2015 Fiscal Year Research-status Report
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26461549
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
宮武 聡子 横浜市立大学, 附属病院, 助教 (50637890)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | RNF213 / 全エキソーム解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
もやもや病は小児～若年成人に好発する進行性の脳主幹動脈閉塞症である。もやもや病の疾患感受性を高める遺伝子としてRNF213遺伝子が知られている。これまでの研究で本遺伝子のR4810K多型を有すると発症リスクがおよそ200倍上昇することを明らかにした。しかし発症には本多型以外に他の遺伝的要因の存在が強く疑われる。そこで患者の全エキソーム解析を50例、患者とその両親の全エキソーム解析を計30トリオ行った。得られた全エキソームデータを用いて、①本多型を有する患者と有さない患者について、両群の遺伝学的背景の相違を探索、②もやもや病非発症の日本人集団575人のデータと比較し、もやもや病発症と関連する遺伝子を探索、③遺伝形式を考慮した候補遺伝子変異の絞り込み、の3点について統計学的手法を用いて網羅的な解析を継続している。もやもや病は、従来の診断基準では、明らかな基礎疾患がなく、両側性に、特定の脳主幹動脈の狭窄や閉塞をきたすものと分類されているが、片側のみに病変がみられるもの（片側もやもや病）や、基礎疾患を有するもの（類もやもや病）がその周辺の病態として知られている。このような病態にRNF213遺伝子の R4810K多型がかかわっているのか否かについて、検索を行った。これまで、もやもや病201例、片側もやもや病15例、類もやもや病8例、特定部位を外れた脳主幹動脈の閉塞2例について同多型の解析を行い、もやもや病や特定部位を外れた脳主幹動脈の閉塞症＞片側もやもや病＞類もやもや病という頻度勾配をもって関連がみられた。またもやもや病は小児脳梗塞をきたす疾患であるが、もやもや病の診断基準をみたす脳動脈所見を有さない小児脳梗塞例4例では同多型の関連は見られなかった。本多型が関連する脳動脈症としての表現型は従来のもやもや病を主としてさらに広がりを有している可能性がある。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
もやもや病の新規責任遺伝子探索に関しては、エキソーム解析症例を増やして継続中である。
またRNF213遺伝子R4810K多型が関連する脳動脈症に関しては、もやもや病や特定部位を外れた脳主幹動脈の閉塞症＞片側もやもや病＞類もやもや病という頻度勾配をもった関連がみられ、症例数を増やして検証を続けている。
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| Strategy for Future Research Activity |
全エキソーム解析症例を追加して、疾患関連解析を網羅的に進める。RNF213遺伝子R4810K多型が関連する脳動脈症についても、症例数を増やして関連を確証する。
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| Causes of Carryover |
全エキソーム解析に使用する次世代シーケンサー関連試薬の購入を予定より遅らせたため、次年度使用額が生じた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
平成27年度に購入予定であった次世代シーケンサー関連試薬を28年度に購入する。
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[Journal Article] Atypical giant axonal neuropathy arising from a homozygous mutation by uniparental isodisomy.2015
Author(s)
Miyatake, S., H. Tada, S. Moriya, J. Takanashi, Y. Hirano, M. Hayashi, Y. Oya, M. Nakashima, Y. Tsurusaki, N. Miyake, N. Matsumoto, and H. Saitsu
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Journal Title
Clin Genet
Volume: 87
Pages: 395-7
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Detecting copy-number variations in whole-exome sequencing data using the eXome Hidden Markov Model: an 'exome-first' approach.2015
Author(s)
Miyatake, S., E. Koshimizu, A. Fujita, R. Fukai, E. Imagawa, C. Ohba, I. Kuki, M. Nukui, A. Araki, Y. Makita, T. Ogata, M. Nakashima, Y. Tsurusaki, N. Miyake, H. Saitsu, and N. Matsumoto
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Journal Title
J Hum Genet
Volume: 60
Pages: 175-82
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Dominant mutations in ORAI1 cause tubular aggregate myopathy with hypocalcemia via constitutive activation of store-operated Ca(2)(+) channels.2015
Author(s)
Endo, Y., S. Noguchi, Y. Hara, Y.K. Hayashi, K. Motomura, S. Miyatake, N. Murakami, S. Tanaka, S. Yamashita, R. Kizu, M. Bamba, Y. Goto, N. Matsumoto, I. Nonaka, and I. Nishino
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Journal Title
Hum Mol Genet
Volume: 24
Pages: 637-48
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Biallelic Mutations in Nuclear Pore Complex Subunit NUP107 Cause Early-Childhood-Onset Steroid-Resistant Nephrotic Syndrome.2015
Author(s)
Miyake, N., H. Tsukaguchi, E. Koshimizu, A. Shono, S. Matsunaga, M. Shiina, Y. Mimura, S. Imamura, T. Hirose, K. Okudela, K. Nozu, Y. Akioka, M. Hattori, N. Yoshikawa, A. Kitamura, H.I. Cheong, S. Kagami, M. Yamashita, A. Fujita, S. Miyatake, Y. Tsurusaki, M. Nakashima, H. Saitsu, K. Ohashi, N. Imamoto, A., et al.
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Journal Title
Am J Hum Genet
Volume: 97
Pages: 555-66
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] De novo KIF1A mutations cause intellectual deficit, cerebellar atrophy, lower limb spasticity and visual disturbance.2015
Author(s)
Ohba, C., K. Haginoya, H. Osaka, K. Kubota, A. Ishiyama, T. Hiraide, H. Komaki, M. Sasaki, S. Miyatake, M. Nakashima, Y. Tsurusaki, N. Miyake, F. Tanaka, H. Saitsu, and N. Matsumoto
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Journal Title
J Hum Genet
Volume: 60
Pages: 739-42
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] A Novel Mutation in ELOVL4 Leading to Spinocerebellar Ataxia (SCA) With the Hot Cross Bun Sign but Lacking Erythrokeratodermia: A Broadened Spectrum of SCA34.2015
Author(s)
Ozaki, K., H. Doi, J. Mitsui, N. Sato, Y. Iikuni, T. Majima, K. Yamane, T. Irioka, H. Ishiura, K. Doi, S. Morishita, M. Higashi, T. Sekiguchi, K. Koyama, N. Ueda, Y. Miura, S. Miyatake, N. Matsumoto, T. Yokota, F. Tanaka, S. Tsuji, H. Mizusawa, and K. Ishikawa
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Journal Title
JAMA Neurol
Volume: 72
Pages: 797-805
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] De novo KCNB1 mutations in infantile epilepsy inhibit repetitive neuronal firing.2015
Author(s)
Saitsu, H., T. Akita, J. Tohyama, H. Goldberg-Stern, Y. Kobayashi, R. Cohen, M. Kato, C. Ohba, S. Miyatake, Y. Tsurusaki, M. Nakashima, N. Miyake, A. Fukuda, and N. Matsumoto
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 5
Pages: 15199
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] Detecting copy number variations by analyzing whole exome sequencing data using the eXome Hidden Markov Model.2015
Author(s)
Miyatake S, Koshimizu E, Fujita A, Fukai R, Imagawa E, Ohba C, Kuki I, Araki A, Makita Y, Ogata T, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N
Organizer
American Society of Human Genetics 65th Annual Meeting
Place of Presentation
Baltimore, USA
Year and Date
2015-10-09
Int'l Joint Research
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