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2015 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝子生物工学に基づくホタル生物発光の設計制御と定量計測

Research Project

Project/Area Number 26610081
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

秋山 英文  東京大学, 物性研究所, 准教授 (40251491)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 樋山 みやび  東京大学, 物性研究所, 研究員 (90399311)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords生物発光 / 酵素 / ルシフェラーゼ / ルシフェリン / 分光
Outline of Annual Research Achievements

H27年度は、前年度からの開発を完成させ、絶対値定量計測装置の対応波長域を400nmまでカバーできるように装置と校正ツールの開発を行い、15%程度の不確かさで発光絶対量を決定できるようになった。陸上生物であるホタル生物発光は、発光ピークが560nm-600nmのものが代表的であるが、他の生物発光、特に海洋生物の場合には、青色の発光系が多く、それらに対応できる体制が整った。実際にこの系を用いて、遺伝子工学的手法を用いて生合成された、オワンクラゲの発光系であるイクオリンについて、定量計測を行った。遺伝子工学的に作られたイクオリンは、アミノ酸残基配列が正確にわかるので、1分子あたりの各種のアミノ酸残基含有量がわかる。アミノ酸分析を行うことで、測定に用いた試料溶液のイクオリン濃度を正確に定量した。これらの実験から、イクオリン生物発光の量子収率を決定することが出来た。下村らの測定結果との比較・検証を行った。
生物発光制御機構の理解に向けて、ホタル生物発光のルシフェラーゼやオワンクラゲ生物発光のイクオリンなどのタンパク質酵素の動的な構造を、分子動力学計算によりシミュレートした。また、一方で、反応基質であるルシフェリンやセレンテラジンの反応中間体や反応生成物に対する量子化学計算を水溶液中の場合について行った。水和効果すなわち水分子の配置と水素結合の効果をpH依存性も含めて取り入れるため、分極連続体媒質モデルを用いて行う量子化学計算結果に対して、モデル分子の実験結果として得られるpKaの値を用いて補正を行うアプローチを試み、無矛盾の結果を得た。理論的妥当性の検証や、タンパク質背景を含めた計算を進めてゆく前段階の試行研究として有意義であった。

  • Research Products

    (21 results)

All 2016 2015

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Calibration standards and measurement accuracy of absolute electroluminescence and internal properties in multi-junction and arrayed solar cells2016

    • Author(s)
      Masahiro Yoshita, Lin Zhu, Changsu Kim, Toshimitsu Mochizuki, Tetsuya Nakamura, Mitsuru Imaizumi, Shaoqiang Chen, Hidehiro Kubota, Yoshihiko Kanemitsu, and Hidefumi Akiyama
    • Journal Title

      in Proc. of SPIE Photonics West

      Volume: 9743 Pages: 97430D1-6

    • DOI

      10.1117/12.2211726

  • [Journal Article] Absolute Electroluminescence Imaging of Multi-Junction Solar Cells and Calibration Standards2015

    • Author(s)
      Masahiro Yoshita, Lin Zhu, Changsu Kim, Hidefumi Akiyama, Shaoqiang Chen, Toshimitsu Mochizuki, Hidehiro Kubota, Tetsuya Nakamura, Mitsuru Imaizumi, Yoshihiko Kanemitsu
    • Journal Title

      The 42nd IEEE Photovoltaic Specialists Conference Proceedings

      Volume: 7356199 Pages: 1-4

    • DOI

      10.1109/PVSC.2015.7356199

  • [Journal Article] Effect of very High magnetic field on the optical properties of firefly light emitter oxyluciferin2015

    • Author(s)
      Weihang Zhou, Daisuke Nakamura, Yu Wang, Toshimitsu Mochizuki, Hidefumi Akiyama, Shojiro Takeyama
    • Journal Title

      Journal of Luminescence

      Volume: 165 Pages: 15-18

    • DOI

      10.1016/j.jlumin.2015.04.009

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] On the importance of cavity-length and heat dissipation in GaN-based vertical-cavity surface-emitting lasers2015

    • Author(s)
      W. J. Liu, X. L. Hu, L. Y. Ying, S. Q. Chen, J. Y. Zhang, H. Akiyama, Z. P. Cai, B. P. Zhang
    • Journal Title

      Scientific Reports 5

      Volume: 5 Pages: 9600

    • DOI

      10.1038/srep09600

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vibronic structures in absorption and fluorescence spectra of firefly oxyluciferin in aqueous solutions2015

    • Author(s)
      Miyabi Hiyama, Yoshifumi Noguchi, Hidefumi Akiyama, Kenta Yamada, Nobuaki Koga
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol

      Volume: 91 Pages: 819-827

    • DOI

      10.1111/php.12463

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Stability of keto-, enol-, enolate-type oxyluciferin anions in aqueous solutions2016

    • Author(s)
      Yoshifumi Noguchi, Miyabi Hiyama, Motoyuki Shiga, Osamu Sugino, Hidefumi Akiyama
    • Organizer
      19th International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminescence 2016
    • Place of Presentation
      Tsukuba, Japan
    • Year and Date
      2016-05-29 – 2016-06-02
  • [Presentation] Effects of vibronic transitions and water solvation on absorption and fluorescence spectra of firefly oxyluciferin2016

    • Author(s)
      Miyabi Hiyama, Yoshifumi Noguchi, Kenta Yamada, Hidefumi Akiyama, Nobuaki Koga
    • Organizer
      19th International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminescence 2016
    • Place of Presentation
      Tsukuba, Japan
    • Year and Date
      2016-05-29 – 2016-06-02
  • [Presentation] 太陽電池の絶対エレクトロルミネッセンス画像計測法と応用2016

    • Author(s)
      秋山 英文
    • Organizer
      第63回応用物理学会春季学術講演会
    • Place of Presentation
      東工大大岡山キャンパス(東京都目黒区大岡山)
    • Year and Date
      2016-03-19 – 2016-03-22
  • [Presentation] 多接合太陽電池エレクトロルミネッセンス定量計測の測定精度評価2016

    • Author(s)
      吉田 正裕、朱 琳、金 昌秀、久保田 英博、中村 徹哉、今泉 充、金光 義彦、秋山 英文
    • Organizer
      第63回応用物理学会春季学術講演会
    • Place of Presentation
      東工大大岡山キャンパス(東京都目黒区大岡山)
    • Year and Date
      2016-03-19 – 2016-03-22
  • [Presentation] Calibration standards and measurement accuracy of absolute electroluminescence and internal properties in multi-junction and arrayed solar cells2016

    • Author(s)
      Masahiro Yoshita, