2015 Fiscal Year Research-status Report
根と胚軸における正と負の重力屈性を決定付ける遺伝子発現制御機構の解明
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26506016
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
筧 雄介 横浜市立大学, 付置研究所, 特任助教 (50636727)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | トランスクリプトーム / オーキシン / 重力 / シロイヌナズナ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
前年度に開発したオーキシン合成の最終ステッフを担う酵素YUCCAを阻害する新型のオーキシンの合成阻害剤BBo、PPBoについて論文発表を行った。（Kakei Y., Yamazaki C., Suzuki M., Nakamura A., Sato A., Ishida Y., Kikuchi R., Higashi S., Kokudo Y., Ishii T., Soeno K. and Shimada Y. (2015) Small molecule auxin inhibitors that target YUCCA are powerful tools for studying auxin function. The Plant Journal, doi:10.1111/tpj.13032）新型オーキシン合成阻害剤やこれまでに報告されているオーキシン合成、シグナリング、輸送の阻害剤処理をしたシロイヌナズナのトランスクリプトームを用意し、共通した変動、異なる変動についてクラスター解析した。前年度までのAtCAST解析により判明していたオーキシン合成、シグナリング変異体の遺伝子発現変化と統合して、場合によってオーキシン濃度に応答するものと、常にオーキシン濃度に応答する遺伝子発現変化を区別した。これらの成果について国際学会Pacifichemにて発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
各種オーキシン阻害剤、オーキシン合成、シグナリング変異体の遺伝子発現変化と統合して、場合によってオーキシン濃度に応答するものと、常にオーキシン濃度に応答する遺伝子発現変化を区別した。その中で特に場合によってオーキシン濃度変化に応答する遺伝子群に注目し、遺伝子プロモーター領域からのシスエレメントの予測とその機能証明実験を行った。その結果、新しく予測されたシスエレメントを欠損させた場合にオーキシン濃度に依存した遺伝子発現応答がなくなることが見出された。このシスエレメントは特に低いオーキシン濃度範囲のみで働くと考えられ、オーキシン濃度範囲による発現制御の違いに機能する仕組みの一部を明らかにすることができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
各種オーキシン阻害剤、オーキシン合成、シグナリング変異体の遺伝子発現変化と低濃度範囲特異的オーキシン応答に関わるシスエレメントについて学会発表及び論文発表を行う。また、低濃度範囲特異的オーキシン応答に関わるシスエレメントがシロイヌナズナの根や地上部において重力と反対側の、オーキシン極性輸送でオーキシン濃度が低くなっていると報告されている部位で機能しているかどうかを調べていく予定である。
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| Causes of Carryover |
トランスクリプトームの比較解析データベースAtCAST3.1の開発と公開されているオーキシン関連トランスクリプトームデータの収集により、低濃度オーキシンに関わるトランスクリプトームデータを実験により用意する必要がなくなったため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
研究補助の技術員を雇い、低濃度オーキシン濃度範囲で発現が制御されている遺伝子の機能の解明を行う。
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[Journal Article] Small molecule auxin inhibitors that target YUCCA are powerful tools for studying auxin function.2015
Author(s)
Kakei Y., Yamazaki C., Suzuki M., Nakamura A., Sato A., Ishida Y., Kikuchi R., Higashi S., Kokudo Y., Ishii T., Soeno K. and Shimada Y.
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Journal Title
Plant J.
Volume: 84(4)
Pages: 827-37
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] Phenylboronic acid analogs are effective auxin biosynthesis inhibitors targeting YUCCA2016
Author(s)
Yusuke Kakei, Chiaki Yamazaki, Masashi Suzuki, Ayako Nakamura, Akiko Sato, Yosuke Ishida, Rie Kikuchi, Shouichi Higashi, Yumiko Yamasaki-Kokudo, Takahiro Ishii, Kazuo Soeno, Yukihisa Shimada
Organizer
第57回日本植物生理学会年会
Place of Presentation
盛岡
Year and Date
2016-03-18 – 2016-03-20
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[Presentation] Auxin biosynthesis inhibitor effectively targets YUCCA2015
Author(s)
Yusuke Kakei, Chiaki Yamazaki, Masashi Suzuki, Ayako Nakamura, Akiko Sato, Yosuke Ishida, Rie Kikuchi, Shouichi Higashi, Yumiko Yamasaki-Kokudo, Takahiro Ishii, Kazuo Soeno, Yukihisa Shimada
Organizer
Pacificjem 2015
Place of Presentation
Honolulu
Year and Date
2015-12-15 – 2015-12-20
Int'l Joint Research
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