2017 Fiscal Year Annual Research Report
A mechanism of leaf formation induced by long intergenic non-coding (linc) RNA
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26291056
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
町田 泰則 名古屋大学, 理学研究科, 研究員 (80175596)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伊藤 正樹 名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (10242851)
高橋 広夫 金沢大学, 薬学系, 准教授 (30454367)
渡邊 雄一郎 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (60183125)
町田 千代子 中部大学, 応用生物学部, 教授 (70314060)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | ノンコーディングRNA / AS1-AS2 / 遺伝子発現制御 / 葉分化 / シロイヌナズナ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
[I] Linc RNA の構造の研究：新たな成果は得られなかった。
[II] ETT 遺伝子発現と葉の形態形成におけるLinc RNAの役割の研究：Linc RNAのゲノム上の正確な位置はマップできなかったが、その近傍のT-DNA挿入変異体の表現型から、Linc RNA コード領域は栄養成長から生殖成長への転換に関わっている可能性が考えられた。
[III] Linc RNA とタンパク質複合体の研究：(1) 前年度に引き続いて、AS2 と相互作用するタンパク質候補のクローンの構造解析を行った。その結果、核小体にも存在するリボソームL15 super family のタンパク質やS-adenosyl-L-methionine dependent methyltransferase family proteinなども同定された。さらに核小体関連の染色体構造に関わる因子も同定された。(2) AS2 body 形成の研究では大きな進展があった。AS2 body形成に必要なAS2のアミノ酸配列をさらに調べ、これらが葉の形態形成に必要かどうかを検討した。その結果、ジンクフィンガー様モチーフとそのごく近傍のアミノ酸配列だけが重要であった。さらに、ジンクフィンガー様モチーフに結合する分子を探索し、AS2 の標的である ETT のコード領域である exon 1 の特定配列が強く結合することが判明した。(3) 新規にもう一つの核小体タンパク質が ETT のコード領域にある exon 6のCpGシトシンのメチル化の維持に関わっていることがわかった。
以上の成果は、Linc RNA の機能解明に関しては不十分であるが、ETTのメチル化によるエピジェネティックな抑制機構の解明に向けて、新機軸を切り開いたと評価できる。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(22 results)
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[Journal Article] Arabidopsis Zinc-Finger-Like Protein ASYMMETRIC LEAVES2 (AS2) and Two Nucleolar Proteins Maintain Gene Body DNA Methylation in the Leaf Polarity Gene ETTIN (ARF3)2018
Author(s)
Vial-Pradel Simon, Keta Sumie, Nomoto Mika. Luo Lilan, Takahashi Hiro, Suzuki Masataka, Yokoyama Yuri, Sasabe Michiko, Kojima Shoko, Tada Yasuomi, Machida Yasunori, Machida Chiyoko
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Journal Title
Plant & Cell Physiology
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] A Critical Role of the NAC transcription Factor ANAC082 in Ribosomal Stress Signaling of Plant Cells2018
Author(s)
Iwai ohbayashi, Shun Sasaki, Chung-yi Lin, Naoki Shinohara, Yoko Matsumura, Yasunori Machida, Gorou Horiguchi, Hirokazu Tsukaya, Masahiro Furutani, Hitoshi Onouchi, Munetaka Sugiyama
Organizer
第59回日本植物生理学会年会
Invited
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