2016 Fiscal Year Annual Research Report
Establishment of diagnostic markers for recuccent stone disease by genome-wide associated analysis.
Project/Area Number |
26462450
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Research Institution | Nagoya City University |
Principal Investigator |
金本 一洋 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 研究員 (30381825)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
郡 健二郎 名古屋市立大学, その他部局等, 学長 (30122047)
安藤 亮介 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 助教 (30381867)
戸澤 啓一 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 准教授 (40264733)
安井 孝周 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 教授 (40326153)
岡田 淳志 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 講師 (70444966)
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Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | 尿路結石 / マクロファージ / 結石消失 / ケモカイン / サイトカイン / ゲノムワイド関連解析 / SNP / マルチプレックス解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
1. ゲノムワイド解析結果(GWAS)に基づいた関連遺伝子のハプロタイプ解析:本年度計画に基づき、これまでのGWASデータを元に抽出したSNP領域が所属するRGS14,FAM188B, DGKH 遺伝子についてのヒト遺伝子解析研究として施設承認を得た。現在患者同意のもと検体採取を継続しており、予定検体数に達し次第、解析を開始する予定である。 2. 結石患者・健常者間における血中・尿中の腎結石関連マーカー解析:本年度の計画に基づき、患者一時尿25μlを用いたMagPix装置によるマルチプレックス解析のデータを、解析精度を上げるため外部受託での統計解析を行った。その結果、単変量ロジスティック解析において健常群と初発群の比較において、IL-1a,IL-4が単独で有意なリスク因子であることを確認した。また健常群と結石群(初発群+再発群)の比較では、単変量ロジスティック解析において有意なAUC値を得られなかったため、多変量ロジスティック回帰分析を行った結果、IL-4またはIL-1aにIL-1bとGM-CSFを組み合わせることによってAUC値が増加することを見出した。さらに健常群、初発群、再発群の3群比較のために行った多項ロジットモデル解析では、IL-4にIL-10, IL-1b, GM-CSFおよび尿中Mgを組み合わせることによって、予測精度が82.61%まで増加することを見出した。 3. 腎結石の再発リスク診断法の確立に向けた前向きコホート研究:1. 2. の結果に基づき、再発・非再発群のDNA、血液、尿を用いた前向きコホート研究を行う予定であるが、上記データ結果を確認した上で開始する。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Genomic landscape of experimental bladder cancer in rodents and its application to human bladder cancer: gene amplification and potential overexpression of Cyp2a5/CYP2A6 are associated with the invasive phenotype.2016
Author(s)
Kanemoto Kazuhiro, Fukuta Katsuhiro, Kawai Noriyasu, Tozawa Keiichi, Ochiai Masako, Okamoto Koji, Ohnami Sumiko, Sakamoto Hiromi, Yoshida Teruhiko, Kanai Yae, Katoh Masaru, Yasui Takahiro, Kohri Kenjiro, Kakizoe Tadao, Nakagama Hitoshi
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Journal Title
PLoS One
Volume: 30
Pages: e0167374
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] The effect of green tea for the early period of renal crystal formation.2016
Author(s)
Hirose Masahito, Unno Rei, Banno Rika, Taguchi Kazumi, Fujii Yasuhiro, Hamamoto Shuzo, Kanemoto Kazuhiro, Okada Atsushi, Sakakura Takeshi, Tozawa Keiichi, Kohri Kenjiro, Yasui Takahiro
Organizer
13th International Symposium on Urolithiasis
Place of Presentation
幕張メッセ(千葉県千葉市)
Year and Date
2016-07-19 – 2016-07-22
Int'l Joint Research
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