2014 Fiscal Year Research-status Report
半導体次世代シークエンサーを用いた胃がんバイオマーカーの探索
| Project/Area Number |
26462002
|
|---|
| Research Institution | Chiba Cancer Center (Research Institute) |
|---|
Principal Investigator |
滝口 伸浩 千葉県がんセンター(研究所), 消化器外科, 臨床検査部長 (00261917)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
|
| Keywords | 癌 / 遺伝子 / 外科 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
胃がん患者を早期発見できるバイオマーカーの同定を行うため、がんで高頻度に変異が見られる領域に限定しメガベースオーダーでのエクソーム解析をコホートスタディで追跡中に胃がんを発症した22例と健常者コントロール20例で行った。さらに3例の胃がん及びその非癌部について同様の解析を行い、同定された10か所の遺伝子変異をキャピラリーシークエンサーで確認した。その結果未知の変異3つを含む７か所の変異が確認され、1か所のみが、非癌部にも同様の変異が確認された。さら遺伝子変異や多型の解析を行うため、コホートでの胃がん発症例を追加し、胃がん40症例と健常40症例で行うため核酸の抽出を行った。また胃がん及び同一患者の非癌部から得られたDNAペアは約300症例ですでに抽出されており、これらの症例についての臨床情報の収集を行った。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
胃がん症例のコフォート研究から追跡調査での胃がんの発症症例のピックアップと核酸抽出が終了し、胃がん発症症例40例と非癌症例（75歳までがんの既往歴、家族歴がなく腫瘍マーカーが陰性であった症例）40例それぞれ男女20名ずつを集めることが出来た。このうち胃がん発症症例、非癌症例それぞれ20例の解析が終了し、残りそれぞれ20例のDNA抽出も終了した。さらにがんと非癌部の解析のパイロット研究およびその同定された変異のキャピラリーシークエンサーでの解析が終了し、おおむね良好な確認結果が得られた。この結果をもとにさらに解析を進めるため、Ion Torrent Protonのアップグレードされた新しい試薬での試験解析を進めており、次年度の胃がん及び非癌部でのバイオマーカーの同定を試みていく準備が初年度にほぼ整った。
|
| Strategy for Future Research Activity |
胃がん及び同一患者の非癌部から得られたDNAペアが300症例すでに収集されており、これらについての主ながん関連遺伝子の変異解析データが、共同研究で得られる予定である。これらのデータと症例の組織系、進行度、予後、及び治療経過、臨床情報を基に症例を40例ピックアップし、次世代シークエンサーを用いた解析を行う予定である。さらに共同研究により胃がんコホートで得られる生殖細胞遺伝子の変異・多型解析結果を加え、胃がんの発症や予後に関係するバイオマーカーの同定のための解析を進める。解析は409のがん関連遺伝子の全エクソンを解読することで、1.75Mbの領域の配列解読を癌および非癌部で行う。このことでHotSpot以外の比較的希少ながん関連遺伝子の機能的にがんに関与すると考えられるアミノ酸の変化や転写終了コドンを創出するミッセンスおよびナンセンスミューテーションを同定し、胃がんでの新たな機能関連遺伝子の同定を図る。
|
| Causes of Carryover |
初年度の研究は、研究所との共同研究で別予算によって進められたものを利用することが出来た。さらに腫瘍の解析を開始するにあたり、Ion Torrent Protonの試薬がアップグレードされより正確な解析が行えるとの情報がえられたため繰り越しを行い新しい試薬で研究を進めることとした。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
新しい試薬が4月より販売されたため昨年度繰り越し予算を用い、解析を行う計画である。
|
-
[Journal Article] Randomised phase III trial of adjuvant chemotherapy with oral uracil and tegafur plus leucovorin versus intravenous fluorouracil and levofolinate in patients with stage III colorectal cancer who have undergone Japanese D2/D3 lymph node dissection: final results of JCOG0205.2015
Author(s)
Shimada Y, Hamaguchi T, Mizusawa J, Saito N, Kanemitsu Y, Takiguchi N, Ohue M, Kato T, Takii Y, Sato T, Tomita N, Yamaguchi S, Akaike M, Mishima H, Kubo Y, Nakamura K, Fukuda H, Moriya Y
-
Journal Title
Eur J Cancer.
