2016 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive studies on higher plant mitochondrial genomes based on genome analysis
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26292007
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| Research Institution | Kyoto Sangyo University |
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Principal Investigator |
寺地 徹 京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (90202192)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山岸 博 京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (10210345)
山本 真紀 関西福祉科学大学, 教育学部, 教授 (60240123)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ミトコンドリアゲノム / コムギ / ダイコン / 雄性不稔 / 分子コーミング / 葉緑体形質転換 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究はダイコンとその近縁種、パンコムギとその近縁種という２つの異なる分類群を対象に、植物ミトコンドリアゲノムの構造と機能、ならびに変異と進化に関する包括的な研究を行い、このゲノムについての新しい概念を創出することを目的とする。そのため、1. 次世代シークエンシングにより多くの植物種のミトコンドリアゲノムを解読するとともに、バイオインフォマティクスの手法を積極的に取り入れ、全塩基配列ベースでゲノム構造の比較解析を行なう、2. 分子コーミングの手法を応用してゲノム構造に関する物理的な情報を付加し、ゲノム解読の結果と照合する、3. 新規オープンリーディングフレーム（ORF）に着目し、大腸菌とタバコ葉緑体を用いた発現解析を通じて、これらORFの機能を明らかする、という３つの実験を実施した。
具体的に上記1ではAegilops caudataおよびAe. searsii（いずれも細胞質置換コムギを使用）、Triticum monococcum、T. speltaの概要配列データを取得し、サンガー法によるフィニッシングの後、遺伝子のアノテーションなどゲノム解読を完了した。またイネ科の作物であるオオムギ、ライムギ、さらにイネ科のモデル植物であるBrachypodium distachyonについてもミトコンドリアゲノムの解読を行ない、オオムギについては結果を初めて公表した。ダイコンとその近縁種については、クロダイコンなど３つのタイプの比較ゲノム解析を行ない結果を公表した。2ではファイバーFISH法でDNA分子を観察することはできたが、技術的な問題で構造を推定するには至らなかった。3ではダイコンに雄性不稔を引き起こすB. mauroumを材料に、雄性不稔原因遺伝子とされるorf118の大腸菌での発現解析を行なうとともに、この遺伝子を葉緑体ゲノムに持つ組換えタバコを作出し表現型を観察した。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(12 results)
