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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of functional connectivity between neurons and astrocytes that generate self-excited synchronization phenomenon in the respiratory center

Research Project

Project/Area Number 26280109
Research InstitutionThe Institute of Statistical Mathematics

Principal Investigator

三分一 史和  統計数理研究所, モデリング研究系, 准教授 (30360647)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 尾家 慶彦  兵庫医科大学, 医学部, 助教 (50396470)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2018-03-31
Keywords生体イメージングデータ時空間解析 / 神経情報学 / 自励的同期活動 / 呼吸中枢 / 抑制性ニューロン / カルシウムイメージング / ニューロインフォマティクス / 時空間解析
Outline of Annual Research Achievements

昨年度は、カルシウム指示薬OGB-1を用いたイメージングデータとGlyT2陽性グリシン抑制性ニューロンとGAD65陽性GABA抑制性ニューロンで特異的に発現させた蛍光タンパクのイメージ画像を組み合わせることにより、活動性の細胞を興奮性ニューロン、グリシン抑制性ニューロン、GABA抑制性ニューロンに分類しながら、細胞の位置を示す2値化画像を作成する画像処理方法を開発したが、細胞種の判定は目視で行う必要があり、大量のデータ処理にはさらなる自動化が必要であった。本年度は、OGB-1の2値化画像で活動性ニューロンの領域に対応するピクセル座標を絞り込み、GlyT2とGAD65の2値化画像で各々のニューロンの領域と重複するピクセル数の割合を計算し、興奮性ニューロン、グリシン抑制性ニューロン、GABA抑制性ニューロンを自動判定するアルゴリズムを開発した。この方法と相互相関解析を組み合わせると、活動性のニューロンに対する吸息性ニューロンの割合をニューロン種を区別しながら自動検出することが可能となった。
また、吸息性ニューロンの活性化タイミングの相互相関解析に加えて時系列解析の手法によるモデリングに関する研究を行った。あるニューロンの時系列に対し、他のニューロンの時系列情報を考慮する外生変数型自己回帰モデルを適用し、外生変数を考慮した場合をしない場合とでの赤池情報量規準(AIC)の差を空間マップ化する視覚化法を開発した。この方法を用いると、あるニューロンに対して因果性を持つニューロンと空間配置を同時に定量評価することが可能である。本研究成果について学術論文の投稿準備中である。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Gottingen/Carl-Ludwig-Institute for Physiology(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      University of Gottingen/Carl-Ludwig-Institute for Physiology
    • # of Other Institutions
      2
  • [Journal Article] Night duty and decreased brain activity of medical residents: a wearable optical topography study2017

    • Author(s)
      Nishida Masaki、Kikuchi Senichiro、Miwakeichi Fumikazu、Suda Shiro
    • Journal Title

      Medical Education Online

      Volume: 22 Pages: 1379345~1379345

    • DOI

      https://doi.org/10.1080/10872981.2017.1379345

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 2-3-10. Development of cerebral activity examination that is simple and robust against repetition by using wearable NIRS2017

    • Author(s)
      Kikuchi Senichiro、Kurosawa Yukie、Murooka Nami、Shimoda Kaori、Nishida Masaki、Miwakeichi Fumikazu、Tozato Fusae
    • Journal Title

      Clinical Neurophysiology

      Volume: 128 Pages: e166~e167

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.clinph.2017.03.018

    • Open Access
  • [Presentation] Detection of irregularly firing inspiratory neurons in the pre-Botzinger complex based on spatiotemporal optical imaging data analysis2017

    • Author(s)
      F. Miwakeich, Y. Oke, Y. Oku, S. Besser, J. Hirrlinger, S. Hulsmann
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of Society for Neuroscience
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of cerebral activity examination that is simple and robust against repetition by using wearable NIRS2017

    • Author(s)
      S. Kikuchi, N. Tsutui, Y. Kurosawa, N. Murooka, K. Shimoda, M. Nishida, F. Miwakeichi, F. T ozato
    • Organizer
      WPA XVII World Congress of Psychiatry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] General pattern of activation sequence among excitatory/inhibitory inspiratory neurons during rhythmic burst in the pre-Botzinger complex of the mice medulla slice2017

    • Author(s)
      Y. Oke, F. Miwakeich, Y. Oku, S. Besser, J. Hirrlinger, S. Hulsmann
    • Organizer
      Oxford Conference 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Estimation of spontaneous synchronous neuronal network based on spatio-temporal optical imaging data analysis2017

    • Author(s)
      F. Miwakeichi, Y.Oke, S. Hulsman
    • Organizer
      ISI-ISM-ISSAS Joint Conference TOKYO 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Neuronal type-dependent stochastic activation sequence among inspiratory neurons during rhythmic burst in the pre-Botzinger complex of the mice medulla slice2017

    • Author(s)
      Y. Oke, F. Miwakeichi, Y. Oku, S. Besser, J. Hirrlinger and S. Huelsmann
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of Society for Neuroscience
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マウス延髄スライスの吸息性中枢内で吸息性細胞が自励的同期活動を行う際の細胞種依存的な活性化順序パターン2017

    • Author(s)
      尾家慶彦, 三分一史和, 越久仁敬, S. Besser, J. Hirrlinger, S. Huelsmann
    • Organizer
      第110回近畿生理学談話会
  • [Presentation] Detection of irregularly firing inspiratory neurons in the pre-Botzinger complex based on spatio-temporal optical imaging data analysis2017

    • Author(s)
      三分一史和, 尾家慶彦, 越久仁敬, S. Besser, J. Hirrlinger, S. Huelsmann
    • Organizer
      平成29年度統計数理研究所共同研究集会 生体信号・イメージングデータ解析に基づくダイナミカルバイオインフォマティクスの展開

URL: 

Published: 2018-12-17  

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