2016 Fiscal Year Annual Research Report
Screening of biomarker of gastric cancer by using semiconductor-based next-gen sequencing
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26462002
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| Research Institution | Chiba Cancer Center (Research Institute) |
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Principal Investigator |
滝口 伸浩 千葉県がんセンター(研究所), 消化器外科・臨床検査部, 部長 (00261917)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 胃癌 / バイオマーカー / 遺伝子変異 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
欧米に比べ日本の胃がん罹患率は高く、ピロリ菌の除菌により罹患率減少は認められるが、2016年の胃がんによる死亡者数は未だ男性2位、女性3位と多くの患者の命を奪っている。優れた早期発見もしくは効果的治療法予測バイオマーカーが必要である。
胃がんマーカーには、EGFRやCEAが用いられているが、診断、治療効果判定、予後評価に有用なバイオマーカーとは必ずしも言えない。そこで、新たなバイオマーカーが探索できないか、もしくは治療前のバイオプシーや擦過、もしくは血中の細胞やDNAを利用してがんの治療、診断を試みることができないか等の検討を行うため、がん関連遺伝子400以上のExome解析を、胃がん症例100症例以上でIon Torrent Proton, Ion Torrent PGMシークエンサーを用いて検討した。この結果と当施設で同定した胃がんのリスクファクターと考えられるアミノ酸変化やストップコドンを示す多型（SNP）も比較検討した。遺伝子解読は、平均1000回程度の読みとり回数で、一症例あたり10万円以下で解析する当施設で確立した解析系を使用し、遺伝子解読解析による、遺伝子変異・多型・コピー数解析を一度に進め、臨床症状や既存の臨床所見、治療感受性などとの相関についても検討を行った。メガベースオーダーでシークエンスができる一般診療に普及可能な包括的バイオマーカー解析によって胃がんMutation Signatureを同定し、臨床診断また生殖細胞多型による胃がん治療薬剤決定、予後予測、リスク解析へ結びつける検討も行った。残念ながら、臨床初見との相関解析では有意な相関を示すものは得られなかったが、今後症例を増やし検討できればと考えている。また遺伝子機能に影響すると考えられる生殖細胞多型が本研究に伴い発見されたため、この多型と胃がんリスクの関連も今後検討が必要と考えている。
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Research Products
(11 results)
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[Journal Article] 2.Randomized clinical trial comparing standard diet with perioperative oral immunonutrition in total gastrectomy for gastric cancer2017
Author(s)
Ida S, Hiki N, Cho H, Sakamaki K, Ito S, Fujitani K, Takiguchi N, Kawashima Y, Nishikawa K, Sasako M, Aoyama T, Honda M, Sato T, Nunobe S, Yoshikawa T
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Journal Title
Br J Surg
Volume: 104
Pages: 377-383
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] 3.Panel of autoantibodies against multiple tumor-associated antigens for detecting gastric cancer.2017
Author(s)
Hoshino I, Nagata M, Takiguchi N, Nabeya Y, Ikeda A, Yokoi S, Kuwajima A, Tagawa M, Matsushita K, Satoshi Y, Hideaki S
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Journal Title
Cancer Sci
Volume: 108
Pages: 377-383
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] 5.Feasibility of weekly intraperitoneal versus intravenous paclitaxel therapy delivered from the day of radical surgery for gastric cancer: a preliminary safety analysis of the INPACT study, a randomized controlled trial2017
Author(s)
Kodera Y, Takahashi N, Yoshikawa T, Takiguchi N, Fujitani K, Ito Y, Miyamoto K, Takayama O, Imano M, Kobayashi D, Miyashita Y, Morita S, Sakamoto J
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Journal Title
Gastric Cancer
Volume: 20
Pages: 190-199
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The Present Status of Surgical and Endoscopic Treatment for Gastric Cancer Patients Aged 85 Years or Older2016
Author(s)
Takiguchi N, Nabeya Y, Shimazaki R, Ikeda A, Soda H, Tonooka T, Kainuma O, Imanishi S, Arimitsu H, Kobayashi R, Chibana T, Ishige F, Yamamoto H, Nagata M, Suzuki T.
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Journal Title
Gan To Kagaku Ryoho.
Volume: 43
Pages: 1508-1511
Peer Reviewed
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[Journal Article] 6.Specific Features of Dumping Syndrome after Various Types of Gastrectomy as Assessed by a Newly Developed Integrated Questionnaire, the PGSAS-452016
Author(s)
Tanizawa Y, Tanabe K, Kawahira H, Fujita J, Takiguchi N, Takahashi M, Ito Y, Mitsumori N, Namikawa T, Oshio A, Nakada K
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Journal Title
Dig Surg
Volume: 33
Pages: 94-103
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] The Present Status of the Surgical and Endoscopic Treatment for the Gastric Cancer Patients Aged 85 Years or Older2016
Author(s)
Nobuhiro Takiguchi, Takuto Suzuki*, Reiri Shimazaki, Yoshihiro Nabeya, Atsushi Ikeda, Hiroaki Soda, Toru Tonooka, Hidehito Arimitsu, Tomofumi Chibana, Hiroo Yanagimashi, Matsuo Nagata
Organizer
第40回国際外科学会世界大会
Place of Presentation
京都
Year and Date
2016-10-25
Int'l Joint Research
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[Presentation] 1．進行胃癌に対する術前化学療法を併用した胃癌集学的治療の成績と課題2016
Author(s)
滝口 伸浩, 鍋谷 圭宏, 池田 篤, 貝沼 修, 早田 浩明, 外岡 亨, 今西 俊介, 有光 秀仁, 小林 亮介, 佐々木 亘亮, 山本 宏
Organizer
第116回日本外科学会定期学術集会
Place of Presentation
大阪
Year and Date
2016-04-16
Int'l Joint Research
