2016 Fiscal Year Annual Research Report
Transcriptional profiling of olfactory inprinting-related molecules in chum salmon brain using next-generation sequencer
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26450279
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
工藤 秀明 北海道大学, 水産科学研究院, 准教授 (40289575)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | サケ / 母川刷込 / 母川回帰 / 嗅覚 / 次世代シーケンサー / 嗅球 / 終脳 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では，北日本の重要水産物であるサケ（シロザケ Oncorhynchus keta）の母川刷込前後や産卵遡上時の母川のニオイを想起する前後に脳内で発現が消長もしくは大きく変化する分子群を次世代シーケンサー (NGS) を用いた網羅的な遺伝子発現解析により同定し，その各分子について脳内における時空間的に詳細な発現解析を行い，母川刷込形成の脳内における分子機序を明らかにすることを目的としている。最終年度である平成28年度は，平成27年度中にNGSによるトランスクリプトーム解析で得られた母川刷込を行う降海時の幼稚魚の嗅覚中枢（嗅球+終脳）で発現している253,872個のコンティグの解析を行った。その中で，降海後標本より降海中標本の方が4倍以上高い相対的転写物濃度 (FPKM値) を示したコンティグは863 配列，10倍以上高い同値を示したものは108配列であった。その108配列のコンティグと既知の遺伝子配列との相同性検索を行った結果，1配列が情報伝達，8配列がイオン輸送，22配列が細胞増殖・分化，9配列が細胞構成成分，17配列がその他の機能，機能類推不可能な未知のものが51配列であった。選抜されたコンティグには，シナプス伝達の機能維持やシナプス形成に関わる分子や神経系の発達時期であることを反映して細胞増殖・分化に関わる分子が多く含まれた。
さらに，上記の絞込み条件では選抜されなかったが，母川刷込関連分子として可能性の高いシナプス可塑性に関わるシナプトソーム関連タンパク25 (SNAP25) 遺伝子のサケ嗅覚中枢における発現動態を定量PCRにより解析した。その結果，降海終期ほど高い発現を示し，同時期にシナプス可塑性を介して刷込形成に関わると考えられた。
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Research Products
(5 results)
