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2014 Fiscal Year Research-status Report

シロイヌナズナのミオシンの網羅的機能解析

Research Project

Project/Area Number 26440131
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

伊藤 光二  千葉大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50302526)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岩城 光宏  独立行政法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 上級研究員 (30432503)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsミオシン / シロイヌナズナ / モータータンパク質 / 原形質流動
Outline of Annual Research Achievements

シロイヌナズナにはクラスXIミオシンが13遺伝子,クラスVIIIミオシンが4遺伝子,合計17遺伝子のミオシンが発現している。これらのミオシンは細胞内で原形質流動,小胞,オルガネラの輸送,構造維持,張力発生などをとおして細胞成長,個体成長に重要な機能をはたしていると考えられている。しかし,どのミオシンが,どの機能に,どのような機構で関わっているのか,その分子機構についてはほとんどわかっていない。その大きな要因はシロイヌナズナミオシンのタンパク質レベルの解析データが圧倒的に不足していることによる。そこで当該年度においては,シロイヌナズナの17種類のミオシンを網羅的に昆虫培養細胞の系で発現,精製し,17種類すべてのミオシンの運動機構,調節機構をタンパク質レベルで明らかにすることとした。 まず,運動機構を明らかにするために17種類のミオシンのモータードメイン(MD)を昆虫細胞で発現させ,精製した。そして,それぞれの運動速度を in vitro 運動アッセイによって測定した。その結果,シロイヌナズナのクラスXIミオシンの運動速度は大きく異なることがわかわかった。今回測定したMDコンストラクトから天然の全長コンストラクトの運動速度を推定すると 0.1 um/sの低速の運動速度をもつXI-I, 約5 um/sの中速の運動速度のMYA1, MYA2, XI-B, XI-E XIG,XI-H,XI-J,XI-K, 15 um/s以上の高速の運動速度をもつXI-A,XI-C,XI-D, ,XI-Fと3つの速度に分類できることがわかった。一方,VIII型ミオシンの運動速度は天然の全長コンストラクトの値にするとVIII-A, ATM1が0.1 um/s, VIII-B, ATM2が0.3 um/sであった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

シロイヌナズナにはクラスXIが13種類,クラスVIIIが4種類,合計17種類のミオシンが存在する。植物は個体レベルでみると動物よりもはるかに動きが少ないが,細胞レベルでの動態は,むしろ動物よりもダイナミックであるので,これほど多くの種類のミオシンが必要になるのだと考えられる。藻類を使った一連の研究によって,クラスXIミオシンの細胞内生理機能の1つは原形質流動の駆動であることがわかっている。シロイヌナズナには13種類のクラスXIミオシン遺伝子が存在するが,すべての生理的機能は原形質流動だけであろうか?それとも他の生理的機能があるのだろうか?また,4種類のクラスVIIIミオシンの機能は何であろうか?これらの解答を得るために,これまで多くの研究者により遺伝子ノックアウトによる遺伝学的手法がとられてきた。しかし,シロイヌナズナの多くのミオシンは機能の重複(redundancy)があるため,複数のミオシン遺伝子を同時に遺伝子破壊しなければ顕著な表現型が出ない。そのため遺伝学的手法からの情報に依存している現状においては,シロイヌナズナのほとんどのミオシンの生理的な役割, 機能について明確な解答が得られていない。その機能解明には生化学的解析によるタンパク質レベルでの解析が大きく寄与すると考えられる。植物から生化学的測定に必用な量の天然のミオシンを直接,精製するのは非常に困難なので分子生物学的手法を用いた発現系が必用とされる。平成26年度は17種類のすべてのMDコンストクトの作製に成功した。そして発現させ,精製し,17種類のすべてのMDコンストクトの運動速度の測定もおこなうこともでき,17種類のミオシンの基本的性質を明らかにすることができた。以上のように,この1年で本研究の基幹的な部分の今後な部分が成し遂げることができたといえ予定通りに進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

