2015 Fiscal Year Research-status Report
ゲノムワイド関連解析とDNAメチル化解析を統合したパニック障害候補遺伝子の探索
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26461712
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
梅景 正 東京大学, 環境安全本部, 准教授 (20323587)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
音羽 健司 帝京平成大学, その他の研究科, 教授 (70456119)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 遺伝子 / 全ゲノム関連解析 / DNAメチル化関連解析 / HLA / パニック障害 / パスウェイ解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究ではパニック障害の脆弱性遺伝座位の探索のため、1）全ゲノム関連解析（GWAS）を用いた研究と、2）全ゲノムメチル化関連解析（EWAS）の両面から解析を行った。一つ目のGWASデータから、3種類の異なったパスウェイ解析ソフト（DAVID、i-GSEA4GWAS、ICSNPathway）を利用して解析を行い、免疫に関係するパスウェイがいずれの解析でも有意であったため、HLA領域（HLA-BとHLA-DRB1）に注目し、タイピングを行い、免疫関連遺伝子、特にHLA-DRBの特定のアリル（HLA-DRB1*13:02）とパニック障害が関連することを初めて報告した（Shimada-Sugimoto et al., 2015）。そこで、さらに当該アリルの有無によりサンプルを分けて、患者-対照群比較を行ったところ、DRB1*13:02ネガティブ群では、これまでに白人集団のみでパニック障害の候補遺伝子として報告されていたTMEM132D遺伝子が日本人を用いた本研究においても有意であることを確認した（Shimada et al., 2016）
二つ目には環境要因の影響を考慮し、EWASを96名（年齢と性別をマッチさせた48症例と48対照群）に対してIllumina社製HumanMethylation450 Beadchipを用いて網羅的に行った。データの品質管理を通過した376,602プローブでみると、症例対象比較ではメチル化量の差は小さいものの、43プローブで有意な結果が得られた。有意な部位は93%がCpG部位に位置しており、パニック障害群では対照群に比べて低メチル化がみられた。さらに、EWASデータから得られた有意な43プローブの結果を用いてパスウェイ解析を行ったところ、「免疫機能の活性化の制御」や「細胞遊走や細胞の運動性」に関わるパスウェイが関連することが分かった。今後は、有意なメチル化部位について、パイロシークエンス法による再現実験やパスウェイ解析で得られた機能とパニック障害の関連について調べることとしている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
パニック障害と免疫（特にHLA-DRB）との関連についてさらに新しい知見を得たため、昨年度に引き続き、国際専門誌への報告を行った。また、パニック障害の全ゲノムDNAメチル化関連解析を行い、候補領域の絞り込みを行い、追加でメチル化解析の結果を用いたパスウェイ解析も行った。以上により、当初予定していた研究目的を達成しているといえる。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後の研究については、PAN・IC（Panic International Consortium）などのコンソーシアムを通じての他研究グループとの共同研究の継続（白人を中心とした不安障害サンプルとの比較検討）、特にHLA領域の詳細な検討を行う。さらに、今年度の全ゲノムDNAメチル化関連解析の結果見出された候補遺伝子領域の再現実験を引き続き行うこととしている。以上により、当初の研究計画の変更はない。
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| Causes of Carryover |
物品費について、実験操作を工夫したことにより使用残が生じた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
H27年度度の使用残については、H28年度に使用する予定である。
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[Journal Article] Genome-wide association study of autism spectrum disorder in the East Asian populations.2016
Author(s)
. Liu X, Shimada T, Otowa T, Wu YY, Kawamura Y, Tochigi M, Iwata Y, Umekage T, Toyota T, Maekawa M, Iwayama Y, Suzuki K, Kakiuchi C, Kuwabara H, Kano Y, Nishida H, Sugiyama T, Kato N, Chen CH, Mori N, Yamada K, Yoshikawa T, Kasai K, Tokunaga K, Sasaki T, Gau SS.
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Journal Title
Autism Research
Volume: 9(3)
Pages: 340-9
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Polymorphisms in the TMEM132D region are associated with panic disorder in HLA-DRB1*13:02-negative individuals of a Japanese population.2016
Author(s)
Shimada M, Otowa T, Miyagawa T, Khor SS, Omae Y, Toyo-oka L, Sugaya N, Kawamura Y, Umekage T, Miyashita A, Kuwano R, Kaiya H, Kasai K, Tanii H, Okazaki Y, Tokunaga K, Sasaki T.
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Journal Title
Human Genome Variation
Volume: 3
Pages: 1-7
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Anger tendency may be associated with duration of illness in panic disorder.2015
Author(s)
Sugaya N, Yoshida E, Yasuda S, Tochigi M, Takei K, Otowa T, Umekage T, Konishi Y, Sakano Y, Nomura S, Okazaki Y, Kaiya H, Tanii H, Sasaki T
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Journal Title
Biopsychosoc Med
Volume: 9:6
Pages: 1-7
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Novel rare variations of the oxytocin receptor (OXTR) gene in autism spectrum disorder individuals.2015
Author(s)
Liu X, Kawashima M, Miyagawa T, Otowa T, Latt KZ, Thiri M, Nishida H, Sugiyama T, Tsurusaki Y, Matsumoto N, Mabuchi A, Tokunaga K, Sasaki T.
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Journal Title
Human Genome Variation
Volume: 2
Pages: 1-7
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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