Volume: 50
Pages: 2231-2240
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Long-term quality-of-life comparison of total gastrectomy and proximal gastrectomy by Postgastrectomy Syndrome Assessment Scale (PGSAS-45): a nationwide multi-institutional study.2015
Author(s)
Takiguchi N, Takahashi M, Ikeda M, Inagawa S, Ueda S, Nobuoka T, Ota M, Iwasaki Y, Uchida N, Kodera Y, Nakada K.
-
Journal Title
Gastric Cancer.
Volume: 18
Pages: 407-416
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Sequential paclitaxel followed by tegafur and uracil (UFT) or S-1 versus UFT or S-1 monotherapy as adjuvant chemotherapy for T4a/b gastric cancer (SAMIT): a phase 3 factorial randomised controlled trial.2014
Author(s)
Tsuburaya A, Yoshida K, Kobayashi M, Yoshino S, Takahashi M, Takiguchi N, Tanabe K, Takahashi N, Imamura H, Tatsumoto N, Hara A, Nishikawa K, Fukushima R, Nozaki I, Kojima H, Miyashita Y, Oba K, Buyse M, Morita S, Sakamoto J.
-
Journal Title
Lancet Oncol.
Volume: 15
Pages: 886-893
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Double-blind, placebo-controlled, randomized phase II study of TJ-14 (hangeshashinto) for gastric cancer chemotherapy-induced oral mucositis.2014
Author(s)
Aoyama T, Nishikawa K, Takiguchi N, Tanabe K, Imano M, Fukushima R, Sakamoto J, Oba MS, Morita S, Kono T, Tsuburaya A.
-
Journal Title
Cancer Chemother Pharmacol.
Volume: 73
Pages: 1047-1054
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Long-term monitoring of serum p53 antibody after neoadjuvant chemotherapy and surgery for esophageal adenocarcinoma: report of a case.2014
Author(s)
Shimada H, Nagata M, Cho A, Takiguchi N, Kainuma O, Soda H, Ikeda A, Nabeya Y, Yajima S, Yamamoto H, Sugiyama T, Itami M.
-
Journal Title
Surg Today.
Volume: 44
Pages: 1957-1961
DOI
Peer Reviewed
-
[Presentation] Laparoscopic total gastrectomy with Roux en Y reconstruction; the benefits of intracorporeal anastomosis by hand-sewn purse-string suture2014
Author(s)
N. Takiguchi, M. Nagata, Y. Nabeya, A. Ikeda, O. Kainuma, H. Soda, A. Cho, T. Tonooka, H. Arimitsu, H. Yanagibashi, H. Yamamoto
Organizer
24th IASGO
Place of Presentation
Vienn (Austria)
Year and Date
2014-12-05 – 2014-12-07
-
-
[Presentation] Oncologic emergency surgery occurred during chemotherapy for metastatic colorectal cancer2014
Author(s)
Nobuhiro Takiguchi, Matsuo Nagata, Yoshihiro Nabeya, Atsushi Ikeda, Osamu Kainuma, Hiroaki Soda, Akihiro Cho, Toru Tonoka , Hiroshige Saito, Hidehito Arimitsu, Hiroo Yanagibashi, Ryousuke Kobayashi, Asahumi Chibana, Yukinari Tokoro, Hiroshi Yamamoto
Organizer
9th Scientific and Annual Meeting of the European Society of Coloproctology ESCP2014
Place of Presentation
Barcelona (Spain)
Year and Date
2014-09-24 – 2014-09-26
-
-
[Presentation] 胃癌術後腹膜播種再発に対する手術治療をともなったCDDP腹腔内化学療法2014
Author(s)
滝口伸浩, 鍋谷圭宏, 池田 篤, 貝沼 修, 早田浩明 趙 明浩, 外岡 亨, 斉藤洋茂, 柳橋浩男, 有光秀仁 小林亮介, 知花朝史, 所 為然, 永田松夫, 山本 宏
Organizer
第36回日本癌局所療法研究会
Place of Presentation
八尾市文化会館プリズムホール (大阪府・八尾市)
Year and Date
2014-06-27
-
[Presentation] ダブルトラクト再建法による腹腔鏡下噴門側胃切除術 手技の変遷と成績2014
Author(s)
滝口 伸浩, 永田 松夫, 鍋谷 圭宏, 池田 篤, 貝沼 修, 早田 浩明, 趙 明浩, 外岡 亨, 武藤 頼彦, 柳橋 浩男, 升田 貴仁, 山本 宏
Organizer
第114回日本外科学会総会
Place of Presentation
グランドプリンスホテル京都 (京都府・京都市)
Year and Date
2014-04-05
