• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

非コードRNAによる細胞内構造構築機序の解明

Research Project

Project/Area Number 26291001
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

廣瀬 哲郎  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (30273220)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords生体分子 / 核酸 / 発現制御 / 細胞 / ゲノム
Outline of Annual Research Achievements

核内構造体パラスペックル形成に必須な役割を果たすアーキテクチュラルRNA(arcRNA)、NEAT1 lncRNAに相互作用するタンパク質因子の機能解析によって、いくつかの重要な知見を得た。これまで実施者らが同定したパラスペックル形成に必須なRNA結合タンパク質RBM14, FUSの働きには、RNA結合ドメインだけでなく、それらが共通してもつプリオン様ドメインによるヒドロゲル形成活性が重要であることを、西オーストラリア大との共同研究によって明らかにし、J Cell Biol誌にその成果が掲載された。一方、RNA結合タンパク質以外の必須因子として前年度までに発見していたSWI/SNFクロマチン再構築複合体の働きをさらに詳細に解析し、この複合体がNEAT1 lncRNAや他の必須タンパク質とRNA-タンパク質およびタンパク質間相互作用し、これらの因子を空間的に集約するパラスペックル会合のハブとして機能していることを明らかにした。さらにCRISPR-Cas9ゲノム編集技術を用いてSWI/SNF複合体の活性サブユニットBRG1のATPase部位に変異を導入したところ、パラスペックルの会合機能には影響を与えないことが明らかになった。これによってSWI/SNF複合体は、ATPに依存したクロマチンリモデリング活性と異なる新規な作用機構によって、NEAT1に依存したパラスペックル形成のハブとして働いていることが示された。この成果論文はPNAS誌に掲載された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

パラスペックル形成に必須なタンパク質因子の新しい働きを複数明らかにすることができ、2報の論文を国際的に評価の高いジャーナルに掲載できたことから、当初の計画以上に進展したと判断できる。

Strategy for Future Research Activity

今年度に取り入れたゲノム編集技術を、これまでRNAI技術に頼っていた機能阻害実験の代わりに全面的に導入することによって、これまでよりクリアかつ長期的な機能阻害効果をモニターする系を立ち上げて、本研究をさらに強固なものにしていく予定である。

  • Research Products

    (17 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] CNRS(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      CNRS
  • [Int'l Joint Research] 西オーストラリア大学(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      西オーストラリア大学
  • [Journal Article] SWI/SNF chromatin-remodeling complexes function in noncoding RNA-dependent assembly of nuclear bodies.2015

    • Author(s)
      Kawaguchi T, Tanigawa A, Naganuma T, Ohkawa Y, Souquere S, Pierron G, Hirose T.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      Volume: 112 Pages: 4304-4309

    • DOI

      10.1073/pnas.1423819112.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Prion-like domains in RNA binding proteins are essential for building subnuclear paraspeckles.2015

    • Author(s)
      Hennig S, Kong G, Mannen T, Sadowska A, Kobelke S, Blythe A, Knott GJ, Iyer KS, Ho D, Newcombe EA, Hosoki K, Goshima N, Kawaguchi T, Hatters D, Trinkle-Mulcahy L, *Hirose T, *Bond CS, *Fox AH.(*co-corresponding)
    • Journal Title

      J Cell Biol.

      Volume: 210 Pages: 529-539

    • DOI

      10.1083/jcb.201504117.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Architectural RNAs (arcRNAs): A class of long noncoding RNAs that function as the scaffold of nuclear bodies.2015

    • Author(s)
      Chujo T, Yamazaki T, Hirose T.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta.

      Volume: 1859 Pages: 139-146

    • DOI

      10.1016/j.bbagrm.2015.05.007

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chromatin remodeling complexes in the assembly of long noncoding RNA-dependent nuclear bodies.2015

    • Author(s)
      Kawaguchi T, Hirose T.
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 6 Pages: 462-467

    • DOI

      10.1080/19491034.2015.1119353

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Clues to long noncoding RNA taxonomy2015

    • Author(s)
      Hirose T, Nakagawa S.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta.

      Volume: 1859 Pages: 1-2

    • DOI

      10.1016/j.bbagrm

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Re-quantification of paraspeckle architectural components and an exploratory search for novel nuclear RNA bodies by using an improved RNA extraction method.2016

    • Author(s)
      Takeshi Chujo, Tomohiro Yamazaki, Shinichi Nakagawa, Tetsuya Kawaguchi, Chikako Fujikawa, Ayaka Kubota, Toru Takumi, Tetsuro Hirose
    • Organizer
      Keystone symposia
    • Place of Presentation
      Santa Fe, USA
    • Year and Date
      2016-02-21 – 2016-02-24
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] CRISPR/Cas9-mediated dissection of NEAT1 lncRNA to identify “architectural” RNA elements.2016

    • Author(s)
      Tomohiro Yamazaki and Tetsuro Hirose
    • Organizer
      Keystone symposia
    • Place of Presentation
      Santa Fe, USA
    • Year and Date
      2016-02-21 – 2016-02-24
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NEAT1 lncRNAの難溶性を考慮したパラスペックル構造因子の再定量と構造構築原理の探究2015

    • Author(s)
      中條 岳志、中川 真一、川口哲哉、内匠 透、廣瀬 哲郎
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] RNase感受性スクリーニングにより同定された核内RNA顆粒の形成機構の解析2015

    • Author(s)
      萬年 太郎、五島 直樹、廣瀬 哲郎
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] CRISPR/Cas9-mediated dissection of NEAT1 lncRNA to identify “architectural” RNA elements2015

    • Author(s)
      Tomohiro Yamazaki and Tetsuro Hirose
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] Decoding noncoding RNA code: 細胞内構造構築機能を中心に2015

    • Author(s)
      廣瀬哲郎
    • Organizer
      国際医療センター転写研究会セミナー
    • Place of Presentation
      国立国際医療研究センター(東京都新宿区)
    • Year and Date
      2015-11-18
    • Invited
  • [Presentation] ncRNA研究アップデート20152015

    • Author(s)
      廣瀬哲郎
    • Organizer
      バイオファイナンスギルド
    • Place of Presentation
      バイオフロンティアパートナーズ特別講堂(東京都中央区)
    • Year and Date
      2015-11-12
    • Invited
  • [Presentation] Long noncoding RNA による核内構造の動態制御2015

    • Author(s)
      廣瀬哲郎
    • Organizer
      臨床ストレス応答学会大会
    • Place of Presentation
      東京農工大学(東京都小金井市)
    • Year and Date
      2015-11-07
    • Invited
  • [Presentation] ノンコーディングRNAによる核内アーキテクチュア2015

    • Author(s)
      廣瀬哲郎
    • Organizer
      Aging, Bone and Cnacer Frontline Forum
    • Place of Presentation
      庭のホテル(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2015-05-25
    • Invited
  • [Book] Long Noncoding RNAs: Structures and Functions2015

    • Author(s)
      Mannen, T., Chujo, T., Hirose, T
    • Total Pages
      22
    • Publisher
      Springer

URL: 

Published: 2017-01-06  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi