2015 Fiscal Year Research-status Report
血液循環腫瘍DNAを用いたメラノーマ患者の遺伝子解析
Project/Area Number |
26461687
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Research Institution | Shinshu University |
Principal Investigator |
芦田 敦子 信州大学, 学術研究院医学系, 助教 (00596786)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
宇原 久 信州大学, 学術研究院医学系, 准教授 (40201355)
奥山 隆平 信州大学, 学術研究院医学系, 教授 (80292332)
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Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | ctDNA / メラノーマ / BRAF / バイオマーカー |
Outline of Annual Research Achievements |
メラノーマ患者について、血液循環腫瘍DNA(circulating DNA: ctDNA)は癌の状態をリアルタイムに把握できるバイオマーカーとして臨床応用できるかを検討している。1年目には、採血から血漿分離、DNA抽出、DNA定量までのプロトコールを決定した。2年目は、Competitive allele specific TaqMan PCR (castPCR)法を用いて12人のメラノーマについて検討した。BRAFV600E ctDNAをモニタリングし、腫瘍量や予後を反映しているか比較した。 1.castPCR法の感度と特異度の検討:メラノーマ培養細胞を用いてのBRAFV600E 検出感度は0.5%、健常人の血漿を用いての特異度は100%だった。 2.組織検体の遺伝子型の検討:Sanger法にて12人の内6人にBRAFV600Eが検出された。 3.ctDNAのモニタリング:Competitive allele specific TaqMan PCR (castPCR)法を用いて、ctDNAと、他の血中バイオマーカーであるlactate dehydrogenase (LDH)、5-S-Cysteinyldoma (5-SCD)、CT画像と比較した。 4.結果:組織にてBRAF変異があり、かつ多臓器転移の患者にctDNAが検出された。ctDNAの変化は腫瘍量と相関し、LDHや5-SCDよりも鋭敏にその腫瘍量を反映した。ctDNAが検出された患者は7か月以内に死亡したことから、予後マーカーになりうると考えられた。組織にてBRAF変異があり、かつ多臓器転移の内の1例は、ctDNAが検出されなかった。この患者は原発巣にはBRAF変異だったが転移巣は野生型だった。メラノーマのheterogeneityによると考えられた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
1年目に研究のプロトコールを確立でき、2年目にはこれまでに準備しておいた臨床検体を用いてスムーズに研究を進めることができた。
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Strategy for Future Research Activity |
・症例数を増やす ・採血時期を決める ・治療に対する反応、薬剤耐性、再発の早期発見などにマーカーになりうるかの検討 ・BRAFV600E 以外の遺伝子変異を有する患者に対する検討
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Causes of Carryover |
当初計画で見込んだより安価に研究が進んだこと、学会発表のための国内外出張が研究進捗状況から次年度に実施する予定となったため。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
次年度使用額は平成28年度請求額とあわせて、実験消耗品、実験機器、旅費、論文校正などで使用する。
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[Journal Article] Clinical characteristics associated with BRAF, NRAS and KIT mutations in Japanese melanoma patients2015
Author(s)
Kaori Sakazawa, Atsuko Ashida, Aya Uchiyama, Takamichi Ito, Yasuhiro Fujisawa, Dai Ogata, Shigeto Matsushita, Kazuyasu Fujii, Satoshi Fukushima, Yoshitsugu Shibayama, Naohito Hatta, Tatsuya Takenouchi, Jiro Uehara, Ryuhei Okuyama, Naoya Yamazaki, Hisashi Uhara
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Journal Title
J Dermatol Sci
Volume: 80
Pages: 33-37
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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