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2014 Fiscal Year Research-status Report

生体分子間相互作用を網羅する新型1分子蛍光イメージング法の開発

Research Project

Project/Area Number 26390035
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

谷井 孝至  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (20339708)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 英明  東北大学, 学内共同利用施設等, 助教 (10552036)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords一分子イメージング / 蛍光観察 / FRET / ナノ構造
Outline of Annual Research Achievements

申請者らが開発した改良型のゼロモード導波路(ZMW)と、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)とを融合した新しいリアルタイム一分子蛍光イメージング法を開発することを目的として下記の実験に取り組んだ。
(1) ZMW内での1分子MB-FRET系の構築: 3'末端をCy3、5'末端をCy5で標識したMBを設計し、このMBをビオチン-アビジン結合を介してZMWに固定した。濃度を調整したMB溶液にZMW基板を浸漬し、各ZMWに連続的に励起光(波長550 nm)を照射したところ、ほぼすべての蛍光スポットで量子退色が観察された。これは個々のZMWに固定されたMBの分子数が1分子であったことを意味する。なお、設計通りにFRETをCy3からの蛍光であればFRETが生じていないのでMBが開環状態であることを、Cy5からの蛍光であればMBは閉環状態であることを意味する。室温で固定したMBの75%はCy5のみの蛍光を示し、残りの25%がCy3からの蛍光を示した。このことは、75%のMBで1分子FRETが生じ、残りの25%ではFRETが生じなかったことを意味する。
(2) FRET効率の測定: 設計したMBではCy3およびCy5からのどちらか一方のみからの蛍光だけが観測され、他方からの蛍光強度はほぼゼロであり、どちらか一方の色素からの蛍光が明瞭に観測された。研究開始前に懸念していたZMWの金属部への電荷移動によるFRET効率の低下は見られなかった。
(3) 相補的DNAとのハイブリゼーションによるMBの開環制御: MBとMBのヘアピン部と相補的なDNAとをハイブリだゼーションさせたところ、48%の1分子MBが開環し、24%が閉環したままで、残りの28%が不安定な挙動を示した。ある程度の有意差をもって人為的に1分子MBを開環させることに成功したが、さらなる制御性の向上が求められる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

・ZMW内への1分子MBの固定法を構築した。
・ZMWでの1分子MBからのFRET計測系を構築した。
・ZMWでの1分子MBからのFRET効率が高いことを実証した。
・相補的DNAとのハイブリダイゼーションによって1分子MBを人為的に開環させることに成功した。
・当初、平成27年度に実施を計画していた項目に前倒しで着手している。

Strategy for Future Research Activity

(1) ZMWの構造や材料を変えることによって、ZMW内でのFRET効率を精密に計測する。すでに、高効率で1分子MBからのFRETが計測できているが、より高い効率を達成できるか、また、従来他のグループから報告されていたZMW内でのFRET効率の低下が何に起因しているのかを調査する。

(2) ZMWをマウントした光学顕微鏡のステージに温度調節機構を付加することによって、リアルタイムに1分子MBを人為的に開閉環し、FRET効率の変化を計測できる計測系を構築する。

(3) 分子間相互作用のリアルタイム1分子蛍光観察モデルを構築する。具体的には、アプタマーとFRETとを融合させることや、1分子MBが1分子制限酵素によって切断される様子をリアルタイムに計測することお試みる。MBが切断させる瞬間と制限酵素がMBを切断する瞬間を捕捉することのデモンストレーションを実施し、開発している1分子MB-FRET系の実行可能性を示す。

Causes of Carryover


光学部品(ダイクロイックミラー)が当初の予定よりも安価に購入できたため。

Expenditure Plan for Carryover Budget


安価に購入した光学部品(ダイクロイックミラー)を安定して使用できるための消耗品(補強材)の購入に充当する。

  • Research Products

    (17 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Photopatterning Proteins and Cells in Aqueous Environment using TiO2 Photocatalysis2015

    • Author(s)
      H.Yamamoto, T.Demura, K.Sekine, S.Kono, M.Niwano, A.Hirano-Iwata, T.Tanii
    • Journal Title

      Journal of Visualized Experiments

      Volume: 104 Pages: e53045

    • DOI

      10.3791/53045

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Surface modification of cell scaffold in aqueous solution using TiO2 photocatalysis and linker protein L2 for patterning primary neurons2015

    • Author(s)
      K.Sekine, H.Yamamoto, S.Kono, T.Ikeda, A.Kuroda, T.Tanii
    • Journal Title

      e-Journal of Surface Science and Nanotechnology

      Volume: in press Pages: in press

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] In situ modification of cell-culture scaffolds by photocatalytic decomposition of organosilane monolayers2014

    • Author(s)
      H.Yamamoto, T.Demura, M.Morita, S.Kono, K.Sekine, T.Shinada, S.Nakamura, T.Tanii
    • Journal Title

      Biofabrication 6 (2014) 035021.

