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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of mechanisms of metabolic disorder-associated genes by the integration of genomic and non-genomic approaches

Research Project

Project/Area Number 26290067
Research InstitutionNational Center for Global Health and Medicine

Principal Investigator

加藤 規弘  国立研究開発法人国立国際医療研究センター, その他部局等, その他 (80293934)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 並河 徹  島根大学, 医学部, 教授 (50180534)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsゲノム / マイクロアレイ / 遺伝子 / エピゲノム / mRNA
Outline of Annual Research Achievements

ゲノムワイド関連解析などの探索的ゲノム解析により見いだされてきた遺伝子座/染色体領域の、責任遺伝子の同定の可否〔Genomic approach〕、および遺伝子発現変化等の機序の解明〔Non-genomic approach〕について、両アプローチを組み合わせた、代謝関連疾患の統合的理解を研究目的とする。大きく以下の3つの課題に取り組む。
課題1. 代謝関連疾患形質の責任遺伝子座におけるexpression-QTL (eQTL:QTLは量的形質遺伝子座の略称)の探究:インスリン抵抗性のモデルである高血圧自然発症ラット (SHR)系統と対照のWistar Kyotoラット(WKY)系統間で、主要な遺伝的効果を示す、代謝関連疾患形質の責任遺伝子座(positional QTL:pQTLと略)の近傍領域に関して、(1)SNPの系統分布様式、(2)遺伝子発現量の系統差、を調べる。
課題2. エピゲノム(DNAメチル化)の検討:ゲノムワイドなDNA methylation arrayを用いて、腎臓、肝臓、脂肪の組織間でのDNAメチル化の違いを検討する。その際、(1)「geneticとepigenetic variantsが親から子の世代に一緒に受け継がれるかどうか」を組織別に調べる。(2)代謝関連疾患に関わる介入(食塩負荷、高脂肪食負荷、及び糖質コルチコイド負荷)に伴う、遺伝-環境相互作用としてのepigeneticsの意義を検討する。
課題3. microRNA (miRNA)の変動と分子ネットワークの探究:ゲノムワイドなRat miRNA microarrayを用いて、DNAメチル化解析と同様、組織間での発現プロフィールの違いを検討する。その際、miRNA(とその標的配列)の多型が代謝関連疾患形質のpQTL本体であるかどうか、および遺伝-環境相互作用におけるmiRNAの意義を検討する。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2016

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Effect of p22phox depletion on sympathetic regulation of blood pressure in SHRSP: evaluation in a new congenic strain.2016

    • Author(s)
      Zahid HM, Ferdaus MZ, Ohara H, Isomura M, Nabika T
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 6 Pages: 36739

    • DOI

      10.1038/srep36739

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A nonsense mutation of Stim1 identified in stroke-prone spontaneously hypertensive rats decreased the store-operated calcium entry in astrocytes.2016

    • Author(s)
      Ohara H, Nabika T
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 476 Pages: 406-11

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.05.134

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Different effects of arginine vasopressin on high-mobility group box 1 expression in astrocytes isolated from stroke-prone spontaneously hypertensive rats and congenic SHRpch1_18 rats.2016

    • Author(s)
      Yamagata K, Sone N, Suguyama S, Nabika T
    • Journal Title

      Int J Exp Pathol

      Volume: 97 Pages: 97-106

    • DOI

      10.1111/iep.12172

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Epigenetic changes in the brain with high-salt intervention in SHR.2016

    • Author(s)
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • Organizer
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Epigenetic changes in the liver with high-fat-diet intervention in SHR.2016

    • Author(s)
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • Organizer
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Epigenetic changes in the liver with dexamethasone administration in SHR.2016

    • Author(s)
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • Organizer
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparison of epigenetic changes in the liver between Tg-CETP rat and SHR.2016

    • Author(s)
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • Organizer
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparison of epigenetic changes in the liver between RNO4-derived congenic rat and progenitor strains.2016

    • Author(s)
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • Organizer
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA methylation and hypertension.2016

    • Author(s)
      Kato N
    • Organizer
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2018-01-16  

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