2015 Fiscal Year Annual Research Report
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26290064
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
大川 恭行 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80448430)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | エピゲノム / 高次クロマチン構造 / クロマチンリモデリング |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は昨年度までの解析で明らかにした高次クロマチン構造制御を行うクロマチンリモデリング酵素Brg1の活性制御機構を明らかにした。本研究はマサチューセッツ大学医学部Imbalzano博士との共同研究で発表を行った(Nasipik et al, Nat Commun. 2015)。Brg1は活性を正に制御するCalcineurinによる脱リン酸化制御と、負に制御するPKAの経路が互いに拮抗的に働きクロマチン構造活性を制御していることを明らかにした。現在、特異的なリン酸化部位に対する抗体作成を進めておりエピゲノム解析の準備を行っている。また、本研究を進めるうえでエピゲノム解析の技術開発も並行して行った(Maehara et al, Bioinformatics. 2015)。agplusと名付けたツールを開発し、転写因子結合位置、あるいは、転写開始点等の任意のアノテーション情報に基づき、数万のエピゲノムデータを高速で俯瞰的なデータとして可視化を可能にした。現在公開データベース上で普及を図っている。また、本研究の推進は極めて顕著であり、新たに別角度の検討として、高次クロマチン構造に必要となるクロマチン構成要素の探索を追加して行った。その一つとしてChd5クロマチンリモデリング因子がゲノム上のレトロトランスポゾンの抑制に機能していることを明らかにした。(Hayashi et al, J cell Biochem. 2016)
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
当初の研究計画を先行して達成しつつあり新たな解析についても２報、関連技術解析についての２報論文発表を行った。また共同研究を含めて２２報の国際査読誌への論文発表を行った。極めて順調に推移している。
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| Strategy for Future Research Activity |
本研究計画はおおむね達成しつつあり、残り期間ではChd2を高次クロマチン構造制御について解析を進める。研究計画に大きな変更はない。
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Research Products
(28 results)
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[Journal Article] Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2.2016
Author(s)
Hayashi M, Maehara K, Harada A, Semba Y, Kudo K, Takahashi H, Oki S, Meno C, Ichiyanagi K, Akashi K, Ohkawa Y.
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Journal Title
J Cell Biochem.
Volume: 3
Pages: 780-92
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Identification of low-abundance proteins in serum via the isolation of HSP72 complexes.2016
Author(s)
3.Tanaka M, *Shiota M, Nakao T, Uemura R, Nishi S, Ohkawa Y, Matsumoto M, Yamaguchi M, Osada-Oka M, Inagaki A, Takahashi K, Nakayama KI, Gi M, Izumi Y, Miura K, Iwao H.
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Journal Title
J Proteomics.
Volume: 136
Pages: 214-221
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Histone H3.5 forms an unstable nucleosome and accumulates around transcription start sites in human testis.2016
Author(s)
4.Urahama T, Harada A, Maehara K, Horikoshi N, Sato K, Sato Y, Shiraishi K, Sugino N, Osakabe ATachiwana H, Kagawa W, Kimura H, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
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Journal Title
Epigenetics Chromatin
Volume: 9
Pages: 2
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Chromatin-prebound Crm1 recruits Nup98-HoxA9 fusion to induce aberrant expression of Hox cluster genes.2016
Author(s)
Oka M, Mura S, Yamada K, Sangel P, Hirata S, Maehara K, Kawakami K, Tachibana T, Ohkawa Y, Kimura H, Yoneda Y.
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Journal Title
Elife.
Volume: 5
Pages: e09540
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Cdt1-binding protein GRWD1 is a novel histone-binding protein that facilitates MCM loading through its influence on chromatin architecture.2015
Author(s)
Sugimoto N, Maehara K, Yoshida K, Yasukouchi S, Osano S, Watanabe S, Aizawa M, Yugawa T, Kiyono T, Kurumizaka H, Ohkawa Y, Fujita M.
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Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 43
Pages: 5898-5911
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] PSMC5, a 19S Proteasomal ATPase, Regulates Cocaine Action in the Nucleus Accumbens.2015
Author(s)
Ohnishi YH, Ohnishi YN, Nakamura T, Ohno M, Kennedy PJ, Ohkawa Y, Nishi A, Neve R, Tsuzuki T, Nestler EJ.
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Journal Title
PLoS One.
Volume: 10
Pages: e0126710
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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