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2014 Fiscal Year Research-status Report

実験用マテリアル・リソースの引用にもとづく新しい研究機関影響度指標の開発

Research Project

Project/Area Number 26540170
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

天野 晃  独立行政法人理化学研究所, バイオリソースセンター, 特別任期制研究員 (20622012)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 角田 裕之  鶴見大学, 文学部, 教授 (30454961)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsバイオリソース / 研究機関評価 / 研究機関影響度
Outline of Annual Research Achievements

開始当初、試験的な実施として、当研究所(理研BRC)の利用者成果(バイオリソースの利用が判明している論文)を対象に、PMCをソースとして論文ID(pmid)をマッチさせ、ある程度の存在と、実際のリソース利用に関する記述を確認した。この作業をもとに以下の計画のための技術的基盤を確立した(https://github.com/kouamano/KAKEN-26540170)。また、この試験結果をもとに、バイオリソースの引用記述パターンの検索対象を、論文の謝辞部分と材料部分に限定した。
[既知機関名の決定]バイオリソースの引用に関する記述パターンを決定するための機関名として、NBRP参画機関を対象とした。
[既知バイオリソース名の決定]バイオリソースの引用に関する記述パターンを決定するためのバイオリソース名として、NBRPよりダウンロード可能な利用者成果を対象とした(http://rrc.nbrp.jp/referenceListAction.do)。
[評価対象機関名の決定]評価対象を決定するため、PMC登録論文の著者所属より機関名を抽出中である。著者所属の表現にはさまざまなそれが含まれるため、カンマ(,)を区切りとするフレーズを、引用パターン検索対象であるPMC論文の謝辞部分と材料部分に対してヒットさせ、ヒットしたものを候補とし、さらに候補をハンドサーチにより絞り込む作業を行っている。
[バイオリソース名データベース作成]当初バイオリソース名のデータベースを作成することを計画していたが、バイオリソース名のパターンのバラエティが非常に高く、効果に疑問があるためにこれを行わないこととした。この場合においても、一部のバイオリソース名を利用し、バイオリソースの引用記述パターン抽出は可能である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

やや遅れている最大の理由は、バイリソース名データベースの構築が困難であったため。最終的にデータベースを作成しない計画へ変更した。この場合においても、最終的な目標に変更はない。

Strategy for Future Research Activity

計画に遅れが生じている点、および、バイオリソース名データベースの構築ができなかったことを除き、当初の計画に即して研究を進める予定である。バイオリソース名データベースの代わりとして、一部の判明しているバイオリソース名セットを用いることで対応する。

Causes of Carryover

ストレージの購入金額が当初計画時よりも低かったこと、および、ワールドハイヤーエデュケーションが販売されなくなり購入できなかったことによる。

Expenditure Plan for Carryover Budget

データのアノテーション等の人件費または委託費として使用予定。

  • Research Products

    (4 results)

All 2015 2014 Other

All Presentation (2 results) Remarks (2 results)

  • [Presentation] 実験用生物資源情報に基づく提供機関評価の試み2015

    • Author(s)
      天野晃, 角田裕之, 石川大介
    • Organizer
      NISTEPデータ・情報基盤ワークショップ
    • Place of Presentation
      科学技術・学術政策研究所, 東京都
    • Year and Date
      2015-02-04
  • [Presentation] インパクト計量のための新しい要素:実験用生物資源2014

    • Author(s)
      天野晃, 角田裕之, 石川大介
    • Organizer
      情報メディア学会第16回研究会
    • Place of Presentation
      日本大学医学部板橋キャンパス, 東京都
    • Year and Date
      2014-11-22
  • [Remarks] kouamano/KAKEN-26540170

    • URL

      https://github.com/kouamano/KAKEN-26540170

  • [Remarks] Index of /~kamano/data

    • URL

      http://134.160.64.152/~kamano/data/

URL: 

Published: 2016-05-27  

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