CAGE法による新規大腸がん肺転移マーカーの同定

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26462136
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: 柳沼 行宏 順天堂大学, 医学部, 講師 (60338415)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 小見山 博光 順天堂大学, 医学部, 講師 (30348982) ; 高持 一矢 順天堂大学, 医学部, 准教授 (30397369) ; 河合 純 国立研究開発法人理化学研究所, 予防医療・診断技術開発プログラム, 副プログラムディレクター (30391923) ; 藤井 智明 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (10511420) [Withdrawn]
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: CAGE解析 / 腫瘍マーカー / 大腸がん / 肺転移 / 次世代シークエンサー / 転移マーカー / RNA発現解析

Outline of Annual Research Achievements

本研究では　次世代シークエンサーを用いて大腸癌肺転移に関与する遺伝子を突き止め，既存の診断法，治療法よりも精度の高い医療，臨床応用を確立することを目的とする．
近年，遺伝子の転写開始点を網羅的に解析するCAGE法（cap analysis of gene expression法）が開発された．そしてこの極めて定量性の高いCAGE法により，ヒトの18万を超える転写開始点と，それに由来する転写産物の発現量の網羅的解析が行われた．
本研究課題では，CAGE法を用いて，肺転移を伴う大腸癌症例を対象に，がん組織のmRNA発現の網羅的解析に取り組んでいる．
本研究の結果，大腸がん患者の術前検査において，肺転移を検出するシステムを確立することが可能になれば，これまでにない治療効果が期待できる．
臨床の場において治療の適応にも大きな影響を及ぼすことが予想され，医療に対してすぐにフィードバックできる貴重な研究である．

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究は，次世代シークエンサー（NGS）を用いて大腸癌肺転移に関与する遺伝子を突き止め，既存の診断法，治療法よりも精度の高い医療，臨床応用を確立することを目的としている．
今年度は肺転移を伴う大腸がん組織検体よりRNAを抽出して，CAGE法によるライブラリ調製などを行っている．対照群には転移を伴わない症例の検体を用いている．

Strategy for Future Research Activity

引き続きRNAの抽出作業，NGS解析を行い，情報学的解析に重点を置き，次世代シークエンサーにて得られて遺伝子発現データの網羅的解析を中心に研究を進めていく．これには，MA-plotによる候補遺伝子の同定だけでなく，GO解析，パスウェイ解析など，大腸がんの肺転移に関与するシグナルカスケードの評価を多角的に取り組む．
また，CAGE解析の症例数を増やしていくと共に，臨床情報のフォローアップ，多群比較により，逐次解析精度の向上を図る．

Causes of Carryover

一部の実験が、研究室現存の資材でまかなうことが可能であったこと、また検体の一部のRNAを作成し，CAGE法を再度行う事になったため，予算を来年度に持ち越した．また高速冷却遠心機一式 についても他予算で購入が可能となった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

今後、再度，大腸がん、肺転移のCAGE解析を行い、肺転移特異的な腫瘍マーカーの絞込みを進める．さら発現解析を進め，大腸がん肺転移マーカーの特定を目指す．
これらに用いる試薬に予算を計上するほか、28年度には膨大に蓄積しつつあるデーター解析を行うためのアルバイトも雇用する予定である。

