2015 Fiscal Year Research-status Report
頭蓋骨早期癒合疾患の次世代遺伝子一括診断システムの確立と治療標的分子の探索
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26430194
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| Research Institution | National Center for Child Health and Development |
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Principal Investigator |
要 匡 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, その他部局等, その他 (40264288)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ターゲットリシーケンス / 頭蓋骨早期癒合 / 全エクソーム解析 / 遺伝子パネル |
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| Outline of Annual Research Achievements |
H27年度は、次世代ターゲットリシーケンス解析、未同定疾患、全エクソーム解析に関して以下を行った。
１）頭蓋骨早期癒合症に関する次世代ターゲットリシーケンス解析系の構築と解析
オンラインメンデル遺伝カタログ（OMIM）登録の、頭蓋骨早期癒合を来す疾患の原因遺伝子および申請者の同定したOpitz三角頭蓋C症候群の遺伝子と類縁疾患Bohring-Opitz症候群の原因遺伝子とシグナル伝達に関連する遺伝子群を搭載したカスタムパネルを構築、遺伝子解析を施行した。69例の解析を行い、38例（55%）に対し変異を確認、検証できた。
２）未同定疾患の全エクソーム解析
三角頭蓋を呈し、CD96遺伝子、ASXL1遺伝子、FGFR1遺伝子のいずれにも変異を認めない症例について、全エクソーム解析（SeqCap EZ v3等使用によるHiSeq2500解読）を行った。マッピング、フィルタリングにより原因候補と思われる変異を抽出した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
H27年度は、頭蓋骨早期癒合症に関連した遺伝子パネルの構築を完了し、69例の検体について解析を行い、診断率が約55％であることが判明した。また、原因不明（遺伝子パネルにて遺伝子変異が同定できなかった）症例での全エクソーム解析により、候補と思われる遺伝子変異を抽出できた。よって、H27年度の予定は概ね達成されたと考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
H28年度は、１）次世代シーケンサを利用したターゲットリシーケンス解析系に関しては、さらに解析を行い、精度の算出および、遺伝子変異の傾向を探り、効率の良い遺伝子解析システムについて考察する。また、遺伝子変異と症状との関連について検討する。さらに、２）原因未同定疾患患児の全エクソーム解析については、抽出された遺伝子変異の妥当性について、同じ地域集団での頻度確認、変異機能解析等による検証を行う。
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| Causes of Carryover |
H27年度に申請者は異動し、ラボのセットアップ後、実験を再開した。前年度からの準備もあり、進捗に大きな遅れは生じていないが、H26年度からの繰り越しおよび研究費施行開始がずれたため、使用額の繰り越しが生じた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
H28年度は、ラボも稼働しており、滞りのない研究継続と速やかな研究費施行の開始により、計画を着実に実行する予定である。
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Research Products
(13 results)
