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2014 Fiscal Year Research-status Report

生物はなぜ振動・同期するのか-酵母細胞における解糖系振動現象の生命機能の解明-

Research Project

Project/Area Number 26330326
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

雨宮 隆  横浜国立大学, 環境情報研究科(研究院), 教授 (60344149)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 伊藤 公紀  横浜国立大学, 環境情報研究科(研究院), 教授 (40114376)
山口 智彦  独立行政法人産業技術総合研究所, 機能化学研究部門, 首席研究員 (70358232)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords細胞 / 解糖系 / 振動反応 / 同期現象 / 生命機能
Outline of Annual Research Achievements

本研究では,生命活動において振動や同期現象が広く見られるのはなぜかを明らかにすることを目的としている。本研究では,全ての生物が行う解糖反応に着目し,特に酵母細胞を研究対象として,解糖系の振動・同期現象の生命機能について,本年度は,酵母細胞が解糖反応を振動させる生命機能について研究した。
振動状態と定常状態の生命機能を比較するためには,同一の条件下における2つの状態の生命機能を比較する必要がある。双安定状態が見出されれば,同一条件下における定常的解糖反応と振動的解糖反応のエネルギー獲得効率を比較することができる。そこで,解糖系振動反応の7変数数理モデルの分岐解析を行い双安定性を見出した。この双安定状態において,ATPおよびピルビン酸の単位時間(1周期)当たりの生成量を計算すると,振動状態の方が定常状態よりもエネルギー獲得効率(単位時間当たりの生成量)が6~8%程度大きいことを明らかにした。すなわち,単一細胞では,定常的な解糖反応よりも振動的な解糖反応の方が,時間効率が高いことを明らかにした。
また,細胞集団の同期的解糖反応の生命機能を研究するために,まず,細胞集団の振動挙動を単一細胞レベルで観測可能な実験システム(倒立顕微鏡システム)を立ち上げ,単一細胞の解糖系振動を観測できることを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

単一細胞レベルの解糖系振動反応の生命機能については,数理モデルを用いて解析を行い,振動的解糖反応が定常的解糖反応よりもエネルギーや物質生産の時間効率が高いことを示すことができた。さらに,細胞集団の同期的振動状態を単一細胞レベルで観測可能な実験系を立ち上げ,単一細胞の解糖系振動反応を測定することができたため。

Strategy for Future Research Activity

細胞集団における同期的解糖系振動反応を実験的に観測することを第一に進める。すなわち,同期現象の細胞密度依存性について,前年度までに立ち上げた実験系を用いて検討を行う。特に,同一の細胞密度であっても,空間的な分散状態や集合状態が,個々の細胞の振動反応や細胞集団の同期現象に影響を及ぼすことが考えられるため,そのような状態を制御できるシステムの構成も併せて進める。実験データが得られた後に,数理モデルを用いて細胞同士のカップリングによって,個々の細胞の振動状態やエネルギー獲得効率がどのように変化するかについて検討を行う。

Causes of Carryover

国際会議の旅費として使用を計画していたが,都合により参加できなくなったため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

H27年度7月に開催予定の海外で開催の研究会の旅費として使用予定。

  • Research Products

    (10 results)

All 2014

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Glycolytic synchronization in yeast cells via ATP and other metabolites: Mathematical analyses by two-dimensional reaction-diffusion models2014

    • Author(s)
      Serizawa, H., Amemiya, T., Itoh, K.
    • Journal Title

      Natural Science

      Volume: 6 Pages: 719-732

    • DOI

      10.4236/ns.2014.610072

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 癌細胞における解糖系振動反応2014

    • Author(s)
      雨宮 隆
    • Journal Title

      信学技報

      Volume: 114 Pages: 21-23

  • [Presentation] Glycolytic oscillations in yeast and cancer cells2014

    • Author(s)
      Amemiya, T.
    • Organizer
      24th Annual Meeting of MRS-Japan 2014
    • Place of Presentation
      横浜市開港記念会館(横浜)
    • Year and Date
      2014-12-10 – 2014-12-12
    • Invited
  • [Presentation] 酵母解糖系における振動反応の時空間制御2014

    • Author(s)
      平松直樹,柴田賢一,伊藤公紀,山本哲也,山口智彦,雨宮隆
    • Organizer
      第24回非線形反応と協同現象研究会
    • Place of Presentation
      東京電気大学(千住)
    • Year and Date
      2014-12-06 – 2014-12-06
  • [Presentation] 酵母マイクロカプセル化における解糖系振動反応の酵母間相互作用の解析2014

    • Author(s)
      小長谷耕平,柴田賢一,伊藤公紀,瀧ノ上正浩,雨宮隆
    • Organizer
      第24回非線形反応と協同現象研究会
    • Place of Presentation
      東京電気大学(千住)
    • Year and Date
      2014-12-06 – 2014-12-06
  • [Presentation] 酵母におけるG0細胞周期と解糖系振動反応の関連性の解析2014

    • Author(s)
      伊藤良洋,柴田賢一,伊藤公紀,雨宮隆
    • Organizer
      第24回非線形反応と協同現象研究会
    • Place of Presentation
      東京電気大学(千住)
    • Year and Date
      2014-12-06 – 2014-12-06
  • [Presentation] 酵母解糖系振動反応を利用したバイオアッセイの検討2014

    • Author(s)
      飯塚一歩,柴田賢一,伊藤公紀,雨宮隆
    • Organizer
      第24回非線形反応と協同現象研究会
    • Place of Presentation
      東京電気大学(千住)
    • Year and Date
      2014-12-06 – 2014-12-06
  • [Presentation] 癌細胞における解糖系振動反応2014

    • Author(s)
      雨宮 隆
    • Organizer
      電気情報通信学会 有機エレクトロニクス
    • Place of Presentation
      奄美大島商工会議所(鹿児島)
    • Year and Date
      2014-11-28 – 2014-11-29
  • [Presentation] Cell-to-cell communication in yeasts via ATP2014

    • Author(s)
      Amemiya, T.
    • Organizer
      IUMRS-ICA2014
    • Place of Presentation
      福岡大学(福岡)
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-30
    • Invited
  • [Presentation] Metabolic network and glycolytic oscillations in yest and other cells2014

    • Author(s)
      Amemiya, T., Miyata, T., Hiramatsu, N., Shibata, K., Itoh, K.
    • Organizer
      Gordon Research Conference, Oscillations & Dynamic Instabilities in Chemical Systems
    • Place of Presentation
      Girona, Spain
    • Year and Date
      2014-07-13 – 2014-07-18

URL: 

Published: 2016-05-27  

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