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2015 Fiscal Year Research-status Report

耐冷性炭化水素分解菌の分解遺伝子解明及び植物成長促進根圏菌の多面的機能解析

Research Project

Project/Area Number 26340067
Research InstitutionMuroran Institute of Technology

Principal Investigator

チャン ヨンチョル  室蘭工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (30422025)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords寒冷地 / 炭化水素 / アルキルフェーノル / Penicillium / DGGE / gene
Outline of Annual Research Achievements

Penicillium sp. CHY-2株による炭化水素類化合物の分解特性の評価を行ったところ、CHY-2株は炭素数C10を特に分解した。また、デカンを指標として最適な分解条件の検討を行ったところ、グルコース1 g/L、pH6、Tween 80有りの培養条件でCHY-2株がデカンを効果的に分解することが分かった。さらに、CHY-2株は模擬汚染土壌中で効果的に4-tert-ブチルフェノールを分解するということが明らかになった。試供石油系炭化水素化合物(ブチルシクロヘキサン、エチルベンゼン、ブチルベンゼン、アセナフテン、2.2.4-トリメチルペンタン、オクタン、デカン、ドデカン、ナフタレン)を供した条件において、ギボウシとオダマキの耐性実験を行った結果、ギボウシは葉の変色がオダマキと比べて少なかった。そのため、微生物源としてギボウシの根圏土壌を選択した。また、ギボウシの根圏土壌菌の遺伝子解析による同定の結果、多様な細菌類及び真菌が根圏土壌に存在することが分かった。現在、20種類の菌株の同定を完了している。今回、細菌類を主に同定したため、真菌と植物の菌根共生も踏まえ、今後さらに真菌類の同定を進める必要があると考えられる。一方、アルキルフェーノル類や石油系炭化水素化合物の分解に関与する根圏微生物を特定するため、単離菌株を用いた分解実験を行う方針である。H27年度の報告においてCHY-2株の分解に関与する遺伝子としてバニリルアルコールオキシダーゼを挙げたが、部分精製した細胞外分泌酵素を用いた実験でもバニリルアルコールオキシダーゼの酵素活性を確認することができたため、バニリルアルコールオキシダーゼ遺伝子が分解に関与している可能性が示唆された。さらに、CHY-2株の培養液を用いた酵素精製実験の結果、リグニンペルオキシダーゼを精製することができたため、リグニンペルオキシダーゼコード遺伝子も分解に関与している可能性が高い。現在、精製酵素の諸性質を詳細に検討している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

H27年度研究目的であった分解遺伝子の解明、植物と微生物の分解における相関関係の解明に関する実験が進展している。特に、ギボウシの根圏土壌菌の遺伝子解析を駆使して、多様な細菌類及び真菌が根圏土壌に存在することを確認し、さらに20種類の菌株及び10種類のカビの同定を完了するなど研究の進展が見られた。

Strategy for Future Research Activity

分解関与遺伝子の同定を中心テーマとして研究を推進する。アメリカ国立医学図書館付属国立生物工学情報センターのヌクレオチド検索機能を用いて、炭化水素分解菌(寒冷型および非寒冷型分解菌)の遺伝子の塩基配列を得る。これらから選別して炭化水素分解遺伝子の塩基配列に基づいたプライマーを設計する。その後、遺伝子のクローニングを行う。一方、分解遺伝子の解明に必要な全ゲノム解析は次世代シーケンサーを保有していないため、他機関や大学の分析設備を利用して行う予定であるが、うまく遂行できない場合は外部に依頼し速やかに研究が進むように努力する。また、H27年度研究結果を基に根圏土壌中の細菌単独もしくは菌類との組合せによる分解促進効果を検証していく。特に分解に関与する微生物を特定することに力を注ぐ予定である。

  • Research Products

    (23 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Acknowledgement Compliant: 8 results,  Open Access: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Degradation of toxic compounds at low and medium temperature conditions using isolated fungus2016

    • Author(s)
      Young-Cheol Chang, Soichiro Fuzisawa, M. Venkateswar Reddy, Hikari Kobayashi, Eri Yoshida, Yuka Yajima, Tamotsu Hoshino, DuBok Choi
    • Journal Title

