2015 Fiscal Year Research-status Report
胆道がんのトランスクリプトーム解析による新規治療標的遺伝子の同定と診断
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26461040
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
新井 康仁 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所 がんゲノミクス研究分野, 主任研究員 (80222727)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 胆道がん / 分子標的 / 融合遺伝子 / トランスクリプトーム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
胆道がんは、発症早期の臨床症状に乏しくかつ浸潤性が高いことから、多くの症例では進行期で発見されることになり、その予後は不良な難治がんである。本研究では、今までの化学療法では治癒が困難であることが多い胆道がんについて、がんのドライバーとなっている新しい治療標的分子を同定し、革新的な診断と分子標的治療の基盤を確立することを目的としている。本年度は、胆道がん80症例よりRNAを抽出し、全RNAシークエンス解析を行なった。シークエンス品質のチェックの結果、前年度と合わせて160症例の全RNAシークエンス解析データを得ることができた。その内訳は肝内胆管がん109症例、肝外胆管がん40症例、胆嚢がん11症例である。このシークエンス解析によって、受容体キナーゼ融合遺伝子としてFGFR2-TXLNA, FGFR2-KCTD1を新しく同定した。更に、cAMPプロテインキナーゼの触媒サブユニットの融合遺伝子ATP1B-PRKACA, ATP1B-PRKACBを発見した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
前年度と合わせ、160症例の胆道がん凍結検体の全RNAシークエンス解析データを得ることができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまでの研究計画に変更はない。
新規に同定したがんドライバー遺伝子候補をNIH3T3等の細胞に発現させて、造腫瘍性を調べる。
候補阻害剤を用いて、ドライバー遺伝子対する効果を解析する。
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| Causes of Carryover |
施設改修があり、動物実験が少し遅れたため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
本年度速やかに動物実験を開始しており、そのまま使用予定である。
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[Journal Article] Genomic spectra of biliary tract cancer.2015
Author(s)
Nakamura H, Arai Y, Totoki Y, Shirota T, Elzawahry A, Kato M, Hama N, Hosoda F, Urushidate T, Ohashi S, Hiraoka N, Ojima H, Shimada K, Okusaka T, Kosuge T, Miyagawa S, Shibata T.
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Journal Title
Nature Genetics
Volume: 47
Pages: 1003-1010
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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