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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Modelling viscoelastic dynamics of organ morphogenesis and its numerical analysis

Research Project

Project/Area Number 26540158
Research InstitutionAkita Prefectural University

Principal Investigator

石本 志高  秋田県立大学, システム科学技術学部, 准教授 (30391858)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords細胞・組織・器官 / 形態形成 / 数理モデル / コンピュータシミュレーション / 粘弾性 / 発生・分化 / データ解析 / 生物物理
Outline of Annual Research Achievements

Drosophila 翅外形をひも状曲げ弾性体とした翅形成力学モデルを定式化した。これは、翅外形が主に縁部の固さによって規定される力学モデルである。逆に形態を与えれば相対的な固さ分布も算出でき、杉村氏(京都大)と共に実験画像より算出した。また、内部を均一な粘弾性体とする動力学モデルの定式化を行った。翅内部に一定の圧力・張力を与えるモデルである。これに基づき、張力ありの状況で特徴的な、内側にくぼんだ翅外形の解を例示し、その条件を整理した。最終年度は、翅外形モデルを他の昆虫に拡張し、固さ分布の算出および、内部を細胞頂点モデルに置き換えた混合モデルを構築し、これらの結果を論文誌に投稿した。
本研究は、器官サイズの粘弾性に着目した動力学数理モデルの構築を目指したものである。細胞内力学装置による形態形成は、器官サイズのパターン形成を含み、この力学装置を実装した多細胞モデルは本研究の目的と合致する。細胞頂点モデルに細胞内圧力、細胞境界張力、細胞境界曲率を導入した上皮組織動力学モデルを構築した。これを基礎に富樫氏(神戸大医)らと共にマウス嗅上皮の形態形成における組織パターンの研究を行った。マウス嗅上皮における接着性分子は力学装置でありミクロな粘弾性そのものである。これらの役割を生物学的および動力学的に解明し、当該組織パターン形成の基礎メカニズムを明らかにした。最終年度は、産後の形態形成を視野に入れた予備研究を行った。また上記とは別に、実際のマウス歯牙(粘弾性体)の形成において変形を定量化する研究を辻氏(理研)らと行い、論文を出版した。
これらの結果は、比較的少ない侵襲的操作から、器官・組織の粘弾性情報の測定・推定を可能とし、生命情報学において重要な意義を持ち、またこの結果より幾つかのメカニズム解明につながり、生体をひもとく上での重要な知見となった。

Remarks

個人ページにて、論文発表情報および研究内容の紹介を簡易的に記載。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Coordination of Cellular Dynamics Contributes to Tooth Epithelium Deformations2016

    • Author(s)
      Morita, R., Kihira, M., Nakatsu, Y., Nomoto, Y., Ogawa, M., Ohashi, K., Mizuno, K., Tachikawa, T., Ishimoto, Y., Morishita, Y., Tsuji, T.
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 11 Pages: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0161336

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Simulations on biomaterials towards multiscale realization2017

    • Author(s)
      Ishimoto, Y.
    • Organizer
      5th International Symposium of the Mathematics on Chromatin Live Dynamics in March, 2017
    • Place of Presentation
      Higashi-Hiroshima Arts & Culture Hall Kurara, Japan
    • Year and Date
      2017-03-07 – 2017-03-09
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bubbly vertex model for viscoelastic properties of epithelial tissues2017

    • Author(s)
      石本 志高
    • Organizer
      日本機械学会バイオエンジニアリング講演会
    • Place of Presentation
      名古屋市, ウィンクあいち
    • Year and Date
      2017-01-19 – 2017-01-20
  • [Presentation] バイオマテリアルシミュレーション~染色体・生体膜・細胞シート~2016

    • Author(s)
      石本 志高
    • Organizer
      研究会「シミュレーションシンポジウム in Akita」
    • Place of Presentation
      由利本荘市, 秋田県立大学本荘キャンパス
    • Year and Date
      2016-11-11 – 2016-11-11
  • [Presentation] Bubbly vertex dynamics for viscoelastic epithelial tissues2016

    • Author(s)
      Ishimoto, Y.
    • Organizer
      11th India-Japan Conference BICON-2016
    • Place of Presentation
      Biyani University, India
    • Year and Date
      2016-10-19 – 2016-10-22
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 昆虫の翅外形多様性に関する翅形成力学モデル2016

    • Author(s)
      石本 志高, 杉村 薫
    • Organizer
      研究会「理論と実験2016」
    • Place of Presentation
      東広島市, 広島大学
    • Year and Date
      2016-10-07 – 2016-10-08
  • [Presentation] Bubbly Vertex Modelによる粘弾性組織力学2016

    • Author(s)
      石本 志高
    • Organizer
      日本流体力学会年会2016
    • Place of Presentation
      名古屋市, 名古屋工業大学
    • Year and Date
      2016-09-26 – 2016-09-28
  • [Presentation] Bubbly vertex dynamics for viscoelastic epithelial tissues2016

    • Author(s)
      Ishimoto, Y.
    • Organizer
      International Soft Matter 2016
    • Place of Presentation
      Grenoble, France
    • Year and Date
      2016-09-12 – 2016-09-16
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] Yukitaka Ishimoto, Dr

    • URL

      http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~yukitaka.ishimoto/

  • [Remarks] Research Gate: Yukitaka Ishimoto - Publications

    • URL

      https://www.researchgate.net/profile/Yukitaka_Ishimoto/publications

  • [Remarks] 秋田県立大学 研究者総覧

    • URL

      http://www.akita-pu.ac.jp/stic/souran/scholar/detail.php?id=308

URL: 

Published: 2018-01-16  

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