ゲノムワイド疾患関連遺伝子解析による尿路結石の再発診断マーカー確立

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26462450
• Research Institution: Nagoya City University
• Principal Investigator: 金本 一洋 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (30381825)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 郡 健二郎 名古屋市立大学, その他部局等, 学長 (30122047) ; 安藤 亮介 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (30381867) ; 戸澤 啓一 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (40264733) ; 安井 孝周 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40326153) ; 岡田 淳志 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (70444966)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: 尿路結石 / ゲノムワイド解析 / マルチプレックス解析 / マクロファージ

Outline of Annual Research Achievements

1. ゲノムワイド解析結果(GWAS)に基づいた関連遺伝子のハプロタイプ解析：私たちが実施したゲノムワイド解析結果(GWAS)の結果同定された結石関連候補遺伝子であるGPM6A・SHISA6 の転写産物について発現解析と、4p, 7q 領域のSNPs タイピングを行う予定であった。しかし、前年度報告書の通り、追加のGWASを行った結果、5q35.3、7p14.3、13q14.1の3領域に結石と関連を強く示唆する領域を同定した。本年度は、ゲノムデータを元にこの領域がそれぞれRGS14,FAM188B, DGKH 遺伝子上に位置することを確認し、プライマー設計や尿中関連因子の探索を進めた。
2. 結石患者・健常者間における血中・尿中の腎結石関連マーカー解析：結石患者・健常者の血液・尿より結石関連蛋白を同時測定する。昨年度尿検体について複数の候補因子を同定したが、再現性を担保するため、新たに検体を採取し、約250名の患者を検討したところ、尿路結石患者に置いてIL-4, G-CSF, IL-1aが低値である可能性が示された。次年度は、この解析精度を上げるため、外部受託での統計解析を行い、前向き研究に繋げる。
3. 腎結石の再発リスク診断法の確立に向けた前向きコホート研究：1. 2. の結果に基づき、再発・非再発群のDNA、血液、尿を用いた前向きコホート研究を行う予定であるが、上記データ結果を確認した上で開始する。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

1. ゲノムワイド解析結果に基づいた関連遺伝子のハプロタイプ解析：本年度は、ゲノムデータを元にこの領域がそれぞれRGS14,FAM188B, DGKH 遺伝子上に位置することを確認できたが、この診断のためのELISAおよび定量PCR、抗体のワークを確認するのに難渋しているため。
2. 結石患者・健常者間における血中・尿中の腎結石関連マーカー解析：新たに検体を採取し、約250名の患者を検討したところ、尿路結石患者に置いてIL-4, G-CSF, IL-1aが低値である可能性が示され、想定以上の結果となっている。
3. 腎結石の再発リスク診断法の確立に向けた前向きコホート研究：1. 2. の結果に基づき、再発・非再発群のDNA、血液、尿を用いた前向きコホート研究を行う予定であるが、上記データ結果を確認した上で実施するため、まだ開始できていない。

Strategy for Future Research Activity

1. ゲノムワイド解析結果に基づいた関連遺伝子のハプロタイプ解析：GPM6A, SHISA6, RGS14,FAM188B, DGKH 遺伝子に関するELISAおよび定量PCR、抗体のワークを確認し、尿路結石患者の尿／腎乳頭部組織の免染に用いる。
2. 結石患者・健常者間における血中・尿中の腎結石関連マーカー解析：統計学的な外部受託を用い、結果の適性を判断する。
3. 腎結石の再発リスク診断法の確立に向けた前向きコホート研究：1. 2. の結果に基づき、前向きコホート研究を行う予定である。