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2014 Fiscal Year Annual Research Report

植物の形態形成を司る転写制御ネットワークの解明

Research Project

Project/Area Number 26291064
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

杉本 慶子  独立行政法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (30455349)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords植物ホルモン・成長生理・全能性 / 細胞分化 / 細胞周期 / 遺伝子発現調節 / 発生遺伝
Outline of Annual Research Achievements

多細胞生物の器官が継続的に成長し、形態形成を進めるためには、細胞の増殖と分化、成熟のバランスが協調的に制御される必要がある。植物のメリステムでは細胞が増殖期を経て分化を開始し、やがて成熟するが、この過程を制御する分子機構には未解明の点が多い。細胞増殖期から分化、成熟期への移行には転写制御因子による大規模な遺伝子発現変動が関与する可能性が示唆されているが、その制御機構の解明は遅れている。我々は最近シロイヌナズナの新規変異体スクリーニングから、これらの移行過程を制御する転写因子候補を多数同定した。本研究ではこれらの転写因子の下流標的遺伝子を網羅的に決定し、機能解析を進めることによって、植物の細胞増殖と分化、成熟のバランスを調節する新規転写制御ネットワークを解明することを目的としている。今年度は、GRTF転写因子群のプロモーターを用いて発現誘導するキメラリプレッサー系統の作成を進めた。また同時にそれぞれのGRTFのノックアウト変異体の整備を進めた。さらにそれぞれのGRTFを35Sプロモーターや発現誘導プロモーターに連結するコンストラクト(35S:GRTF、pER8:GRTF等)を作成し、安定型もしくは誘導型のGRTF過剰発現体を整備した。このなかから、誘導型の過剰発現体で既に細胞増殖、成長に異常のみられるGRTFについては、その下流標的遺伝子群を網羅的に同定するため、RNAseqによる全ゲノム発現解析の準備を進めた。またGRTFの植物体内での発現場所を特定するために、GRTF遺伝子をGFPに結合して発現するpGRTF:GRTF-GFP植物体の作成を進めた

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

次年度以降に進めるGRTFの機能解析に必要な形質転換体の整備が順調に進んでいるため。また解析を始めたGRTFについては既に細胞増殖、成長に異常がみられており、予定より早くRNAseqに準備にも取りかかっているため。

Strategy for Future Research Activity

今年度作成したGRTF欠損変異体と過剰発現体の表現型解析を進める。葉や根の矮小化、形態異常が見られる系統についてはフローサイトメトリー解析を行い、細胞分裂周期や核内倍加周期の進行に異常があるかどうかを検討する。また葉や根の細胞の顕微鏡観察を行い、細胞の数や形、大きさに異常が見られるかどうかを調べる。

Causes of Carryover

平行して進める予定であったChIP解析用の形質転換体作出及びChIPの条件検討に予想以上に時間がかかり全ゲノム解析用のサンプル調整が間に合わなかったため、物品費を繰り越すことになった。またこのため海外出張(旅費)、論文投稿(その他)を次年度に延期した。

Expenditure Plan for Carryover Budget

繰り越した物品費、旅費、その他費用は、それぞれ今年度予定した通り、ChIPseq解析消耗品、海外出張、論文投稿費として使用する。

  • Research Products

    (7 results)

All 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Differential regulation of B2-type CDK accumulation in Arabidopsis roots.2014

    • Author(s)
      Okushima Y, Shimizu K, Ishida T, Sugimoto K, Masaaki U
    • Journal Title

      Plant Cell Rep

      Volume: 33(7) Pages: 1033-40

    • DOI

      10.1007/s00299-014-1581-z

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Endocycling in the path of plant development2014

    • Author(s)
      Breuer C, Braidwood L, and Sugimoto K
    • Journal Title

      Curr Opin Plant Biol

      Volume: 17 Pages: 78-85

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2013.11.007

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] My body is a cage: Mechanisms and modulation of plant cell growth.2014

    • Author(s)
      Braidwood L, Breuer C, and Sugimoto K
    • Journal Title

      New Phytol

      Volume: 201 Pages: 388-402

    • DOI

      10.1111/nph.12473

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Chemical genetic approach to identify the substrates of plant cyclin-dependent kinases2014

    • Author(s)
      原島洋文、Philippe Hammann, 杉本慶子、Arp Schnittger
    • Organizer
      The 38th Naito Conference on Molecule-based biological systems
    • Place of Presentation
      シャトレーゼ ガトーキングダム サッポロ(札幌市)
    • Year and Date
      2014-10-07 – 2014-10-10
  • [Presentation] To grow or not to grow: plant growth signaling under environmental limiting conditions2014

    • Author(s)
      Bart Rymen, 岩瀬哲、杉本慶子
    • Organizer
      The 38th Naito Conference on Molecule-based biological systems
    • Place of Presentation
      シャトレーゼ ガトーキングダム サッポロ(札幌市)
    • Year and Date
      2014-10-07 – 2014-10-10
  • [Presentation] Transcriptional regulation of organ growth under limiting conditions2014

    • Author(s)
      Bart Rymen, 池田美穂、光田展隆、高木優、松井南、杉本慶子
    • Organizer
      The 25th International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      University of British Columbia, Canada
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
    • Invited
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://cellfunction.riken.jp/index.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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