• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2016 Fiscal Year Annual Research Report

Melt-like growth of protein crystals

Research Project

Project/Area Number 26390054
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

鈴木 良尚  徳島大学, 大学院理工学研究部, 准教授 (60325248)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤原 貴久  徳島大学, 大学院理工学研究部, 教務補佐員 (10648695)
佐藤 正英  金沢大学, 総合メディア基盤センター, 教授 (20306533)
佐崎 元  北海道大学, 低温科学研究所, 教授 (60261509)
勝野 弘康  立命館大学, 理工学部, 助教 (70377927)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords液液相分離 / 融液様成長 / リゾチーム / グリセロール / グルコースイソメラーゼ / 酵素活性
Outline of Annual Research Achievements

(具体的内容)1.遠心沈降濃縮によって誘起される液液相分離に関して、pHや溶液の状態によって、濃厚相の粘性が大きく変化することが分かった。最も高粘度のものは超純水中のもので、濃厚相に縫い針を立てると倒れない程度にまでなった。それに対して不凍液であるグリセロールが入ると、桁違いに粘度が下がり、流動性が復活した。2.超純水中で遠心沈降濃縮によって結晶化した、ニワトリ卵白リゾチーム(HEWL)斜方晶系結晶の構造解析をより詳細に行った結果、既に解明していたナトリウムイオンサイトの周辺部のほかに、活性部位の端に位置するASP101が、その付近にあるASN103との相互作用によって、塩析条件と超純水中で大きく位置を変化させることが分かった。活性部位のその他の部分がその他の部分がほとんど変わらないことから、このASP101の大きな変化が、塩濃度を少なくしていった時の酵素活性の増加の原因につながっているものと考えられる。3.グルコースイソメラーゼ結晶の構造をより詳細に解析したところ、不凍液の成分であるグリセロールが、活性部位にしっかり固定されていることが明らかになった。
(意義深い点)1.融液に近い超濃厚環境相の物性が、分子間相互作用の違いによってどのように変化するかをいろいろ試すことができる点。2.活性の増加と、分子構造の変化が直接議論できる点。3.フラッシュクーリングの為の不凍液により、有意な構造変化が誘起される可能性を見いだせた点。
(重要性)1.濃厚環境相の状態を個々の分子、溶媒の性質によって有意に制御できることが証明できた。2.酵素活性と分子構造変化の相関の一つが解明できた。3.フラッシュクーリングによって得られるメリットに対し、不凍液を添加することによるデメリットの一つを明らかにした。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Two mechanisms forming a comblike step pattern induced by a moving linear adatom source2017

    • Author(s)
      Masahide Sato, Hitoshi Miura, and Makio Uwaha
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 95 Pages: 032803-1-7

    • DOI

      DOI: 10.1103/PhysRevE.95.032803

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Effect of Direction of an External Force on Crystallization of Colloidal Particles in a V-Groove by Sedimentation2017

    • Author(s)
      Masahide Sato
    • Journal Title

      Japanese Journal of Applied Physics

      Volume: 55 Pages: 095601-1-5

    • DOI

      doi:10.7567/JJAP.55.095601

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Adsorption, Desorption, Surface Diffusion, Lattice Defect Formation, and Kink Incorporation Processes of Particles on Growth Interfaces of Colloidal Crystals with Attractive Interactions2016

    • Author(s)
      Yoshihisa Suzuki, Yoshiaki Hattori, Jun Nozawa, Satoshi Uda, Akiko Toyotama and Junpei Yamanaka
    • Journal Title

      Crystals

      Volume: 6 Pages: 80-1-11

    • DOI

      doi:10.3390/cryst6070080

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Two-dimensional Crystal Structure Formed by Two Components of DNA Nano- Particles on a Substrate2016

    • Author(s)
      Hiroyasu Katsuno, Yuya Maegawa, and Masahide Sato
    • Journal Title

      Journal of the Physical Society of Japan

      Volume: 85 Pages: 074605-1-5

    • DOI

      DOI:10.7566/JPSJ.85.074605

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] In-situ observation of crystal surfaces by optical miscroscopy2016

    • Author(s)
      Gen Sazaki, Ken Nagashima, Kenichiro Murata, and Yoshinori Furukawa
    • Journal Title

      Progress in Crystal Growth and Characterization of Materials

      Volume: 62 Pages: 408-412

    • DOI

      doi:10.1016/j.pcrysgrow.2016.04.024

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] In Situ Observation of Ice Crystal Surfaces by Advanced Optical Microscopy2016

    • Author(s)
      Gen Sazaki, Harutoshi Asakawa, Ken-ichiro Murata, Ken Nagashima, Shunichi Nakatsubo, and Yoshinori Furukawa
    • Organizer
      The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-11 – 2016-08-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Protein Crystallization by Slow Evaporation of Precipitant-free Solution in the Presence of Hydrochloric Acid2016

    • Author(s)
      Yoshihisa Suzuki, Takahisa Fujiwara, and Shoko Ueta
    • Organizer
      The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-10 – 2016-08-10
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Step velocities of glucose isomerase crystals in the presence of hen egg-white lysozyme in solution2016

    • Author(s)
      Takahisa Fujiwara, Daido Nakahashi, Shin-ichiro Yanagiya, and Yoshihisa Suzuki
    • Organizer
      The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-09 – 2016-08-09
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Relation between the period of protrusions in a comb-like step pattern and the velocity of adatom source moving in front of the step2016

    • Author(s)
      Masahide Sato, and Makio Uwaha
    • Organizer
      The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-09 – 2016-08-09
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Crystal lattice structure of two components of DNA nano particles on a substrate2016

    • Author(s)
      Yuya Maegawa, Hiroyasu Katsuno, and Masahide Sato
    • Organizer
      The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-08 – 2016-08-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effect of Direction of External Force on Crystallization of Colloidal Particles in a V-Groove in Sedimentation2016

    • Author(s)
      Masahide Sato
    • Organizer
      The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-08 – 2016-08-08
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi