2016 Fiscal Year Annual Research Report
The genomic and epigenomic landscape in thymic carcinoma
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26461206
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
藤原 豊 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (70464261)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | thymic carcinoma / TET2 / DNA methylation |
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| Outline of Annual Research Achievements |
1973年から2014年に国立がん研究センター中央病院にて治療を受けた胸腺癌64例の臨床経過を明らかにし、またFFPE検体52例について癌関連遺伝子のTarget sequenicingを行い、既知のがん関連遺伝子の異常を探索した。7例(13.5%)において遺伝子異常が認められ、その内訳はTP53(7.5%)、KRAS(3.8%)、FBXW7(3.8%)、NRAS(1.9%)であった。2例でTP53とKRAS、TP53とFBXW7の重複変異を認めた。本研究結果はLung Cancer誌にて2016年に公表された。 Asao T, Fujiwara Y, and et al. Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. Lung Cancer. 2016 Mar;93:77-81.
腫瘍組織と正常組織の凍結組織が利用可能であった10例のSampleに対して次世代シークエンサーを用いた全エクソンシークエンス解析、全RNAシークエンス解析を行った。その結果CpG dinucleotidesでのC>T substitutionsを高率に認めた。TET2変異を10例中3例に認め、TET2変異を有する胸腺癌では高度メチル化された遺伝子を有していた。これらの結果は現在投稿中である。
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[Journal Article] Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma.2016
Author(s)
Asao T, Fujiwara Y, Sunami K, Kitahara S, Goto Y, Kanda S, Horinouchi H, Nokihara H, Yamamoto N, Ichikawa H, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Takahashi K, Ohe Y.
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Journal Title
Lung Cancer
Volume: 93
Pages: 77-81
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
