contact Bubble Bilayers with Flush Drainage2015

    • Author(s)
      Iwamoto, M. and S. Oiki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: 9110(1-7)

    • DOI

      10.1038/srep09110

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Distinct configurations of cations and water in the selectivity filter of the KcsA potassium channel proved by 3D-RISM theory2015

    • Author(s)
      Phongphanphanee, S., Yoshida, N., Oiki, S. and Hirata, F.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Lipid

      Volume: 200 Pages: 52-58

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2014.03.050

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Gating-associated clustering-dispersion dynamics of the KcsA potassium channel in a lipid membrane2014

    • Author(s)
      68.Sumino, A., Yamamoto, D., Iwamoto, M., Dewa, T., and Oiki, S.
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. Lett.

      Volume: 5 Pages: 578-584

    • DOI

      org/10.1021/jz402491t

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Paradoxical one-ion pore behavior of a long β-helical peptide of marine cytotoxic polytheonamide B2014

    • Author(s)
      Iwamoto, M., Matsunaga, S. and Oiki, S.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 4 Pages: 3636(1-7)

    • DOI

      10.1038/srep03636

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Channel Function Reconstitution and Reanimation2014

    • Author(s)
      Oiki, S.
    • Organizer
      The 45th NIPS International symposium, Co-sponsored by “The Journal of Physiology”
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知)
    • Year and Date
      2014-11-26 – 2014-11-28
    • Invited
  • [Presentation] チャネル膜蛋白質KcsAの一分子構造-機能ダイナミクスと膜2014

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      膜学会
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京)
    • Year and Date
      2014-05-13 – 2014-05-14
    • Invited
  • [Presentation] Spatio-Temporal Interplay of the Single KcsA Potassium Channel in the Membrane2014

    • Author(s)
      Oiki, S.
    • Organizer
      Single Protein Dynamics in Cellulo: Spatio-Temporal, Structural and Quantitative Analyses
    • Place of Presentation
      沖縄科学技術大学院大学(沖縄)
    • Year and Date
      2014-04-21 – 2014-04-25
    • Invited
  • [Book] 1分子ナノバイオ計測〜分子から生命システムを探る革新的技術2014

    • Author(s)
      老木成稔
    • Total Pages
      222
    • Publisher
      化学同人
  • [Remarks] 分子生理学(生理学1)研究室

    • URL

      http://seiri1.med.lab.u-fukui.ac.jp/

URL: 

Published: 2016-06-01  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi