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2015 Fiscal Year Annual Research Report

DNA損傷記憶のエピジェネティクス解析

Research Project

Project/Area Number 26550028
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

井倉 正枝  京都大学, 放射線生物研究センター, 研究員 (40535275)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
KeywordsDNA損傷記憶 / ヒストン化学修飾 / クロマチン構造変換 / クロマチン免疫沈降
Outline of Annual Research Achievements

DNA損傷の周辺のヒストンのアセチル化、リン酸化、メチル化など様々な化学修飾は、損傷領域でのクロマチン構造変換に加え、DNA損傷応答シグナル制御に関与していることが知られている。DNA修復が完了したあともこれらヒストンの化学修飾は、DNA損傷を受ける前の状態に戻るのか、あるいは修復はされてもかつて損傷があったことを示す目印としてそれら修飾が維持されているのかについて検討することが、本課題の目的である。
これまでにIL2-R/DRGFPカセット発現細胞をU2OS細胞で作成し、I-Sce1によるDNA二本鎖切断を行い、DNA修復が完了したことを示すGFP Positive細胞をマグネットビーズを付与したIR2-Rの抗体でsortingした。現在、sorting によって回収した細胞を用いてクロマチン免疫沈降によってDNA損傷が修復した領域でのヒストンの化学修飾の状態を検討している。その一方で、我々は、定量プロテオミクス解析によって放射線障害によって引き起こされるH2AXのアセチル化とリン酸化の度合いが、細胞ごとに異なることを見出しており、このことからDNA損傷が修復された領域でのヒストンの化学修飾の状態は多様であることが示唆される。またIL2-R/DRGFPカセットが挿入されている領域が、ヘテロクロマチン領域かあるいはユークロマチン領域かで得られる結果に違いが生じる可能性があるのでこの点に関しては幾つかのクローンで検討することも昨年より始めているが、この点については、クロマチン免疫沈降法でヘテロクロマチン蛋白質HP1の濃縮を見定めることにより解決しようと考えている。

  • Research Products

    (9 results)

All 2016 2015

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Coordinated regulation of TIP60 and PARP-1 in damaged chromatin dynamics2016

    • Author(s)
      Ikura M
    • Journal Title

      Mol. Cell. Biol.

      Volume: Epub ahead of print Pages: In press

    • DOI

      10.1128/MCB.01085-15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Disruption of DNA Damage-Response by Propyl Gallate and 9-Aminoacridine2016

    • Author(s)
      Matsuda S
    • Journal Title

      Toxicological Sciences

      Volume: 150 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1093/toxsci/kfw039

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear pyruvate kinase M2 complex serves as a transcriptional coactivator of arylhydrocarbon receptor.2016

    • Author(s)
      Matsuda S
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 44 Pages: 636-647

    • DOI

      10.1093/nar/gkv967

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acetylation of histone H2AX at Lys 5 by the TIP60 histone acetyltransferase complex is essential for the dynamic binding of NBS1 to damaged chromatin.2015

    • Author(s)
      Ikura M
    • Journal Title

      Mol. Cell. Biol.

      Volume: 35 Pages: 4147-4157

    • DOI

      10.1128/MCB.00757-15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] hCAS/CSE1L regulates RAD51 distribution and focus formation for homologous recombinational repair2015

    • Author(s)
      Okimoto S
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 20 Pages: 681-694

    • DOI

      10.1111/gtc.12262

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Absolute quantification of acetylation and phosphorylation of the histone variant H2AX upon ionizing radiation reveals distinct cellular responses in two cancer cell lines2015

    • Author(s)
      Matsuda S
    • Journal Title

      Radiat. Environ. Biophys.

      Volume: 54 Pages: 403-411

    • DOI

      10.1007/s00411-015-0608-3

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNA損傷応答における動的クロマチン平衡とその意義2015

    • Author(s)
      井倉 毅
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] DNAチェックポイント因子Rad9の分解を促進するCdk-Plk1依存的機構2015

    • Author(s)
      郡司未佳
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] ピルビン酸キナーゼとピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体によるアセチルCoAの治産池消モデル2015

    • Author(s)
      松田俊
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04

URL: 

Published: 2017-01-06  

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