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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Development of novel techniques for single-molecule fluorescence imaging of various biomolecules

Research Project

Project/Area Number 26390035
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

谷井 孝至  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (20339708)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 英明  東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 助教 (10552036)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords1分子イメージング / 蛍光観察 / FRET / ZMW
Outline of Annual Research Achievements

ヒトの体内で重要な働きをするタンパク質の多くは、濃度を~μMにまで高めないと、効果的にリガンドと結合して特異的な機能を発現することができない。しかしながら、従来の1分子蛍光イメージング法では、このような高濃度条件下で目的の1分子だけを可視化することは不可能であった。そこで、改良型ゼロモード導波路(ZMW)と蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)とを融合した新しいリアルタイム1分子蛍光イメージングを開発することを目的として以下の実験を進めた。
(1)モレキュラービーコン(MB)を用いたDNA折り畳みの1分子蛍光イメージング: 平成26年度の成果(FRET効率が低下しないZMW構造設計)を基盤として問題点(MBの開閉制御性)の改良に取り組んだ。溶液を含ませたZMWの温度(室温~100℃)を構築し、制御温度に対するMBの開閉とFRET計測を行った。温度上昇に伴うFRET効率の低下が知られているが、1分子計測の問題になるほどではなかった。温度によるMB開閉の制御性について、ハイブリダイゼーションによる開閉制御性(平成26年度実施)に比して優位性は見られなかった。
(2)インフルエンザ由来のエンドヌクレアーゼがDNAに結合・DNAを切断・DNAから解離する素過程の1分子蛍光イメージング: ZMW内に固定した1本鎖DNAの末端とエンドヌクレアーゼとをそれぞれCy5とGFPとで蛍光標識し、2色の1分子蛍光イメージングを実施した。(1)で構築した温度制御系により、ZMWに固定されたDNAの切断に対する活性を1分子レベルで定量的に評価した。1本鎖DNA切断に伴い、GFP修飾エンドヌクレアーゼ由来の蛍光を検出することにも成功した。

  • Research Products

    (16 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] CNR(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      CNR
  • [Journal Article] Quantitative Evaluation of Cancer Cell Adhesion to Self-Assembled Monolayer-Patterned Substrates by Reflection Interference Contrast Microscopy2016

    • Author(s)
      T.Matsuzaki, K.Ito, K.Masuda, E.Kakinuma, R.Sakamoto, K.Iketaki, H.Yamamoto, M.Suganuma, N.Kobayashi, S.Nakabayashi, T.Tanii, H.Yoshikawa
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B 120 (2016) 1221

      Volume: 120 Pages: 1221-1227

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b11870

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Quantitative comparison of cancer and normal cell adhesion using organosilane monolayer templates: An experimental study on the anti-adhesion effect of green-tea catechins2016

    • Author(s)
      R.Sakamoto, E.Kakinuma, K.Masuda, Y.Takeuchi, K.Ito, K.Iketaki, T.Matsuzaki, S.Nakabayashi, H.Y.Yoshikawa, H.Yamamoto, Y.Sato, T.Tanii
    • Journal Title

      In Vitro Cell. Dev. Biol. - Animal 52 (2016) 799-805

      Volume: 52 Pages: 799-805

    • DOI

      10.1007/s11626-016-0049-6

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 光触媒作用を用いた液中表面改質による培養神経細胞の操作2016

    • Author(s)
      山本英明, 平野愛弓, 谷井孝至, 庭野道夫
    • Journal Title

      表面科学 37, 224-229 (2016)

      Volume: 37 Pages: 224-229

  • [Journal Article] Size-dependent regulation of synchronized activity in living neuronal networks2016

    • Author(s)
      H.Yamamoto, S.Kubota, Y.Chida, M.Morita, S.Moriya, H.Akima, S.Sato, A.Hirano-Iwata, T.Tanii, M.Niwano
    • Journal Title