Research Products

• [Journal Article] StageIII結腸・直腸S状部癌における決定期分析を用いたデータマイニングによる予後解析 (2016)
  • Author(s): 杉本起一，丹羽浩一郎，石山 隼，神山博彦，小見山博光，高橋 玄，小島 豊，五藤倫敏，冨木裕一，坂本一博
  • Journal Title: 日本外科系連合学会雑誌 (掲載決定) Volume: 41 Pages: 0000
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Impact of chromosome 17q deletion in the primary lesion of colorectal cancer on liver metastasis (2016)
  • Author(s): Kawai M, Komiyama H, Hosoya M, Okubo H, Tomoaki Fujii, Yokoyama, N, Sato C, Ueyama T, Okuzawa A, Goto M, Kojima Y, Takahashi, M Sugimoto K, Ishiyama S, Munakata S, Ogura,D, Niwa S, Tomiki Y Ochiai T, Sakamoto K
  • Journal Title: Oncology Letters Volume: 11 Pages: 0000
• [Journal Article] Single-Incision Laparoscopic Colostomy or Ileostomy for Unresectable Colorectal Cancer (2015)
  • Author(s): Kawai M, Sakamoto K, Tomiki Y, Okuzawa A, Goto M, Kojima Y, Takahashi M, Komiyama H, Sugimoto K, Ishiyama S, Niwa K, Tashiro Y, Munakata S, Takehara K
  • Journal Title: Juntendo Medical Journal Volume: 58（6）: Pages: 153-157
  • Open Access
• [Journal Article] Inhibition of plasmin protects against colitis in mice by suppressing matrix metalloproteinase 9-mediated cytokine release from myeloid cells. (2015)
  • Author(s): Munakata S, Tashiro Y, Nishida C, Sato A, Komiyama H, Shimazu H, Dhahri D, Salama Y, Eiamboonsert S, Takeda K, Yagita H, Tsuda Y, Okada Y, Nakauchi H, Sakamoto K, Heissig B, Hattori K.
  • Journal Title: Gastroenterology Volume: 148 Pages: 565-578
  • DOI: doi: 10.1053/j.gastro.2014.12.001.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] The detection of colorectal CTC by the use of polymeric microfluidic devices (2015)
  • Author(s): 呉一眞，細谷理樹，小見山博光，冨木裕一，落合 匠，大永崇，坂本一博
  • Organizer: 第74回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2015-10-08 – 2015-10-10
• [Presentation] Patient-derived colon carcinoma cells disseminate into distant organs in various different fashionｓ (2015)
  • Author(s): Okazawa Y, Mizukoshi K, Komiyama H, Fujii T, Goto M, Hino O, Sakamoto K, Orimo A
  • Organizer: 第74回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2015-10-08 – 2015-10-10
• [Presentation] Metastatic seeding of patient-derived colon cancer cells maintaining epithelial or mesenchymal trait (2015)
  • Author(s): 水越 幸輔，岡澤 裕 ，門脇奈穂美，小見山博光，小島 豊，五藤 倫敏，垣生 園子，樋野 興夫，折茂 彰 ，坂本 一博
  • Organizer: 第70回日本消化器外科学会総会
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2015-07-15 – 2015-07-17
• [Presentation] Comparisons of long-term outcomes for locally advanced colon cancer between laparoscopic colectomy and open colectomy; propensity score analysis (2015)
  • Author(s): Sugimoto K, Sakamoto K, Tomiki Y, Goto M, Kojima Y, Komiyama H, Takahashi M, Kamiyama H, Ishiyama S, Niwa K, Ito S, Kawai M, Takehara K, Tashiro T, Munakata S, Aoki J, Okazawa Yu O, Takahashi R, Mizukoshi K, Ro H, Ichikawa R, Kure K, Honjyo K, Tsukamoto R.
  • Organizer: 23th International Congress of the EAES
  • Place of Presentation: Bucharest, Romania
  • Year and Date: 2015-06-03 – 2015-06-06
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] CHFR methylation is an independent prognostic marker of poor prognosis in gastric cancer (2015)
  • Author(s): Sugimoto K, Humbert A, Lu Z, Chen C, Rodgers K, Lee,B Griffin C, Sato K, Orita H, Ito T, Komiyama H, Kojima Y, Goto M, Tomiki Y, Sakamoto K, Brock M
  • Organizer: 2015 American Association for Cancer Research Annual Meeting
  • Place of Presentation: Pennsylvania, USA
  • Year and Date: 2015-04-18 – 2015-04-22
  • Int'l Joint Research
• [Remarks] 順天堂大学 下部消化管外科
  • URL: http://www.juntendo.ac.jp/graduate/laboratory/labo/kabusyoukakan/