B細胞最終分化系譜における非コードRNA発現制御機構の解析

2014 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26460580
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 前田 和彦 熊本大学, 大学院生命科学研究科, 助教 (20332869)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: 抗体 / ゲノム / 体細胞突然変異 / 脱アミノ化酵素 / B細胞

Outline of Annual Research Achievements

獲得免疫を担う抗体は、多様な抗原に対してレパートリーを備えている。抗体産生B細胞は、胚中心B細胞を起点に記憶B細胞あるいはプラズマ細胞へと分化するが、どのような仕組みで抗体産生能を長期維持しているのかは明らかではない。この過程では、成熟B細胞で特異的発現する活性型シチジン脱アミノ化酵素（AID）を介した分子制御機構が必須である。AIDのcofactorとして機能するGANPは、タンパク質、DNA、RNAレベルでAIDを起点とした分子機構に関与することが示唆される。本研究では、GANPのRNA認識モチーフに着目して、どのような仕組みでB細胞最終分化系譜においてmiRNA/mRNAの発現変化を引き起こすのか、なぜ選択的miRNA/mRNAの発現と核外輸送が行なわれているのかという分子基盤の解明を目指す。今年度は、「ゲノム支援」によって次世代シークエンス解析を中心に行ない、GANPと結合するゲノム配列及びRNA配列の情報を得ることができた。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

次世代シークエンスによる解析を介して、標的配列の全容に迫ることかできる段階になった。

Strategy for Future Research Activity

今後は、さらに正常ヒト及びマウスB細胞などを用いて、より生理的意義が得られるようにデータ解析を推進することを計画している。

Causes of Carryover

平成26年度は、「ゲノム支援」に採択され、次世代シークエンス解析の援助に恵まれたため、試料標本の評定に係る経費を抑えることができた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

平成27年度の使用計画としては、分子生物学的手法やタンパク質精製に用いる研究試薬、キットなどの物品費、学会発表や共同研究に係る旅費、論文投稿に係る英文校正代や機器整備、データ解析係る諸経費を予定している。また、５月より他機関への移動があるため、その他の経費として計上する。

