Nucleosome formation and chromatin dynamics in microsatellite DNA sequences

2016 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 26430186
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Genome biology
• Research Institution: Meisei University
• Principal Investigator: Shimizu Mitsuhiro 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
• Research Collaborator: KAGAWA Wataru 明星大学, 理工学部, 准教授 ; KURUMIZAKA Hitoshi 早稲田大学, 理工学術院, 教授 ; MUKAI Yukio 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 ; KATO Hiroaki 島根大学, 医学部, 助教 ; FUSE Tomohiro 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生 ; KATSUMATA Koji 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生 ; MOROHOSHI Koya 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生 ; KURIHARA Yohei 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生 ; TESHIGAHARA Yuta 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生 ; HAYASHI Toshiki 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生 ; IMAI Koshi 明星大学, 大学院・理工学研究科, 大学院生
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: ゲノム機能発現 / ヌクレオソーム / クロマチン / マイクロサテライト / 反復配列DNA / DNA構造 / 出芽酵母

Outline of Final Research Achievements

Microsatellites are simple repeated DNA sequences that occupy about 3% of the human genome. The purpose of this study is to elucidate the structural and dynamic features of the chromatin in microsatellite DNA sequences. We focused on the triplet-repeat and disease-related repeat sequences, and systematically examined their effects on nucleosome formation and gene expression. Furthermore, we predicted nucleosome formation on these repeat sequences by a bioinformatics analysis. We identified the structural properties of repeated sequences that promote or inhibit nucleosome formation. These results provide new insights into the biological implications of microsatellites within chromosomes.

Free Research Field

分子生物学、生化学