2016 Fiscal Year Annual Research Report
Integrated genomic analysis of aggressive subtype of neuroblastoma
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26461603
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| Research Institution | Research Institute for Clinical Oncology, Saitama Cancer Center |
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Principal Investigator |
大平 美紀 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 主幹研究員 (20311384)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 神経芽腫 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
神経芽腫は自然退縮する予後良好タイプがある一方で、難治性の予後不良タイプは依然として治癒率が低く、様々な臨床経過がみられる腫瘍である。本研究では、これらの臨床経過の異なるサブグループ毎に網羅的ゲノムコピー数解析や網羅的遺伝子発現解析の結果に、次世代シーケンサーによる遺伝子変異解析、RNAシーケンス解析、メチローム解析を組み合わせた詳細な解析を行い、腫瘍悪性度や臨床予後などと強く関連する遺伝子の同定、新しい神経芽腫リスク分類システムの構築を目的とする。平成28年度は、前年度までに行ったアレイCGH法による腫瘍組織のゲノムコピー数解析を用いて、症例をゲノムサブグループに分類し、MYCN増幅例で特に染色体部分的増加／欠失を伴う群（Pa群、17例）と、目立ったゲノムコピー数変化の見られないサイレント群（Ss群、20例）を含む計57例について網羅的変異解析を行った。シークエンシングは読み取り深度75以上で行った。検出されたアミノ酸を伴う変異はMYCN増幅群において有意に多く（Pa:13.8/tumor、Ss:1.2/tumor）、再発時腫瘍においては58とさらに増加していることが示された。また、その変異の数は発症時月齢が高いほど多い傾向が見られた（p=0.024）。変異遺伝子のアノテーションとパスウェイ解析ではPa腫瘍の変異遺伝子はMAPKパスウェイ、Wntパスウェイに含まれる遺伝子群やaxon guidanceに関係する遺伝子群にエンリッチされていることが示された。これらの中にはNRAS活性化変異など他の進行腫瘍でも報告されているものが含まれ、今後の治療法開発に寄与すると期待された。
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[Journal Article] Genomic analysis-integrated whole-exome sequencing of neuroblastoma identifies genetic mutations in axon guidance pathway.2017
Author(s)
Li Y*, Ohira M*, Zhou Y, Xiong T, luo W, Yang C, Li X, Gao Z, Nakamura Y, Kamijo T, Kaneko Y, Taketani T, Ueyama J, Tajiri T, Zhang H, Wang J, Yang H, Yin Y, Nakagawara A.
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Neuronal leucine-rich repeat 1 negatively regulates anaplastic lymphoma kinase in neuroblastoma.2016
Author(s)
Satoh S, Takatori A, Ogura A, Kohashi K, Souzaki R, Kinoshita Y, Taguchi T, Hossain MS, Ohira M, Nakamura Y, Nakagawara A.
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 6
Pages: 32682
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Clinical relevance of genomic and epigenomic classification of MYCN-non-amplified neuroblastoma2016
Author(s)
Ohira M, Nakamura Y, Tatsumi Y, Tatsuno K, Tsutsumi S, Yamamoto S, Nagae G, Renard-Guillet C, Nagase H, Kamijo T, Aburatani H, Nakagawara A
Organizer
ANR2016
Place of Presentation
ケアンズ（オーストラリア）
Year and Date
2016-06-19 – 2016-06-23
Int'l Joint Research
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[Presentation] Genomic characterization of high-risk neuroblastoma in Japan: A retrospective study of 537 cases by using updated follow-up data based on INRG variables [JNBSG (Japan Neuroblastoma Study Group)]2016
Author(s)
Ohira M, Kamijo T, Takimoto T, Nakazawa A, Matsumoto K, Shichino H, Hishiki T, Iehara T, Nakamura Y, Nagase H, Yoneda A, Fukushima T, Tajiri T, Nakagawara A
Organizer
ANR2016
Place of Presentation
ケアンズ（ オーストラリア）
Year and Date
2016-06-19 – 2016-06-23
Int'l Joint Research
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[Presentation] Genomic landscape of aggressive tumor subtype in MYCN-non-amplified neuroblastoma2016
Author(s)
Ohira M, Tatsuno K, Nakamura Y, Tatsumi Y, Tsutsumi S, Yamamoto S, Nagae G, Renard-Guillet C, Nagase H, Kamijo T, Aburatani H, Nakagawara A
Organizer
AACR Annual Meeting 2016
Place of Presentation
ニューオーリンズ（米国）
Year and Date
2016-04-16 – 2016-04-20
Int'l Joint Research
