2016 Fiscal Year Annual Research Report
Genetic linkage analysis and identification of obesity-related gene in LEA rat
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26430101
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| Research Institution | National Center for Global Health and Medicine |
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Principal Investigator |
岡村 匡史 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, 実験動物管理室長 (00333790)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ラットモデル / 抗肥満 / 次世代シークエンサー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
インスリン分泌不全型糖尿病モデルであるLEAラットは、先天的なインスリン不全に加え、腎尿細管上皮細胞が特異的に変性する為、腎性糖尿を発症する。さらに、コンジェニック系統を用いた解析から、LEAラットの第10染色体に腹腔内脂肪蓄積をコントロールする抗肥満遺伝子の存在が示唆されている。本研究の目的は、LEAラットに存在する抗肥満遺伝子を同定することである。
昨年度までに明らかになった候補領域D10rat34-D10rat77およびCtns-D10rat243（28.94Mb）内に存在する遺伝子変異を同定するため、次世代シークエンサーを用いてゲノム配列を解読したところ、合計210個（108遺伝子）の機能的に重要だと思われる遺伝子変異が同定できた。その遺伝子変異の中には嗅覚受容体の変異が73変異（33遺伝子）存在しており、それらを除外すると疾患候補遺伝子は75遺伝子であった。さらに、遺伝子の機能が著しく低下すると予想される、annotation impact が“high”である変異は3遺伝子のみであった。そのうち、肥満あるいはインスリン抵抗性と関連が予想される遺伝子は１つであり、その遺伝子はマイクロアレイ解析においても、コントロールに比べLEAラット肝臓では2倍以上発現量が低下していた。
本研究によりLEAラットに存在する抗肥満遺伝子の候補遺伝子を1つ同定した。この遺伝子の変異は、エクソン/イントロンジャンクションに1塩基が挿入されているため、スプライシングエラーにより機能が喪失していることが予想される。今後は、この候補遺伝子の機能解析を行うことにより、LEAラットの抗肥満メカニズムを解明すると共に、新たな創薬標的になり得るかを検討する予定である。
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[Journal Article] Proteomic Analysis of Serum Biomarkers for Pre-Diabetes Using the LEA Rat, a Spontaneous Animal Model of Type 2 Diabetes Mellitus.2017
Author(s)
Takahashi E, Hiroyuki Unoki-Kubota H, Yukiko Shimizu Y, Okamura T, Iwata W, Kajio H, Yamamoto-Honda R, Shiga T, Yamashita S, Tobe K, Okumura A, Matsumoto M, Yasuda K, Noda M and Kaburagi Y.
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 00
Pages: 27 March
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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