      Volume: 6 Pages: 0.5021

    • DOI

      doi:10.1088/1758-5082/6/3/035021

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] モレキュラービーコンを用いた1分子FRET計測系の構築2015

    • Author(s)
      和泉 聡志,大久保 幸太朗,櫛田 昂歳,山本 英明,谷井 孝至
    • Organizer
      第62回応用物理学会 春季学術講演会
    • Place of Presentation
      東海大学湘南キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-14
  • [Presentation] 有機シラン単分子膜パターン基板への接着差を用いた癌細胞の選別2015

    • Author(s)
      竹内祐子, 柿沼瑛介, 坂本留美, 山本英明, 佐藤裕子, 谷井孝至
    • Organizer
      第62回応用物理学会 春季学術講演会
    • Place of Presentation
      東海大学湘南キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-12
  • [Presentation] マイクロパターン神経細胞回路の活動様式に関する理論的考察2015

    • Author(s)
      千田雄大, 山本英明, 平野愛弓, 石原広識, 藤森壮也, 谷井孝至, 久保田繁, 庭野道夫
    • Organizer
      第62回応用物理学会春季学術講演会
    • Place of Presentation
      東海大学湘南キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-12
  • [Presentation] Computational modeling of the spontaneous activity in micropatterned neuronal networks2015

    • Author(s)
      Y. Chida, H. Yamamoto, A. Hirano-Iwata, K. Ishihara, S. Fujimori, T.Tanii, S. Kubota, M. Niwano
    • Organizer
      3rd RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • Place of Presentation
      Tohoku Univ.
    • Year and Date
      2015-02-18
  • [Presentation] In Situ Modification of Cell-Culture Scaffolds by Photocatalytic Decomposition of Organosilane Monolayers on Titanium Dioxide2014

    • Author(s)
      Sho Kono, Hideaki Yamamoto, Kohei Sekine, Takashi Tanii
    • Organizer
      The 5th International Symposium on Advanced Materials Development and Integration of Novel Structural Metallic and Inorganic Materials(2014)
    • Place of Presentation
      東京医科歯科大学
    • Year and Date
      2014-11-19
  • [Presentation] Adhesibility-Dependent Cell Sorting Using Organosilane Monolayer Template and Green-Tea Catechin2014

    • Author(s)
      Rumi Sakamoto, Eisuke Kakinuma, Yuko Takeuchi, Hideaki Yamamoto, Takashi Tani
    • Organizer
      The 5th International Symposium on Advanced Materials Development and Integration of Novel Structured Matellic and Inorganic Materials (AMDI-5) Conjunction with 6th IBB Frontier Symposium
    • Place of Presentation
      東京医科歯科大学
    • Year and Date
      2014-11-19
  • [Presentation] Optimization of micropattern geometry for long-term culture of isolated neurons and identification of excitatory-inhibitory cell types2014

    • Author(s)
      Hideaki Yamamoto, Sho Kono, Takatoshi Kushida, Ayumi Hirano-Iwata, Michio Niwano, Takashi Tanii
    • Organizer
      Neuroscience 2014
    • Place of Presentation
      the Walter E. Washington Convention Center
    • Year and Date
      2014-11-18
  • [Presentation] Fabrication of micropatterned substrate for live-cell, label free identification of excitatory-inhibitory neurons2014

    • Author(s)
      Sho Kono, Takatoshi Kushida, Hideaki Yamamoto, Takashi Tanii
    • Organizer
      The 7th International Symposium on Surface Science
    • Place of Presentation
      くにびきメッセ (島根県)
    • Year and Date
      2014-11-04
  • [Presentation] Surface modification in aqueous solution using TiO2 photocatalysis and a linker protain L2 for patterning primary neurons2014

    • Author(s)
      Kohei Sekine, Hideaki Yamamoto, Sho Kono, Takeshi Ikeda, Akio Kuroda, Takashi Tanii
    • Organizer
      The 7th International Symposium on Surface Science
    • Place of Presentation
      くにびきメッセ (島根県)
    • Year and Date
      2014-11-03
  • [Presentation] 有機シラン単分子膜パターン基板を用いたモジュール構造型培養神経回路の構築2014

    • Author(s)
      石原広識, 藤森壮也, 山本英明, 谷井孝至
    • Organizer
      第75回応用物理学会 秋季学術講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2014-09-19
  • [Presentation] ナノスリット導波路を用いた細胞内生体分子のリアルタイム蛍光イメージング2014

    • Author(s)
      大久保幸太朗, 櫛田昂歳, 和泉聡志, 山本英明, 谷井孝至
    • Organizer
      第75回応用物理学会 秋季学術講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2014-09-18
  • [Presentation] マイクロ加工基板を用いた興奮性/抑制性神経細胞判別法の開発2014

    • Author(s)
      河野翔, 櫛田昂歳, 山本英明, 谷井孝至
    • Organizer
      第37回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-09-13
  • [Presentation] Quantitative evaluation of cancer cell adhesion by functional substrate and optical interferometric technique2014

    • Author(s)
      Hiroshi Yoshikawa, Masami Suganuma, Takashi Tanii
    • Organizer
      The 12th Japan-Korea Joint Symposium on Cancer and Aging Research
    • Place of Presentation
      Saitama cancer center
    • Year and Date
      2014-06-19 – 2014-06-21
    • Invited
  • [Remarks] Molecular Nanoengineering Research

    • URL

      http://www.tanii.nano.waseda.ac.jp

URL: 

Published: 2016-05-27  

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