昨年度はシロイヌナズナの17種類のミオシンについてMDコンストラクトはすべて完成した。それをもちいた運動速度の測定をおこなった。今年度はHMMコンストラクトを作製して運動速度を測定する。さらに,アクチン活性化ATP分解活性を測定しアクチン最大分解活性Vmaxおよび,アクチンとの親和性をあらわすKmを求める。さらにシロイヌナズナで主要な役割をはたしていると考えられているMYA1, MYA2, XI-B, XI-K, XI-F, XI-IについてはIQコンストラクト,全長コンストラクト,尾部コンストラクトを作製する。そして全長コンストラクトにおいてアクチン活性化ATP分解活性を測定し,HMMコンストラクトと比較することにより尾部による調節機構を調べる。また,17種類のミオシンのMDコンストラクトおよびIQコンストラクトを使用し,ストップドフローによる速度論的解析を行いアクトミオシン反応の各素過程の速度定数(kinetic value)を求め,ミオシンの運動特性,酵素特性の分子的基盤を調べる。さらに,アクチンとの強い結合時間を測定し,duty ratioを求め,ミオシンが輸送タイプか係留/張力発生タイプかを明らかにする。HMMを使用し,全反射照明蛍光顕微鏡による1分子イメージングによって,個々のミオシンのプロセッシビティ(運動の連続性)と運動方向を調べる。また、光ピンセットを用いた1分子ナノ計測により,個々のミオシンの力測定とアクチンからの破断力測定を行い力学特性を定量する。ストップドフロー装置で測定したATP加水分解反応の速度定数(kinetic value)と, ミオシンの力学的な運動から推定される外力存在下でのATP加水分解反応の速度定数から酵素反応の外力依存性を求める。加えて、実際のオルガネラ輸送で想定される複数のミオシンが共同的に力発生している状況をin vitroで再構築し,その輸送特性とモーター間相関を可視化する。

  • Research Products

    (12 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 1 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Local heat activation of single myosins based on optical trapping of gold nanoparticles2015

    • Author(s)
      M. Iwaki, A. Iwane, K. Ikezaki, T. Yanagida
    • Journal Title

      Nano Letters

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1021/nl5049059

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 植物の大きさはミオシンモーターのスピードで決まる!2014

    • Author(s)
      富永基樹,伊藤光二
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 54 Pages: 259-261

    • DOI

      10.2142/biophys.54.259

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Myosin V is a biological Brownian machine2014

    • Author(s)
      K. Fujita, M. Iwaki
    • Journal Title

      BIOPHYSICS

      Volume: 10 Pages: 69-75

    • DOI

      10.2142/biophysics.10.69

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] DNAオリガミバネを用いたミオシンVIのアンカー機能の分子動態計測2014

    • Author(s)
      岩城 光宏, Wickham Shelley, 池崎 圭吾, 柳田 敏雄, Shih William
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] シロイヌナズナミオシンMYA1、MYA2の結合タンパク質の探索2014

    • Author(s)
      勝俣幸平、富永基樹、原口武士、筒井千晶、中野明彦、伊藤光二
    • Organizer
      日本植物学会の第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナミオシン11Kの尾部結合タンパク質の探索2014

    • Author(s)
      筒井千晶、富永基樹、原口武士、勝俣幸平、中野明彦、伊藤光二
    • Organizer
      日本植物学会の第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナアクチンの諸性質:ミオシンとの相互作用を中心に2014

    • Author(s)
      諏訪貴大、大矢里美、貴嶋紗久、富永基樹、大木高志、中野明彦、石渡信一、上田太郎、伊藤光二
    • Organizer
      日本植物学会の第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナ低分子量Gタンパク質Rabとミオシンとの相互作用2014

    • Author(s)
      脇坂達哉、富永基樹、原口武士、中野明彦、伊藤光二
    • Organizer
      日本植物学会の第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナミオシンMYA2モータードメインのアクチン結合部位の同定2014

    • Author(s)
      薩如拉,富永基樹、中野明彦、山本啓一,伊藤光二
    • Organizer
      日本植物学会の第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] Anchoring mechanism of Myosin-VI revealed with a Programmed DNA origami Spring2014

    • Author(s)
      M. Iwaki
    • Organizer
      Gordon Research Conferences, Mucsle & Molecular Motors
    • Place of Presentation
      Mount Snow Resort, USA
    • Year and Date
      2014-07-06 – 2014-07-11
    • Invited
  • [Book] Engineering of chemical complexity II, World Scientific Lecture notes in Complex systems2014

    • Author(s)
      M. Iwaki
    • Total Pages
      283
    • Publisher
      World Scientific
  • [Book] 筋機能改善の理学療法とそのメカニズム, 第3版2014

    • Author(s)
      岩城光宏
    • Total Pages
      357
    • Publisher
      NAP

URL: 

Published: 2016-05-27  

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