2016 Fiscal Year Annual Research Report
Molecular phylogenetic study on domestic process and global gene migration of chicken and pigs
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26292139
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
西堀 正英 広島大学, 生物圏科学研究科, 准教授 (80237718)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
万年 英之 神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (20263395)
下桐 猛 鹿児島大学, 農学部, 准教授 (40315403)
山本 義雄 広島大学, 生物圏科学研究科, 名誉教授 (10032103) [Withdrawn]
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ニワトリ / ブタ / ゲノム情報 / ドメスティケーション / 遺伝的多様性 / ミトコンドリア / SNP / 分子系統 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ニワトリとブタは，それぞれヤケイとイノシシから多様な品種が作出され，それらを基に育種改良された。しかしいつ，どこでドメステケーションされ，どのようにグローバル化が進んだのか，まだ詳細な解析結果は明らかではない。本課題では，ニワトリとブタのそれぞれの近縁野生種，アジア在来集団および改良産業品種を対象に，ミトコンドリアDNAやSNPsなどの遺伝マーカーを用い，グローバルかつ大規模に分子系統学的解析を行った。
本課題では，（1）ニワトリとブタSNPs解析システム（DigiTag2），ミトゲノムを用いたグローバルな分子系統樹の構築を試みた。（2）ミトゲノム，SNPsタイピング結果から，ヤケイとニワトリ，イノシシとブタの遺伝的集団構造解析を実施した。（3）遺伝情報から遺伝子流動を推定し，グローバル化の一端を推定した。
１）イノシシ，ブタでは，その分子系統樹はそれぞれの集団毎に分岐，クレードを形成し，①アジアのイノシシと中国由来のブタ，②欧米のブタ集団に大別された。ニホンイノシシ(JWB)とリュウキュウイノシシ（RWB）は遺伝的に分離された。RWBは①沖縄本島，奄美大島，徳之島，加計呂麻島，②石垣島と西表島の大きく二分し，さらに各島々毎に６つにも分岐した。しかしRWBはラオス・カンボジア・ブータンのイノシシと近縁ではなかった。さらにRWBは他のブタ・イノシシと遺伝的に遠く, 特異的な集団構造をとることが明らかになった。
２）ニワトリとヤケイの600個体以上のミトゲノム分子系統樹を構築し，61ハプロタイプを見出した。これらからアフリカ大陸の在来鶏は北部地中海からと南部や中央アフリカを経由する2つのルートで移動した可能性が示唆された。
３）タイでヤケイのドメスティケーションモデルを発見し，本遺伝マーカーシステムを使い，表現型ヤケイ個体の遺伝子型は，ヤケイ集団と在来鶏ハイブリット集団に分かれた。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] Molecular Phylogenetic Analysis and Morphological Features of Ryukyu Wild Boar in Japan2017
Author(s)
Maho Ito, Keiko Takeuchi, Syuichi Hamada, Tomomi Aratani, Masaru Takada, Satoru Niwata, Takeshi Shimogiri, Hiroshi Yasue, Kirei Yasuda, Yaetsu Kurosawa, Masahide Nishibori
Organizer
PAG in Asia 2017
Place of Presentation
Seoul, KOREA
Year and Date
2017-05-29 – 2017-05-31
Int'l Joint Research
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[Presentation] Morphological and molecular phylogenetics analysis of Ryukyu wild boar2016
Author(s)
Keiko Takeuchi, Shuichi Hamada, Tomomi Aratani, Maho Ito, Yaetsu Kurosawa, Masaru Takada, Satoru Niwata, Takeshi Shimogiri, Shin Watanabe, Hiroshi Yasue, Masahide Nishibori
Organizer
The 17th Asian-Australasian Association of Animal Production Society Animal Science Congress
Place of Presentation
Hakata, Fukuoka, Japan
Year and Date
2016-08-22 – 2016-08-25
Int'l Joint Research
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[Presentation] Origin of a porcine SNP of prolactin receptor gene2016
Author(s)
Tomomi Aratani, Keiko Takeuchi, Shuichi Hamada, Yaetsu Kurosawa, Satoru Niwata, Takeshi Shimogiri, Hiroshi Yasue, Masahide Nishibori
Organizer
The 17th Asian-Australasian Association of Animal Production Society Animal Science Congress
Place of Presentation
Hakata, Fukuoka, Japan
Year and Date
2016-08-22 – 2016-08-25
Int'l Joint Research
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[Presentation] tudy on domestication process of Asian Junglefowls2016
Author(s)
Yuto Kurosawa, Sayed A.-M. Osman, Yoshio Yamamoto and Masahide Nishibori
Organizer
The 17th Asian-Australasian Association of Animal Production Society Animal Science Congress
Place of Presentation
Hakata, Fukuoka, Japan
Year and Date
2016-08-22 – 2016-08-25
Int'l Joint Research
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