次世代シークエンサを用いた胸腺癌新規治療標的遺伝子の同定

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26461206
• Research Institution: National Cancer Center Japan
• Principal Investigator: 藤原 豊 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (70464261)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: 胸腺がん / がん遺伝子 / 遺伝子増幅 / 遺伝子変異 / 遺伝子癒合

Outline of Annual Research Achievements

1973年から2014年に国立がん研究センター中央病院にて治療を受けた胸腺癌64例の臨床経過を明らかにし、またホルマリン固定パラフィン包埋検体52例について50個のがん関連遺伝子のTarget sequencingを行い、既知のがん関連遺伝子の異常を探索した。7例(13.5%)において遺伝子異常が認められ、その内訳はTP53(7.5%, 4/52), KRAS(3.8%, 2/52), FBXW7(3.8%, 2/52), NRAS(1.9%, 1/52)であった。2例でTP53とKRAS,TP53とFBXW7の重複変異を認めた。本研究結果はLung cancer誌にて2016年公表された。
Tetsuhiko Asao, Yutaka Fujiwara, and et al. Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. Lung cancer 93 (2016), 77-81.
腫瘍組織と正常組織の凍結組織が利用可能であったSampleに対して次世代シークエンサーを用いた全エクソンシークエンス解析、全RNAシークエンス解析を行った。その結果、これまでに胸腺癌で変異が報告されているCYLD遺伝子の変異を2例認めた。その他にも数十個の変異遺伝子を同定した。現在次世代シークエンサー解析により得られた結果をさらに解析を行っている。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定したTarget sequencing, 全エクソンシークエンス解析、全RNAシークエンス解析を終了し、解析中である。
前半部分に関しては論文公表を行った。

Tetsuhiko Asao, Yutaka Fujiwara, and et al. Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. Lung cancer 93 (2016), 77-81.

Strategy for Future Research Activity

全エクソンシークエンス、全RNAシークエンスを行った結果をさらに解析し、公表する予定である。

Causes of Carryover

ほぼ計画通りに試験試薬を購入、使用している

Expenditure Plan for Carryover Budget

論文発表の投稿料として計画している

Research Products

• [Journal Article] Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. (2016)
  • Author(s): Asao T, Fujiwara Y, Sunami K, Kitahara S, Goto Y, Kanda S, Horinouchi H, Nokihara H, Yamamoto N, Ichikawa H, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Takahashi K, Ohe Y.
  • Journal Title: Lung Cancer Volume: 93 Pages: 77-81
  • DOI: 10.1016/j.lungcan.2016.01.004
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] Retrospective analysis of 64 consecutive patients with thymic cancer (2015)
  • Author(s): Tetsuhiko Asao, Yutaka Fujiwara, Kuniko Sunami, Shinsuke Kitahara, Shintaro Kanda, Hidehito Horinouchi, Hiroshi Nokihara, Noboru Yamamoto, Reika Iwakawa-Kawabata, Takashi Kohno, Koji Tsuta, Shun-ichi Watanabe, Hisao Asanuma, and Yuichiro Ohe
  • Organizer: 第112回日本内科学会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2015-04-10 – 2015-04-12