2015 Fiscal Year Research-status Report
ネットワークの階層性を利用した遺伝子ネットワークの同定精度改善に関する研究
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26330275
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| Research Institution | Tottori University |
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Principal Investigator |
木村 周平 鳥取大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (20342777)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 遺伝子ネットワーク同定 / 階層構造 / 疑似焼きなまし法 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ネットワークの階層構造を利用することで，遺伝子ネットワーク同定の精度を改善する方法を開発した．ブートストラップ法と従来の遺伝子ネットワーク同定法を組み合わせた方法から推定される遺伝子間相互作用の自信度と，階層構造推定結果から求められる遺伝子間相互作用の自信度を単純に組み合われることで，推定した遺伝子間相互作用の精度を僅かに改善することに成功した．本研究の成果は国際会議the 2015 International Joint Conference on Neural Networksにて口頭発表及び論文発表を行った（S.Kimura and M.Okada-Hatakeyama: Improvement of Reliabilities of Regulations using a Hierarchical Structure in a Genetic Network, Proc. of the 2015 International Joint Conference on Neural Networks, 485-491, 2015）．また論文誌にて論文発表を行った（S.Kimura, M.Tokuhisa and M.Okada-Hatakeyama: Genetic Network Inference using Hierarchical Structure, Frontiers in Physiology, 7, 57 (12 pages), 2016）．さらに2015年6月29日に東京台場の産業技術総合研究所にて開催された，第１回理化学研究所・産業技術総合研究所共同シンポジウム「ビッグデータとビッグシミュレーションによる生命医科学の未来」において「階層構造を利用した遺伝子ネットワーク」というタイトルでポスター発表を行った．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
遺伝子ネットワークの同定精度を，階層構造を利用して改善する方法の開発を行うことができた．ただし単純に階層構造推定の結果を導入しただけでは，精度の改善がわずかであることが判明した．
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| Strategy for Future Research Activity |
前述したように，単純に階層構造推定の結果を導入しただけでは，精度の改善がわずかであることが判明した．そのため今後は，階層構造推定結果をより知的に利用する方法を開発する予定である．具体的にはブートストラップ法によって得られる相互作用の自信度と，階層構造推定によって得られる相互作用の自信度を非線形に組み合わせ，その重みパラメータを最適化技術によって推定する手法を開発する予定である．
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| Causes of Carryover |
論文投稿料（約１７万円）を共著者の別予算で賄うことが出来たため．
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
一部自費を考えていた今年度の出張旅費に充てる予定である．
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