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2015 Fiscal Year Annual Research Report

栽培イネ誕生のきっかけとなった形質に関与する遺伝子群の解明

Research Project

Project/Area Number 26292004
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

石井 尊生  神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (20260648)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2018-03-31
Keywordsイネ / 栽培化 / 野生イネ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、栽培イネ誕生のきっかけとなったと考えられる穂の開閉に関する遺伝子の調節機構の解明ならびに穂の開閉に物理的に関与する種子の芒と受精に関する花器官の影響について調査し、イネの栽培化初期の実態を明らかにすることを目的としている。本年度は、野生イネO. rufipogon W630、栽培イネO. sativa Nipponbare、およびそれらの交雑後代系統を用いて、以下の4つの項目について形質調査ならびに遺伝子解析を行った。
1.穂の開閉の原因遺伝子であるOsLG1遺伝子の発現調節機構の解明:OsLG1を含む染色体領域をヘテロ型に持つ個体の自殖後代から得られた、OsLG1遺伝子領域近傍で組みかえを起こした個体を育成し、それらの穂の形態調査を行った。その結果、OsLG1遺伝子の発現調節候補領域が8.4 kbに限定された。
2.穂の開閉に関与するOsLG1遺伝子以外の新たな遺伝子の同定: OsLG1遺伝子を持たない栽培イネ遺伝的背景の戻し交雑自殖系統と栽培イネとの交雑由来のF2集団を圃場に展開し、穂の開閉に関するQTL解析を行った。なお、穂の開閉には中間型も見られたため、形質評価は開、中間型、閉の3段階で行ったところ、第5染色体上に効果の大きいQTLが検出された。
3.芒の長さを支配する遺伝子の同定:芒の長さに関して強い効果を持つ第8染色体上のQTLの詳細な位置を調べるため、栽培イネ遺伝的背景で領域付近で組みかえを起こした個体を幼苗段階で選抜した。そしてそれらを育成し後代検定用の自殖種子を得た。
4.花器官の形質を支配する遺伝子の同定:
昨年度条件設定した計測方法に基づき、栽培イネの遺伝的背景を持つ戻し交雑自殖系統を用いて、葯長や花糸長をはじめとする花器形態についてのQTL解析を行った。その結果、10形質に対して26カ所のQTLが検出された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

前年度得られたOsLG1遺伝子近傍で組み換えを起こした個体の自殖後代の遺伝子型の決定ならびに穂の開閉に関するQTL解析では、幼苗期にDNAを抽出し分子マーカー座の遺伝子型をあらかじめ調べたため、形質調査後にすぐ解析することができた。芒の長さに関するQTL領域のファインマッピングでも、幼苗期のマーカー選抜により組み換え個体を効率よく得ることができた。花器官に関する形質調査では、前年度の予備実験で設定した条件により基づき多くの系統を調べることができた。

Strategy for Future Research Activity

先行項目の研究は、材料育成、QTL解析、ファインマッピング、後代検定に至っているので、後続項目の研究はそれに準じて効率よく進めていく予定である。なお、来年度より発現解析を行うが、正確なデータが得られることを心がける。

Causes of Carryover

交付申請書に記載した経費の約85%を使用したが、年度をまたぐ解析に必要な試薬分が次年度に持ち越しになった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

解析は進行中であるので、翌年度請求分と合わせて、試薬の購入に充当する。

  • Research Products

    (7 results)

All 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Inhibition of abscission layer formation caused by an interaction of two seed-shattering loci, sh4 and qSH3, in rice2015

    • Author(s)
      Inoue C, Htun TM, Inoue K, Ikeda K, Ishii T, Ishikawa R
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 90 Pages: 1-9

    • DOI

      doi.org/10.1266/ggs.90.1

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 野生イネOryza rufipogonと栽培イネO. sativaの戻し交雑集団を用いた穂の開帳性に関するQTL解析2016

    • Author(s)
      西岡 諒、三日月 裕美、田中 裕、沼口 孝司、石川 亮、石井 尊生
    • Organizer
      日本育種学会 第129回講演会
    • Place of Presentation
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-22
  • [Presentation] 野生イネおよび栽培イネの遺伝的背景における芒の長さを支配する遺伝子座の対立遺伝子間の相互作用2016

    • Author(s)
      池本 麻衣、大塚 光晴、石川 亮、石井 尊生
    • Organizer
      日本育種学会 第129回講演会
    • Place of Presentation
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-22
  • [Presentation] インディカ型栽培イネKasalathの脱粒性喪失に関与した新規遺伝子座の探索2016

    • Author(s)
      岡 佑美、井上 千鶴、Than Myint Htun、竹中 祥尭、辻村 雄紀、石井 尊生、石川 亮
    • Organizer
      日本育種学会 第129回講演会
    • Place of Presentation
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-22
  • [Presentation] 野生イネ(Oryza rufipogon) の遺伝的背景における種子脱粒性と穂の開帳性の関係2015

    • Author(s)
      井上 千鶴、Than Myint Htun、石井 尊生、石川 亮
    • Organizer
      日本育種学会 第128回講演会
    • Place of Presentation
      新潟大学(新潟県・新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-12
  • [Presentation] 野生イネOryza rufipogon由来の穂の開帳性を支配する遺伝子座の推定2015

    • Author(s)
      西岡 諒、三日月 裕美、Than Myint Htun、石川 亮 、石井 尊生
    • Organizer
      近畿作物・育種研究会 第179回例会
    • Place of Presentation
      橿原考古学研究所(奈良県・橿原市)
    • Year and Date
      2015-05-30
  • [Presentation] 野生イネOryza rufipogonと栽培イネO. sativaの戻し交雑自殖系統を用いた節からの出芽・出根能力およびひこばえの発生能力の評価2015

    • Author(s)
      池本麻衣、大八木徹弥、Pham Thien Thanh、石川 亮、石井尊生
    • Organizer
      近畿作物・育種研究会 第179回例会
    • Place of Presentation
      橿原考古学研究所(奈良県・橿原市)
    • Year and Date
      2015-05-30

URL: 

Published: 2017-01-06  

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