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2014 Fiscal Year Annual Research Report

日本で発生しうる輸入感染症予見を目的としたスペインにおける下水中病原微生物の同定

Research Project

Project/Area Number 26303011
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

佐野 大輔  北海道大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (80550368)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大村 達夫  東北大学, 学内共同利用施設等, 教授 (30111248)
片山 浩之  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (00302779)
石井 聡  北海道大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (10612674)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsスペイン / 下水 / 病原ウイルス / 病原細菌
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、歴史上の繋がりから欧州連合における中南米の国々との窓口の立場にあり、魚介類等を大量に輸入しているスペインに着目し、スペイン国内の下水処理場で得られた下水中の病原微生物を網羅的にモニタリングし、将来の日本において発生しうる輸入感染症を予見するための知見を得ることを目的としている。研究初年度である平成26年度は、下水からのウイルス及びバクテリアの同時回収手法の開発、及びスペイン国内でのサンプリングを行った。
下水からのウイルス及びバクテリアの同時回収手法の開発では、ポリエチレングリコール沈殿法を採用し、試験細菌及びウイルスであるPseudogulbenikania sp. NH8B_3960tnp及びマウスノロウイルスを同時に回収することが可能であることが確認された。さらに、同手法を日本国内で得られた下水サンプルに適用し、複数種細菌・ウイルス同時検出を行ったところ、アイチウイルス、アストロウイルス、エンテロウイルス、A型肝炎ウイルス、ノロウイルス、ロタウイルス、サポウイルス、病原性大腸菌及びウェルシュ菌に由来する遺伝子が高頻度に検出されたことから、本研究で確立した細菌・ウイルス同時回収・検出技術が実用可能であることが確かめられた。
スペインには計2回訪問し、研究協力者であるAlbert Bosch教授の協力を得て、サンプリングを行った。その結果、下水濃縮サンプル、食中毒患者由来サンプル、及び食中毒原因食品サンプルを得ることができた。
次年度以降、得られたサンプル中に含まれる病原体の検出を行い、遺伝子配列解析を進める予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初予定通りに手法開発及びサンプリングが進められており、今後の解析をスムーズに進めることが可能な態勢を構築することができた。

Strategy for Future Research Activity

平成27年5月にバルセロナ大学を訪問し、研究協力者であるAlbert Bosch教授の研究室で、サンプルからの遺伝子抽出作業を行う。抽出した遺伝子サンプルは日本へ郵送し、解析を進める予定である。これらは当初計画通りである。

Causes of Carryover

本研究の成果発表を平成27年度開催の国際学会で行うことになったため、その旅費を確保するために繰り越した。

Expenditure Plan for Carryover Budget

第18回健康関連水中微生物国際シンポジウム(9月13日~19日)に参加するための旅費・宿泊費・登録料として使用。

  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (7 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Molecular epidemiology of noroviruses detected in Nepalese children with acute diarrhea between 2005 and 2011: increase and predominance of minor genotype GII.132015

    • Author(s)
      Thi Nguyen Hoa-Trana, Toyoko Nakagomi, Daisuke Sano, Jeevan B. Sherchand, Basu D. Pandey, Nigel A. Cunliffe, Osamu Nakagomi
    • Journal Title

      Infection, Genetics and Evolution

      Volume: 30 Pages: 27-36

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2014.12.003

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Water quality monitoring and risk assessment by simultaneous multi-pathogen quantification2014

    • Author(s)
      Satoshi Ishii, Takamitsu Nakamura, Shuji Ozawa, Ayano Kobayashi, Daisuke Sano, Satoshi Okabe
    • Journal Title

      Environmental Science and Technology

      Volume: 48(9) Pages: 4744-4749

    • DOI

      10.1021/es500578s

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 左側打切りデータに対するMAP推定の適用2015

    • Author(s)
      加藤毅、岡部聡、佐野大輔
    • Organizer
      第49回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] ハイブリダイゼーション法を用いた下水中のウイルスゲノム回収手法の開発2015

    • Author(s)
      勝又雅博,真砂佳史,原田秀樹,大村達夫
    • Organizer
      第49回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 下水中のポリA鎖を有するウイルスゲノムの選択的増幅手法の検討2015

    • Author(s)
      風間しのぶ,真砂佳史,大村達夫
    • Organizer
      第49回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] Bayesian modeling of virus removal efficiency in wastewater treatment processes2014

    • Author(s)
      Tsuyoshi Kato, Satoshi Okabe and Daisuke Sano
    • Organizer
      IWA World Water Congress 2014
    • Place of Presentation
      Lisboa Congress Centre, Lisbon, Portugal
    • Year and Date
      2014-09-21 – 2014-09-26
  • [Presentation] 異なる測定限界における切断分布のベイズ推定の適用2014

    • Author(s)
      加藤毅、岡部聡、佐野大輔
    • Organizer
      第17回日本水環境学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      滋賀県立大学
    • Year and Date
      2014-09-08 – 2014-09-09
  • [Presentation] Estimation of quantitative relationships between pathogens and indicator microorganisms in water using left-censored data2014

    • Author(s)
      Daisuke Sano, Tsuyoshi Kato, Ayano Kobayashi, Toshihiro Ito, Satoshi Ishii and Satoshi Okabe
    • Organizer
      4th Food and Environmental Virology Conference
    • Place of Presentation
      Ionian Academy, Corfu town, Greece
    • Year and Date
      2014-09-02 – 2014-09-05
  • [Presentation] Quantification of multiple enteric viruses from environmental water samples by using microfluidic quantitative PCR2014

    • Author(s)
      Satoshi Ishii, Gaku Kitamura, Ayano Kobayashi, Takayuki Miura, Daisuke Sano and Satoshi Okabe
    • Organizer
      ASM2014
    • Place of Presentation
      Boston Convention & Exhibition Center, Boston, MA, USA
    • Year and Date
      2014-05-17 – 2014-05-20
  • [Book] 第4章 ウイルス 2各論 4ウイルス別検査法(8)糞便系ファージ 食品衛生検査指針 微生物編2015

    • Author(s)
      片山浩之
    • Total Pages
      731-740
    • Publisher
      公益社団法人日本食品衛生協会

URL: 

Published: 2016-06-01  

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