      CLEAN-Soil, Air, Water

      Volume: なし

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Production of poly-3-hydroxybutyrate (P3HB) and poly-3-(hydroxybutyrate-co-hydroxyvalerate) P(3HB-co-3HV) from synthetic wastewater using Hydrogenophaga palleronii2016

    • Author(s)
      M. Venkateswar Reddy, Yasuteru Mawatari, Yuka Yajima, Kohki Satoh, S. Venkata Mohan, Young-Cheol Chang
    • Journal Title

      Bioresource Technology

      Volume: なし

    • DOI

      10.1016/j.biortech.2016.03.025

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Antihyperglycemic and antioxidant activities of polysaccharide produced from Pleurotus ferulae in streptozotocin-induced diabetic rats2016

    • Author(s)
      Dubok Choi, YuLan Piao, Sun-Jong Yu, Yeon-Woong Lee, Dong-Hoon Lim, Young-Cheol Chang, Sang-Shin Park, Myung-Koo Lee, Wol-Suk Cha, Don-Sang You, Hoon Cho
    • Journal Title

      Korean J. Chem. Eng.

      Volume: なし

    • DOI

      10.1007/s11814-016-0007-8

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Isolation of Bacillus sp. strains capable of decomposing alkali lignin and their application in combination with lactic acid bacteria for enhancing cellulase performance2015

    • Author(s)
      Young-Cheol Chang, DuBok Choi, Kazuhiro Takamizawa, Shintaro Kikuchi
    • Journal Title

      Bioresource Technology

      Volume: 152 Pages: 429-436

    • DOI

      10.1016/j.biortech.2013.11.032

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Bio-augmentation of Cupriavidus sp. CY-1 into 2,4-D contaminated soil: microbial community analysis by culture dependent and independent techniques2015

    • Author(s)
      Young-Cheol Chang, M. Venkateswar Reddy, Honoka Umemoto, Yuki Sato, Mi-Hye Kang, Yuka Yajima, Shintaro Kikuchi
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: なし

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0145057

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Degradation and conversion of toxic compounds into useful bioplastics by Cupriavidus sp. CY-1: Relative expression of PhaC gene under phenol and nitrogen stress2015

    • Author(s)
      Motakatla Venkateswer Reddy , Yuka Yajima, Yasuteru Mawatari, Tamotsu Hoshino, Young-Cheol Chang
    • Journal Title

      Green Chemistry

      Volume: 17 Pages: 4560-4569

    • DOI

      10.1039/C5GC01156F

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Poly-3-hydroxybutyrate (PHB) production from alkylphenols, mono and poly-aromatic hydrocarbons using Bacillus sp. CYR1: A new strategy for wealth from waste2015

    • Author(s)
      M. Venkateswar Reddy, Yasuteru Mawatari, Yuka Yajima, Chigusa Seki,Tamotsu Hoshino, Young-Cheol Chang
    • Journal Title

      Bioresource Technology

      Volume: 192 Pages: 711-717

    • DOI

      10.1016/j.biortech.2015.06.043

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Genome Sequence of Aquamicrobium sp. SK-2, A Polychlorinated Biphenyl-Utilizing Bacterium Isolated from Sewage Sludge2015

    • Author(s)
      Young-Cheol Chang, Ken Sawada, Eun-Sook Kim, Kweon Jung, and Shintaro Kikuchi
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: なし

    • DOI

      10.1128/genomeA.00439-15

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 南極由来の真菌Penicillium sp. CHY-2 株による4-ブチルフェノールの低温分解及びTween 80の効果に関する研究2015

    • Author(s)
      藤澤宗一郎, 小林 ひかり, 吉田 愛里, 大平 勇一, M. Venkateswar Reddy, チャンヨンチョル, 菊池 慎太郎
    • Journal Title

      土木工学会論文集G(環境)

      Volume: 71 Pages: 405-411

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Aquamicrobium sp. SK-2株由来Biphenyl分解酵素BphCの精製と分解特性2015

    • Author(s)
      菅原 豪人, 小山 大貴, 澤田 研, チャンヨンチョル, 菊池 慎太郎
    • Journal Title

      土木工学会論文集G(環境)

      Volume: 71 Pages: 413-419

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Characterization of Cupriavidus sp. CY-1 and its bio-augmentation into 2,4-D contaminated soil2016

