2016 Fiscal Year Annual Research Report
Reprograming of lung epithelial cells
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26461185
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
齋藤 朗 東京大学, 保健・健康推進本部, 助教 (90591412)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 転写因子 / 遺伝子導入 / リプログラミング / 肺上皮細胞 / 肺線維芽細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
小細胞肺癌細胞株のトランスクリプトームに基づき、神経内分泌マーカーの発現レベルが高いASCL1陽性群、NEUROD1陽性群、さらに細胞接着性の高いYAP・TAZ陽性群のサブタイプを同定し、各群で遺伝子発現・細胞形態・薬剤感受性パターンが異なることを見出した（Cancer Sci, 2016）。
理化学研究所FANTOM5プロジェクトに参加し、様々な組織由来の線維芽細胞のCAGEプロファイルの比較解析を行った（Sci Rep, 2016）。
肺線維芽細胞が他臓器由来の線維芽細胞と異なる特性は何かを探索するため、トランスクリプトームを比較したところ、肺線維芽細胞に特徴的な転写因子群が同定された。ENCODEのH3K27ac ChIP-seqデータを活用してスーパーエンハンサーを定義したところ、さらに8個の転写因子のゲノム領域と重なり、これらが肺線維芽細胞のマスター因子として転写ネットワークの中核となっている可能性が示唆された。（論文投稿中）。
非小細胞肺癌細胞と肺上皮細胞の比較解析も行い、癌特異的なプロモーター・エンハンサー・反復配列の転写活性を網羅的に同定した（論文投稿中）。
非小細胞肺癌に特異的なcancer testis antigen（CTA）を網羅的に同定するウプサラ大学のプロジェクトに参画し、CTAがDNAメチル化による発現制御を受けている可能性について検証した（JCI Insight, 2016）。
転写共役因子TAZの肺線維芽細胞における機能、および肺線維症の病態における役割について探究した。患者の肺組織の免疫染色、マウスモデル、培養細胞実験、RNA-sequencing、LGRCデータベースを活用した臨床情報との統合、などの多面的解析により、TAZは細胞外基質の硬さを感知することで活性化され、肺線維症の病態形成に関与することが判明した（Sci Rep, 2017）。
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[Journal Article] TAZ contributes to pulmonary fibrosis by activating profibrotic functions of lung fibroblasts.2017
Author(s)
Noguchi S, Saito A, Mikami Y, Urushiyama H, Horie M, Matsuzaki H, Takeshima H, Makita K, Miyashita N, Mitani A, Jo T, Yamauchi Y, Terasaki Y, Nagase T
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 42595
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Transcriptome analysis of periodontitis-associated fibroblasts by CAGE sequencing identified DLX5 and RUNX2 long variant as novel regulators involved in periodontitis.2016
Author(s)
Horie M, Yamaguchi Y, Saito A, Nagase T, Lizio M, Itoh M, Kawaji H, Lassmann T, Carninci P, Forrest AR, Hayashizaki Y, Suzutani T, Kappert K, Micke P, Ohshima M
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 33666
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Profiling cancer testis antigens in non-small-cell lung cancer.2016
Author(s)
Djureinovic D, Hallstrom BM, Horie M, Mattsson JS, La Fleur L, Fagerberg L, Brunnstrom H, Lindskog C, Madjar K, Rahnenfuhrer J, Ekman S, Stahle E, Koyi H, Branden E, Edlund K, Hengstler JG, Lambe M, Saito A, Botling J, Ponten F, Uhlen M, Micke P
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Journal Title
JCI Insight
Volume: 1(10)
Pages: e86837
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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