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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Understanding biological ignificance of histone modifications by epigenetic manipulation using multifunctional antibodies

Research Project

Project/Area Number 26291071
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

木村 宏  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (30241392)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2018-03-31
Keywordsヒストン修飾 / クロマチン / エピジェネティクス
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、修飾ヒストン特異的抗体や様々な機能を付加した一本鎖可変領域抗体(scFv; single-chain variable fragment)を細胞に導入することで、個々のヒストン修飾を標的とした解析、及び、特異的修飾を受けたクロマチンに結合する蛋白質の解析により、遺伝子発現とクロマチン制御におけるヒストン修飾の意義について理解することを目的として行った。分裂期におけるリン酸化ヒストンH3と共に免疫沈降される蛋白質を質量分析で探索して得られたブロモドメインを持つ蛋白質の詳細な解析を行った。この蛋白質は、セントロメアにも局在するであり、その局在化ドメインの絞り込みを行ったところ、ブロモドメイン以外の場所がセントロメア局在に必要であることがわかった。また、この蛋白質を強制的にクロマチンにテザリングすると、多くのセントロメア蛋白質もその場所に局在することが明らかになった。したがって、この蛋白質は、セントロメアクロマチンの形成を促進することが示唆された。セントロメアクロマチンには特定のヒストン修飾が存在することから、今後の研究によりセントロメアクロマチン形成とヒストン修飾との関係が明らかにできると期待できる。一方、新規細胞内可変領域抗体(mintbody;modification-specific intracellular antibody)の開発も進め、トリメチル化ヒストンH3K27に特異的なmintbodyを生細胞で発現させることに成功した。ヒトやマウスの雌体細胞にこのmintbodyを発現させるとことで不活性X染色体を生細胞で可視化することが可能となった。今後、このmintbodyを用いた可視化や遺伝子操作により転写抑制や活性化の機構を明らかにできると期待できる。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (19 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 6 results) Remarks (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] キュリー研究所/ツールーズ大学(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      キュリー研究所/ツールーズ大学
  • [Int'l Joint Research] フロリダ州立大学/ロックフェラー大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      フロリダ州立大学/ロックフェラー大学
  • [Int'l Joint Research] エジンバラ大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      エジンバラ大学
  • [Journal Article] NOTCH-mediated non-cell autonomous regulation of chromatin structure during senescence2018

    • Author(s)
      Parry AJ, Hoare M, Bihary D, Hansel-Hertsch R, Smith S, Tomimatsu K, Mannion E, Smith A, D'Santos P, Russel IA, Balasubramanian S, Kimura H, Samarajiwa SA, Narita M.
    • Journal Title

      Nat Commun

      Volume: 9 Pages: 1840

    • DOI

      10.1038/s41467-018-04283-9

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] HP1α targets the chromosomal passenger complex for activation at heterochromatin before mitotic entry.2018

    • Author(s)
      Ruppert JG, Samejima K, Platani M, Molina O, Kimura H, Jeyaprakash AA, Ohta S, Earnshaw WC.
    • Journal Title

      EMBO J

      Volume: 37 Pages: e97677

    • DOI

      10.15252/embj.201797677

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] HELLS and CDCA7 comprise a bipartite nucleosome remodeling complex defective in ICF syndrome.2018

    • Author(s)
      Jenness C, Giunta S, Muller MM, Kimura H, Muir TW, Funabiki H.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 115 Pages: E876-E885

    • DOI

      10.1073/pnas.1717509115

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] H3S10ph broadly marks early-replicating domains in interphase ESCs and shows reciprocal antagonism with H3K9me2.2018

    • Author(s)
      Chen CCL, Goyal P, Karimi MM, Abildgaard MH, Kimura H, Lorincz MC.
    • Journal Title

      Genome Res

      Volume: 28 Pages: 37-51

    • DOI

      10.1101/gr.224717.117

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging2017

    • Author(s)
      Imre L, Simandi Z, Horvath A, Fenyofalvi G, Nanasi P, Niaki EF, Hegedus E, Bacso Z, Weyemi U, Mauser R, Ausio J, Jeltsch A, Bonner W, Nagy L, Kimura H, Szabo G.
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 7 Pages: 12743

    • DOI

      10.1038/s41598-017-12608-9

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Semi-quantitative Analysis of H4K20mel Levels in Living Cells Using Mintbody2017

    • Author(s)
      Sato Y, Kimura H
    • Journal Title

      Bio-protocol

      Volume: 7 Pages: e2276

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.2276

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Chromatin modification dynamics during gene activation in living cells2017

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      4D Nucleome : The Cell Nucleus in Space and Time
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Chromatin modification dynamics during gene activation in living cells2017

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      10th Berlin Summer Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Chromatin modification dynamics during cell differentiation2017

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      Gordon Research Conference “Genome Architecture in Cell Fate & Disease”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Chromatin modification dynamics during cell differentiation2017

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      HMGU-Japan Epigenetics and Chromatin Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Chromatin Integration Labeling Technology2017

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      平成29年度遺伝研研究会『エピジェネティクスの基盤となるクロマチン・細胞核の動的構造変換』
    • Invited
  • [Presentation] クロマチン修飾ダイナミクスと転写制御2017

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Remarks] 木村宏 研究室

    • URL

      http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/index.html

  • [Remarks] 東工大 木村宏 研究者情報

    • URL

      http://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/researcherinfo.cgi?q_researcher_content_number=CTT100673940#

  • [Remarks] 東工大 細胞制御工学研究センター

    • URL

      http://www.rcb.iir.titech.ac.jp/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ヒストンH3トリメチル化リシン特異的モノクローナル抗体又はその抗原結合性断片2017

    • Inventor(s)
      木村 宏、佐藤優子、大井彰人、胡桃坂仁志、鯨井智也、他
    • Industrial Property Rights Holder
      東京工業大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-111580

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-02-28  

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