2017 Fiscal Year Annual Research Report
Global dynamics of malaria parasites using an advanced technology of population genomics
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26460515
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Research Institution | Juntendo University |
Principal Investigator |
美田 敏宏 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80318013)
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Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2018-03-31
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Keywords | マラリア / 薬剤耐性 / 進化 / 地理的拡散 / 集団遺伝 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、流行地を網羅する36集団の熱帯熱マラリア原虫を用いて、薬剤耐性マラリア原虫が耐性起源地からアフリカに至り、大陸内を拡散する経路を解明することである。最終年度を延長したことによって、前年度に残っていた課題解決にむけ大きく進展させることができた。 1.アルテミシニン耐性の6つのバックグランド変異解析を実施したところ、アフリカにはほとんど存在せず、東南アジア、とりわけメコン流域で極端に高い変異率を示していることが明らかになった。さらに6つの変異のなかでK13変異の出現より早く出現したと思われる変異もあった。 2.パプアニューギニアで2017年1月に得られた検体の中に、アルテミシニン耐性の責任遺伝子とされているKelch13遺伝子のC580Y変異を示す原虫が3例存在していた。Kelch13遺伝子周辺の-32kbから+72kbに位置する9箇所のマイクロサテライトに加え、本年度は同領域に存在するSNPsのタイピングを追加し、耐性の進化、地理的拡散についてより精度の高い解析を実施した。さらに、2017年に得られた140例のアルテミシニン感受性原虫においても同様の解析を実施した。その結果、野生型Kelch13遺伝子を持つ原虫では多様なマイクロサテライトタイプを示していたが、カンボジア起源の耐性原虫類似の変異を持っている原虫が多数存在していることが明らかになった。集団遺伝学的な解析により、パプアニューギニアで独自に出現したアルテミシニン耐性原虫の可能性が最も確からしいと言う結論になった。
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[Journal Article] Artemisinin-Resistant Plasmodium falciparum with High Survival Rates, Uganda, 2014-20162018
Author(s)
Ikeda M, Kaneko M, Tachibana SI, Balikagala B, Sakurai-Yatsushiro M, Yatsushiro S, Takahashi N, Yamauchi M, Sekihara M, Hashimoto M, Katuro OT, Olia A, Obwoya PS, Auma MA, Anywar DA, Odongo-Aginya EI, Okello-Onen J, Hirai M, Ohashi J, Palacpac NMQ, Kataoka M, Tsuboi T, Kimura E, Horii T, Mita T
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Journal Title
Emerging infectious diseases
Volume: 24
Pages: 718-726
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] ウガンダにおけるin vivo薬剤耐性試験およびRSAを用いたアルテミシニン耐性疫学調査2017
Author(s)
池田美恵, 橘真一郎, 山内祐人, Auma M, 関原誠, 森稔幸, 平井誠, Palacpac N, 木村英作, Aginya E, 堀井俊宏, 美田敏宏
Organizer
第86回日本寄生虫学会大会
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[Presentation] ウガンダにおける熱帯熱マラリア原虫キニーネ感受性の実態2017
Author(s)
山内祐人, 橘真一郎, 池田美恵, 関原誠, Balikagala B, 八代?櫻井美樹, 平井誠, Palacpac N, 木村英作, 堀井俊宏, 美田敏宏
Organizer
第86回日本寄生虫学会大会
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[Presentation] 宿主内競争による熱帯熱マラリア原虫のクロロキン感受性の回復2017
Author(s)
橘真一郎, 池田美恵, Balikagala B, 櫻井美樹, 八代聖基, 関原誠, 山内祐人, Auma MA, 平井誠, 森稔幸, Palacpac N, 片岡正俊, 木村英作, 堀井俊宏, 美田敏宏
Organizer
第86回日本寄生虫学会大会
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[Presentation] Detection of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum isolates with ex-vivo ring-stage survival assay in Uganda2017
Author(s)
Mita T, Ikeda M, Kaneko M, Balikagala B, Tachibana S-I, Sakurai-Yatsushiro M, Yatsushiro S, Takahashi N, Hashimoto M, Katuro O, Olia A, Obwoya P, Auma M, Anywar D, Odongo-Aginya E, Hirai M, Palacpac N, Kataoka M, Tsuboi T, Kimura E, Horii T
Organizer
Keystone Symposia Conference: Malaria: From Innovation to Eradication
Int'l Joint Research
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[Presentation] Application of a cell microarray chip system for accurate, highly sensitive, and rapid diagnosis for malaria2017
Author(s)
Kataoka M, Yatsushiro S, Yamamoto T, Oka H, Okello-Onen J, Odongo-Aginya E, Palacpac N, Mita T, Baba Y, Horii T
Organizer
Keystone Symposia Conference: Malaria: From Innovation to Eradication
Int'l Joint Research