    • Author(s)
      Honoka Umemoto, M. Venkateswar Reddy, Yuka Yajima, Young-Cheol Chang
    • Organizer
      JSED2016
    • Place of Presentation
      Muroran, Japan
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biodegradation of 4-butylphenol at low temperature conditions using the isolated fungi2016

    • Author(s)
      Soichiro Fuzisawa, Yuka Yajima, Young-Cheol Chang
    • Organizer
      JSED2016
    • Place of Presentation
      Muroran, Japan
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Purification and characteristics of a Biphenyl-degrading enzyme BphC from strain SK-22016

    • Author(s)
      Hideto Sugawara, Tatsuya Koike, Yuka Yajima, Ken Sawada, Young-Cheol Chang
    • Organizer
      JSED2016
    • Place of Presentation
      Muroran, Japan
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Metabolic control of benzaldehyde oxidoreduction reaction by Pseudomonas putida2016

    • Author(s)
      Ryohei Yanagawa, Young-Cheol Chang, Koji Uwai and Shintaro Kikuchi
    • Organizer
      JSED2016
    • Place of Presentation
      Muroran, Japan
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Aquamicrobium sp. SK-2株由来Biphenyl分解酵素BphCの精製と分解特性2015

    • Author(s)
      菅原 豪人, 小山 大貴, 澤田 研, チャンヨンチョル, 菊池 慎太郎
    • Organizer
      第52回環境工学フォーラム
    • Place of Presentation
      福島県, 郡山市
    • Year and Date
      2015-11-27 – 2015-11-29
  • [Presentation] 南極由来の真菌Penicillium sp. CHY-2 株による4-ブチルフェノールの低温分解及びTween 80の効果に関する研究2015

    • Author(s)
      藤澤宗一郎, 小林 ひかり, 吉田 愛里, 大平 勇一, M. Venkateswar Reddy, チャンヨンチョル, 菊池 慎太郎、
    • Organizer
      第52回環境工学フォーラム
    • Place of Presentation
      福島県, 郡山市
    • Year and Date
      2015-11-27 – 2015-11-29
  • [Presentation] Isolation and characterization of Cupriavidus sp. CY-1 and its bio-augmentation into 2,4-D contaminated soil: microbial community analysis by culture dependent and independent techniques2015

    • Author(s)
      Young-Cheol Chang, Honoka Umemoto, Soichiro Fuzisawa, Hideto Sugawara, M. Venkateswar Reddy, Yuka Yajima, Shintaro Kikuchi
    • Organizer
      EPAM2015
    • Place of Presentation
      Xiamen, China
    • Year and Date
      2015-10-30 – 2015-11-01
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Polyhydroxybutyrate (PHB) production with Cupriavidus sp. CY-1 using various toxic compounds: PhaC gene expression analysis under stress conditions2015

    • Author(s)
      M. Venkateswar Reddy, Young-Cheol Chang
    • Organizer
      EPAM2015
    • Place of Presentation
      Xiamen, China
    • Year and Date
      2015-10-30 – 2015-11-01
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] アルキルフェノール及び多環芳香族炭化水素を原料としたBacillus sp. CYR1株によるポリヒドロキシブチレート(PHB)の産生2015

    • Author(s)
      モタカトラ カテスワーレディ, 矢島 由佳, 張 ヨンチョル
    • Organizer
      第67回日本生物工学大会
    • Place of Presentation
      鹿児島県, 鹿児島市
    • Year and Date
      2015-10-26 – 2015-10-28
  • [Presentation] Concepts of Natural Type River-Rehabilitation and Outlook of River Ecosystem Restoration2015

    • Author(s)
      Young-Cheol Chang
    • Organizer
      Proceedings of International Conference: Communications for Safe Cities
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2015-10-07 – 2015-10-07
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 微生物工学研究室

    • URL

      http://www.mmm.muroran-it.ac.jp/~ychang/

  • [Remarks] 研究者データーベース

    • URL

      http://rd-soran.muroran-it.ac.jp/profile/ja.2GDBVy94mRvrKNMaBJdBnQ==.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ポリヒドロキシブチレートの製造方法及び該方法に利用される新規微生物2015

    • Inventor(s)
      チャン ヨンチョル
    • Industrial Property Rights Holder
      チャン ヨンチョル
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2015-117696
    • Filing Date
      2015-06-10

URL: 

Published: 2017-01-06  

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