• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2014 Fiscal Year Annual Research Report

テロメアRNA四重鎖構造分子基盤の解明を目指したケミカルバイオロジー

Research Project

Project/Area Number 26288083
Research InstitutionUniversity of Miyazaki

Principal Investigator

徐 岩  宮崎大学, 医学部, 准教授 (40506763)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords生体分子 / 核酸 / 有機化学
Outline of Annual Research Achievements

最近、ヒトテロメアDNAがRNAに転写されているという意外な事実が明らかになった。この発見によって、テロメアRNAが細胞内において重要な役割を果たすことが示唆された。そこで、本研究では、有機合成による分子プローブの創製とこれを利用した細胞内のヒトテロメアRNA 分子構造を目指したケミカルバイオロジー研究を行う。本年度の目標である有機合成によるヒトテロメアRNA 分子機構の解明に利用できるケミカルバイオロジーツールの創製において、テロメアRNA四構造の生体内可視化に必要なフッ素基修飾核酸の合成に成功した。さらに、創製したツールを用いて小分子、タンパク質とテロメアRNA四重鎖の相互作用の解析に成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

有機合成によるヒトテロメアRNA分子機構の解明に利用可能なケミカルバイオロジーツールの創製に成功した。さらに、創製したツールを用いて小分子、タンパク質とテロメアRNA四重鎖の相互作用の解析に成功した。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、有機合成によるテロメアRNA 分子機構の解明に利用できるケミカルバイオロジーツールの創製、およびそれを駆使して細胞内のテロメアRNA 四重鎖構造の解析が第一段階である。そしてこれを基盤にした第二段階として、そこで得られた情報を、細胞内においてテロメアRNA とテロメアDNA 関連性を明らかにする。具体的に、我々は、すでに化学モデル系において、開発に成功したクリックケミストリーという化学的アプローチを利用することにより、細胞内のテロメアRNA とテロメアDNA 関連性の解明に取り組んでいく。また、細胞内において合成したプローブを駆使してin-cell NMRにより細胞内のテロメアRNA四重鎖構造を観測に展開していく。最終的にこれらの知見に基づいてテロメアRNA 高次構造による染色体の安定化や細胞生死に対する制御機構の解明に取り組んでいく。

Causes of Carryover

平成26年5月、有機合成による分子プローブの創製を行うところ(26年12月から実施)、フッ素基を有する核酸プローブがRNA配列内に導入された場合は、四重鎖構造が安定化するため、NMRによりシグナルは観測されないことが判明した。改善する策として核酸プローブをRNA配列の5’末端に導入することに成功した。このため、in vitroおよび細胞内のシグナル観測をより詳細に検討する必要が生じた

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年4月から5’末端にフッ素基を有する核酸プローブRNA配列の安定性を検討する。27年9月から核酸プローブRNA配列の構造を解析する。28年1月から細胞内環境での四重鎖の構造変化をNMRにより観測する。

  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (10 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Finding a human telomere DNA-RNA Hybrid G-quadruplex formed by human telomeric 6-mer RNA and 16-mer DNA using click chemistry: a Protective Structure for Telomere End2014

    • Author(s)
      Y. Xu, Y. Suzuki, T. Hayashi, M. Komiyama
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 22 Pages: 4419-4421

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.05.053

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] シクログアノシンの四重鎖構造での影響2015

    • Author(s)
      石塚匠,徐岩
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Multiple chemical approaches control cell adhesion2015

    • Author(s)
      LIU, Hongshan; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Macrocyclic Polyoxazoles as telomere RNA and DNA G-Quadruplexbinding Ligands2015

    • Author(s)
      LIU, Xiao; ISHIZUKA, Takumi; XIAO, Chaoda; IIDA, Keisuke; NAGASAWA, Kazuo; XU, Yan
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 19F NMR for probing human telomere RNA G-quadruplex structure2015

    • Author(s)
      BAO, Hongliang; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Effects of 8,2'-O-cycloguanosine on G-quadruplex structure2014

    • Author(s)
      Takumi Ishizuka, XU, Yan
    • Organizer
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] To probe human telomere RNA Gquadruplex structure by 19F NMR2014

    • Author(s)
      BAO, Hongliang; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • Organizer
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] Recognition of telomere RNA Gquadruplex by small molecule2014

    • Author(s)
      LIU, Xiao; ISHIZUKA, Takumi; XIAO, Chaoda; IIDA, Keisuke; NAGASAWA, Kazuo; XU, Yan
    • Organizer
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] Cell-cell connection by multiple chemical approaches. The 41th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry2014

    • Author(s)
      LIU, Hongshan; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • Organizer
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] ヒトテロメアRNAの構造および生化学機能2014

    • Author(s)
      徐岩,石塚匠,肖潮達,劉暁,夏岩,鮑宏亮,劉泓汕
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] 19F-NMRによるDNA四重鎖の構造変化の観測2014

    • Author(s)
      石塚匠,徐岩
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Book] Clipping of Telomere from Human Chromosomes using Chemistry-based Artificial Restriction DNA Cutter2015

    • Author(s)
      T. Ishizuka, Y. Xu, M. Komiyama
    • Total Pages
      13
    • Publisher
      John Wiley & Sons, Inc.
  • [Remarks] http://www.med.miyazaki-u.ac.jp/MMCCHEM/index.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi