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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Structural and functional relationship of aqauporin-4 in brain

Research Project

Project/Area Number 26440024
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

谷 一寿  名古屋大学, 細胞生理学研究センター, 特任教授 (20541204)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords構造生理学 / 電子線結晶学 / 二次元結晶 / アクアポリン-4 / 極低温電子顕微鏡 / 水透過機構
Outline of Annual Research Achievements

(A)脳における水チャネルaquaprin-4(AQP4)特有な水透過機構の解明:脱炭酸酵素の阻害剤であるアセタゾラミド(AZA)はAQP4の水透過活性を下げることでも知られており、極低温電子顕微鏡像を用いてAZAが結合したAQP4二次元結晶の実像データで5Å分解能の立体構造解析を明らかにした。原子分解能でAZAの結合位置を特定するするため、二次元結晶由来のデータの分解能向上をめざした。同一結晶条件内に含まれる複数の対称性をもつ二次元結晶が生成されるため、原子分解能レベルのデータ収集には、試料作製および電子回折データの収集にかなりの時間を要したが、3.2Å分解能での立体構造解析が可能になった。最終的なデータ数を増やすことで分解能の向上が期待できるが、現時点でもリガンドに相当するデンシティは、直接ポアを塞ぐ位置で結合し、AQP4の水透過を抑制していることがはっきりし、5Å分解能の三次元再構成像で推定された結合位置とも一致した。

(B)AQP4のアレイ形成に重要なN末端構造の解明:AZAが結合したAQP4の二次元結晶でも、同様なアレイ形成に重要なN末端側のデンシティが確認されていることから、3.2Å分解能の電子回折データと5Å分解能の実像データ(フィルムに記録)を組み合わせたハイブリッドのデータ生成し構造解析を進めることで、通常の解析では確認できなかったN末端側の主鎖構造をある程度特定でき、アレイ形成の足場を提供する部分がわかってきた、しかし、記録媒体であるフィルムの性質に依存して詳細な部分が可視化できないことが判明したため、更なる分解能向上を目指して、昨年度より導入した直接電子をカウントできるK2 Summitによる高分解能の画像の記録システムをようやく完成させることができた。将来的には、実像データのみの二次元結晶高分解能三次元再構成が有望であることもわかってきた。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 8 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Crystal structures of claudins: insights into their intermolecular interactions.2017

    • Author(s)
      H. Suzuki, K. Tani, Y. Fujiyoshi
    • Journal Title

      Ann. N. Y. Acad. Sci.

      Volume: N/A Pages: N/A

    • DOI

      10.1111/nyas.13371

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Atomic structure of the innexin-6 gap junction channel determined by cryo-EM.2016

    • Author(s)
      A. Oshima, K. Tani, Y. Fujiyoshi
    • Journal Title

      Nat. commun.

      Volume: 7 Pages: 13681

    • DOI

      10.1038/ncomms13681

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Activation mechanism of endothelin ETB receptor by endothelin-1.2016

    • Author(s)
      W. Shihoya, T. Nishizawa, A. Okuta, K. Tani, N. Dohmae, Y. Fujiyoshi, O. Nureki, T. Doi
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 537 Pages: 363-368

    • DOI

      10.1038/nature19319

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Thermostabilization of the human endothelin type-B receptor.2016

    • Author(s)
      A. Okuta, K. Tani, S. Nishimura, Y. Fujiyoshi, T. Doi
    • Journal Title

      J. Mol. Biol.

      Volume: 428 Pages: 2265-2274

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2016.03.024

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Hexadecameric structure of an invertebrate gap junction channel.2016

    • Author(s)
      A. Oshima, T. Matsuzawa, K. Murata, K. Tani, Y. Fujiyoshi
    • Journal Title

      J. Mol. Biol.

      Volume: 428 Pages: 1227-1236

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2016.03.024

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Two-dimensional crystallization of monomeric bovine cytochrome c oxidase with bound cytochrome c in reconstituted lipid membranes.2016

    • Author(s)
      Y. Osuda, K. Shinzawa-Itoh, K. Tani, S. Yoshikawa, T. Tsukihara, C. Gerle
    • Journal Title

      Microscopy

      Volume: 65 Pages: 263-267

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfv381

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Claudin-21 has a paracellular channel role at tight junctions.2016

    • Author(s)
      H. Tanaka, Y. Yamamoto, H. Kashihara, Y. Yamazaki, K. Tani, Y. Fujiyoshi, K. Mineta, K. Takeuchi, A. Tamura, and S. Tsukita
    • Journal Title

      Mol. Cell Biol.

      Volume: 36 Pages: 954-964

    • DOI

      10.1128/MCB.00758-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Two-dimensional crystal structure of aquaporin-4 bound to the inhibitor acetazolamide.2016

    • Author(s)
      A. Kamegawa, Y. Hiroaki, K. Tani, Y. Fujiyoshi
    • Journal Title

      Microscopy

      Volume: 65 Pages: 177-184

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfv368

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡によるチャネルの原子分解能構造解析2016

    • Author(s)
      谷一寿
    • Organizer
      理研シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2016-11-08 – 2016-11-08
    • Invited
  • [Remarks] 水チャネル

    • URL

      http://www.cespi.nagoya-u.ac.jp/research.html

  • [Remarks] 研究成果

    • URL

      http://www.cespi.nagoya-u.ac.jp/BasicBiol/tani/tani_jp.htm

URL: 

Published: 2018-01-16  

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