2017 Fiscal Year Annual Research Report
Verification of possible iatrogenic epimutations by artificial reproductive technologies.
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26293365
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| Research Institution | National Center for Child Health and Development |
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Principal Investigator |
秦 健一郎 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 周産期病態研究部, 部長 (60360335)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | エピゲノム / DNAメチル化 / 生殖補助医療 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
生殖補助医療に伴う医原性エピゲノム変異（変化）は、発生に重篤な影響を与えるインプリンティング遺伝子制御領域や、その他の遺伝子のプロモーター領域よりもむしろ、遺伝子発現に影響を与えない領域のランダムなDNAメチル化変化の方が、流産などで淘汰されずに出生児でも遺残している可能性がある。そこで、マイクロアレイ技術を用いた網羅的DNAメチル化解析（主にプロモーター領域を中心）とともに、次世代シークエンサーを駆使した網羅的DNAメチル化解析手法の確立を進め、Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)法を用いた全ゲノム網羅的DNAメチル化解析手技を行った。RRBS法は、制限酵素処理によりCpGアイランド領域を濃縮し、およそ８割をカバーする一方で、全ゲノムバイサルファイトシークエンスと比較すると格段に低コストで、全ゲノム領域のDNAメチル化解析を行うことができる。培養条件を変えたマウス初期胚を用い、RRBS法による全ゲノム領域網羅的DNAメチル化シークエンスを行った。我々が本研究立案時に予測した通り、現在までのところ、エピゲノム変化の起きやすいホットスポットは見当たらず、ランダムな変異が観察された。また、ヒト胎盤と同一個体の臍帯血を比較したところ、胎盤は正常発生であってもDNAメチル化状態の「ばらつき」が大きく、発生過程の環境ストレスに伴うDNAメチル化異常の検証により適していると考えられた。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] The DNA methylation profile of liver tumors in C3H mice and identification of differentially methylated regions involved in the regulation of tumorigenic genes.2018
Author(s)
Matsushita J, Okamura K, Nakabayashi K, Suzuki T, Horibe Y, Kawai T, Sakurai T, Yamashita S, Higami Y, Ichihara G, Hata K, Nohara K
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Journal Title
BMC Cancer
Volume: 18
Pages: 317
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] CTCF deletion syndrome: clinical features and epigenetic delineation.2017
Author(s)
Hori I, Kawamura R, Nakabayashi K, Watanabe H, Higashimoto K, Tomikawa J, Ieda D, Ohashi K, Negishi Y, Hattori A, Sugio Y, Wakui K, Hata K, Soejima H, Kurosawa K, Saitoh S
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Journal Title
J Med Genet
Volume: 54
Pages: 836-842
DOI
Peer Reviewed
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