      Phys. Rev. E 94 (2016) 012407

      Volume: 94 Pages: 012407

    • DOI

      10.1103/PhysRevE.94.012407

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Live-cell, label-free identification of GABAergic and non-GABAergic neurons in primary cortical cultures using micropatterned surface2016

    • Author(s)
      S.Kono, H.Yamamoto, T.Kushida, A.Hirano-Iwata, M.Niwano, T.Tanii
    • Journal Title

      PLOS ONE 11 (2016) e0160987

      Volume: 11 Pages: e0160987

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0160987

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] マイクロ加工表面を用いた培養神経回路のモジュール性制御2017

    • Author(s)
      井手 克哉, 山本 英明, 松村 亮佑, 谷井 孝至, 吉信 達夫, 庭野 道夫, 平野 愛弓
    • Organizer
      第64回応用物理学会春季学術講演会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜,横浜
    • Year and Date
      2017-03-16
  • [Presentation] モジュール構造型培養神経回路の計算論的モデリング2017

    • Author(s)
      山本 英明, 守谷 哲, 井手 克哉, 松村 亮佑, 秋間 学尚, 久保田 繁, 谷井 孝至, 佐藤 茂雄, 庭野 道 夫, 平野 愛弓
    • Organizer
      第64回応用物理学会春季学術講演会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜,横浜
    • Year and Date
      2017-03-14
  • [Presentation] 可視光応答酸化チタン薄膜の光触媒能を利用した細胞の液中パターニング2017

    • Author(s)
      古澤 昂平, 河野 翔, 藤城 翔偉, 山本 英明, 谷 井 孝至
    • Organizer
      第64回応用物理学会春季学術講演会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜,横浜
    • Year and Date
      2017-03-14
  • [Presentation] A computational study on spontaneous activity of a single neuron2017

    • Author(s)
      K. Hattori, S. Kono, H. Yamamoto, T. Tanii
    • Organizer
      The 5th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      2017-02-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] In situ modification of cell-culture scaffolds by photocatalysis of visible-light-responsible TiO2 film2017

    • Author(s)
      S. Kono, K. Furusawa, S. Fujishiro, H. Yamamoto, T. Tanii
    • Organizer
      The 5th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      2017-02-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Controlling modularity of cortical neuronal networks using micropatterned surfaces2017

    • Author(s)
      K. Ide, H. Yamamoto, R. Matsumura, T. Tanii, M. Niwano, A. Hirano-Iwata
    • Organizer
      The 5th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      2017-02-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Synchronization in neuronal networks with modular geometry2017

    • Author(s)
      H. Yamamoto, T. Tanii, S. Kubota, S. Sato, M. Niwano, A. Hirano-Iwata
    • Organizer
      The 5th RIEC International Symposium on Brain Functions and Brain Computer
    • Place of Presentation
      東北大学,仙台
    • Year and Date
      2017-02-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure-function Relationships in Living Neuronal Networks: a Surface Engineering Approach2016

    • Author(s)
      H. Yamamoto, A. Hirano-Iwata, T. Tanii, M. Niwano
    • Organizer
      10th Anniversary International Symposium on Nanomedicine (ISNM2016)
    • Place of Presentation
      産業技術総合研究所,つくば
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Invited
  • [Presentation] 有機単分子膜パターンにより細胞間接続を制御した2細胞神経回路の構築と解析2016

    • Author(s)
      河野 翔、藤森 壮也、山本 英明、谷井 孝至
    • Organizer
      第77回応用物理学会秋季学術講演会
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ,新潟
    • Year and Date
      2016-09-13
  • [Presentation] Spontaneous activity of cultured neuronal networks with defined numbers of neurons: a computational study2016

    • Author(s)
      H. Yamamoto, Y. Chida, A. Hirano-Iwata, T. Tanii, S. Kubota, M. Niwano
    • Organizer
      10th FENS Forum for Neuroscience
    • Place of Presentation
      Copenhagen, Denmark
    • Year and Date
      2016-07-05
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

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