2015 Fiscal Year Research-status Report
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26430149
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
二宮 浩範 公益財団法人がん研究会, その他部局等, 研究員 (20462228)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
石川 雄一 公益財団法人がん研究会, その他部局等, その他 (80222975)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | EML4-ALK陽性 / chromothripsis / 腺扁平上皮癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
1. 染色体に特徴的なコピー数変化(chromothripsis)がみられた細胞株LC649のエクソンシークエンスを行った。 複数の遺伝子においてゲノムの断片化が示唆されたが（KCTD18, NAGK等）、ゲノム再構成を図示するのに必要なデータは得られなかった。
2. 解析対象を追加した際に、ALK染色陽性の腺扁平上皮癌が見出された。これまでに異なる２つの成分で融合遺伝子の確認された症例の報告はなく、EML4-ALK融合遺伝子の有無につき、break apart, fusion FISHを追加し、これを確認した。ALK免疫染色でも明らかに異なる組織成分として存在する腫瘍細胞で同時に陽性細胞がみられたことは、腺扁平上皮癌の成り立ち、今後扁平上皮癌を検索すべき対象とすべきかについての重要な治験になると考えられる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
エクソンシークエンスでは、染色体の断片化の結果おこる融合遺伝子の存在を示すことができず、EML4-ALKの生成メカニズムにこれが関与していることを証明できなかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
LC649細胞株および２番染色体コピー数変化の認められた外科切除検体において全ゲノムシークエンスを行い、全ゲノム上での遺伝子融合のマッピングを行い、そのメカニズムを明らかにする。
新しく見出された腺扁平上皮癌についても融合遺伝子の近傍のコピー数変化および増幅の有無について検索を行いたい。
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| Causes of Carryover |
細胞株検体でのエクソンシークエンス解析が中心であったため、検索対象を増やすことができず、研究に遅れが生じた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
細胞株検体LC649および切除検体でのNGSを行い、ゲノム再構成の存在の証明を行う。
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Research Products
(2 results)