Research Products

• [Journal Article] GANP regulates the choice of DNA repair pathway by DNA-PKcs interaction in AID-dependent IgV region diversification. (2014)
  • Author(s): 1.Eid* MMA, Maeda* K (*co-first author), Almofty SA, Singh SK, Shimoda M, and Sakaguchi N.
  • Journal Title: The Journal of Immunology Volume: 192 Pages: 5529-5539
  • DOI: 10.4049/jimmunol.1400021
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] Regulation of selective non-coding RNA species involved in B-cell maturation by AID-interacting molecule GANP (2015)
  • Author(s): Maeda, K. Shimoda, M Singh, S. K. Almofty, S. A. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: Keystone Symposia Conference The Golden Anniversary of B Cell Discovery
  • Place of Presentation: Fairmont Banff Springs, Banff, Alberta, Canada
  • Year and Date: 2015-03-22 – 2015-03-27
• [Presentation] Mechanism of activation of LINE-1 retrotransposition in somatic cells (2014)
  • Author(s): Shimoda, M. Maeda, K. Almofty, S. A. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: The 43th Annual Meeting of the Japanese Society for Immunology
  • Place of Presentation: Kyoto International Conference Center
  • Year and Date: 2014-12-10 – 2014-12-12
• [Presentation] GANP takes part of the function of TREX-2 complex for exporting non-coding RNAs in B-cells (2014)
  • Author(s): Maeda, K. Almofty, S. A. Singh, S. K. Shimoda, M. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: The 43th Annual Meeting of the Japanese Society for Immunology
  • Place of Presentation: Kyoto International Conference Center, Kyoto
  • Year and Date: 2014-12-10 – 2014-12-12
• [Presentation] APOBEC3G-associated GANP in HIV-1 virion initially interacts with the viral integration complex and might regulate viral integration into the host genome (2014)
  • Author(s): Almofty, S. A. Maeda, K. Shimoda, M. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: The 43th Annual Meeting of the Japanese Society for Immunology
  • Place of Presentation: Kyoto International Conference Center, Kyoto
  • Year and Date: 2014-12-10 – 2014-12-12
• [Presentation] GANP plays a critical role in the final stage of immunoglobulin V-region somatic hypermutation for generation of high-affinity antigen-specific antibody (2014)
  • Author(s): Eid, M. M. A. Maeda, K. Singh, S. K. Almofty, S. A. Shimoda, M. Sakaguchi, N.
  • Organizer: The 43th Annual Meeting of the Japanese Society for Immunology
  • Place of Presentation: Kyoto International Conference Center, Kyoto
  • Year and Date: 2014-12-10 – 2014-12-12
• [Presentation] ヒトRNA 輸送TREX-2 因子GANP のHIV-1 抵抗性の分子機序 (2014)
  • Author(s): 前田和彦 アルモフティ・サーラ アミーン 下田真唯子 シン・シャイレンドラ クマール エイド・モハメド アバス 川畑輝弥 池田輝政 小糸厚 阪口薫雄
  • Organizer: 第28 回日本エイズ学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場、大阪
  • Year and Date: 2014-12-03 – 2014-12-05
• [Presentation] A host factor GANP involve in anti-HIV-1 infectivity response by facilitating the encapsidation of APOBEC3G into virion core (2014)
  • Author(s): Almofty, S. A. Maeda, K. Shimoda, M. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: International Workshop on Biomedical Engineering at Osaka Institute of Technology
  • Place of Presentation: Omiya Campus of Osaka Institute of Technology, Osaka
  • Year and Date: 2014-11-16 – 2014-11-16
• [Presentation] HIV-1 virus causes disassembly of TREX-2 component GANP from nuclear pores to be taken with integrase in the virus entry process (2014)
  • Author(s): Maeda, K. Almofty, S. A. Shimoda, M. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: The 10th China-Japan Joint Laboratory Workshop: Pathogenesis, Gene Regulation and Signal Transduction
  • Place of Presentation: Chinese Academy of Sciences, Beijing, China
  • Year and Date: 2014-11-15 – 2014-11-15
• [Presentation] GANP that interacts with HIV-1 integrase inherently enhances retrotransposition (2014)
  • Author(s): Shimoda, M. Maeda, K. Almofty, S. A. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Koito, A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: 15th Kumamoto AIDS Seminar
  • Place of Presentation: Hotel Nikko Kumamoto, Aso Resort Grandvrio Hotel, Kumamoto, Japan
  • Year and Date: 2014-10-01 – 2014-10-03
• [Presentation] A TREX-2 component GANP is dispersed from the nuclear envelope during HIV-1 virus entry and associated with integrase in the host cell nucleus (2014)
  • Author(s): Almofty, S. A. Maeda, K. Shimoda, M. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Koito, A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: 15th Kumamoto AIDS Seminar
  • Place of Presentation: Hotel Nikko Kumamoto, Aso Resort Grandvrio Hotel, Kumamoto, Japan
  • Year and Date: 2014-10-01 – 2014-10-03
• [Presentation] Role of GANP in the DNA repair for AID-induced somatic hypermutation generating high affinity antibodies (2014)
  • Author(s): Sakaguchi, N. Eid, M. M. A. Singh, S. K. Almofty, S. A. Shimoda, M Maeda, K.
  • Organizer: The 2nd Symposium of International Immunological Memory and Vaccine Forum
  • Place of Presentation: La Jolla Institute for Allergy & Immunology, San Diego, CA, USA
  • Year and Date: 2014-08-25 – 2014-08-26
• [Presentation] GANP-mediated APOBEC3G targeting in generation of non-infectious HIV-1viruses (2014)
  • Author(s): Maeda, K. Almofty, S. A. Shimoda, M Singh, S. K. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: The 2nd Symposium of International Immunological Memory and Vaccine Forum
  • Place of Presentation: La Jolla Institute for Allergy & Immunology, San Diego, CA, USA
  • Year and Date: 2014-08-25 – 2014-08-26
• [Presentation] GANP plays a role in the LINE-1 life cycle in somatic cells (2014)
  • Author(s): Shimoda, M Maeda, K. Almofty, S. A. Singh, S. K. Eid, M. M. A. Sakaguchi, N.
  • Organizer: 第8 回日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: 伊藤国際学術研究センター（東京大学構内）、東京
  • Year and Date: 2014-05-25 – 2014-05-27
• [Presentation] Molecular mechanism of transcription and epigenetic alteration at immunoglobulin variable gene heavy chain locus induced by GANP (2014)
  • Author(s): Singh, S. K. Maeda, K. Eid, M. M. A. Almofty, S. A. Shimoda, M Kawabata, T Sakaguchi, N.
  • Organizer: Immunology 2014 The American Association of Immunologists Annual Meeting
  • Place of Presentation: David L. Lawrence Convention Center, Pittsburgh, Pennsylvania, USA
  • Year and Date: 2014-05-02 – 2014-05-06
• [Book] 免疫グロブリンの体細胞高頻度突然変異誘導とGANP (2014)
  • Author(s): 下田真唯子, 前田和彦, 阪口薫雄
  • Total Pages: 472-479
  • Publisher: 科学評論社
• [Remarks] 熊本大学大学院生命科学研究部 感染・免疫学講座 免疫学分野
  • URL: http://www.k-immu.jp/ja/index.html