2016 Fiscal Year Annual Research Report
The attempt of new molecular therapy for esophageal cancer using the analysis of regulation concerning genome and epigenome
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26293298
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
松原 久裕 千葉大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (20282486)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 教授 (00192500)
阿久津 泰典 千葉大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (00375677)
村上 健太郎 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (40436382)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 外科 / 癌 / 遺伝子 / トランスレーショナルリサーチ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
予後不良の消化器癌である食道癌に関し、手術標本、郭清リンパ節、内視鏡生検検体から次世代シーケンサーを利用した全ゲノムシークエンスおよびエクソームシークエンスを行い、食道癌における原発巣およびリンパ節転移における遺伝子配列とその変異を明らかにする。これまで多施設での食道癌抗癌剤治療効果遺伝子診断キットの開発研究によりDNAマイクロアレイ解析を行っており、これら遺伝子群を中心に解析を進める。同時にヒストンのアセチル化、miRNAなどエピジェネティクス制御についても解明することにより、癌転移機構の解明および抗がん剤、放射線治療感受性について解明し、個々の状態にあった適切な治療を行う個別化医療の一助となる新たな分子、その制御について明らかにすることにより新たな分子治療を提案する。
食道癌切除標本および同一標本における正常食道粘膜から抽出したDNAそれぞれの全ゲノム配列を決定した。食道扁平上皮癌におけるエクソームシーケンスにより、これまでTP53遺伝子をはじめとする遺伝子変異が報告されているが、今回の解析においてもTP53の変異が最多であり８０％を超える極めて高い頻度であった、次いでZNF750に変異が多いことを確認した。
アレル特異的発現について、Loss of Heterozygosityの影響を排除するためにCopy number variationの解析を追加し、食道扁平上皮癌においてはそれぞれの変異位置においてDNAとRNAの変異アレルの検出頻度を比較すると、多くの症例で変異をもつアレルが優位に発現していることを解明し、食道癌細胞ではアレル特異的な遺伝子発現が存在し、さらに癌の発生、維持に有利な遺伝子変異をもつアレルを発現している細胞が選択されている可能性が示唆された。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Fra-1 Regulates the Expression of HMGA1, Which is Associated with a Poor Prognosis in Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma.2016
Author(s)
Toyozumi T, Hoshino I, Takahashi M, Usui A, Akutsu Y, Hanari N, Murakami K, Kano M, Akanuma N, Suitoh H, Matsumoto Y, Sekino N, Komatsu A, Matsubara H.
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Journal Title
Ann Surg Oncol.
Volume: Nov 23.[Epubahead of print]
Pages: Epub
Peer Reviewed
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[Journal Article] Quantification of plasma exosome is a potential prognostic marker for esophageal squamous cell carcinoma.2016
Author(s)
Matsumoto Y, Kano M, Akutsu Y, Hanari N, Hoshino I, Murakami K, Usui A, Suito H, Takahashi M, Otsuka R, Xin H, Komatsu A, Iida K, Matsubara H.
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Journal Title
Oncol Rep.
Volume: 36
Pages: 2535-2543
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Heterogeneity of Glucose Metabolism in Esophageal Cancer Measured by Fractal Analysis of Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography Image: Correlation between Metabolic Heterogeneity and Survival.2016
Author(s)
Tochigi T, Shuto K, Kono T, Ohira G, Tohma T, Gunji H, Hayano K, Narushima K, Fujishiro T, Hanaoka T, Akutsu Y, Okazumi S, Matsubara H.
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Journal Title
Dig Surg.
Volume: Dec 9. [Epub ahead of print]
Pages: Epub
Peer Reviewed
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[Presentation] Analysis of allele specific expression in esophageal squamous cell carcinoma with combination of exome sequencing and mRNA sequencing2017
Author(s)
Masahiko Takahashi, Hirofumi Nakaoka, Naoyuki Hanari, Kentaro Murakam, Masayuki Kano, Yasunori Matsumoto, Ryota Otsuka, Nobufumi Sekino, Masaya Yokoyama, Itsuro Inoue, Hisahiro Matsubara
Organizer
AACR Precision Medicine Series: Opportunities and Challenges of Exploiting Synthetic Lethality in Cancer
Place of Presentation
San Diego, California, USA
Year and Date
2017-01-04 – 2017-01-07
Int'l Joint Research
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[Presentation] Usefulness of exosome quantification by cholesteryl ester transfer protein activity as a biomarker for human esophageal squamous cell carcinoma (ESCC)2016
Author(s)
Yasunori Matsumoto, Masayuki Kano, Yasunori Akutsu, Naoyuki Hanari, Isamu Hoshino, Kentaro Murakami, Akihiro Usui, Hiroshi Suito, Masahiko Takahashi, Ryota Otsuka, Hisahiro Matsubara
Organizer
AACR Annual Meeting 2016
Place of Presentation
New Orleans, Louisiana, USA
Year and Date
2016-04-16 – 2016-04-20
Int'l Joint Research
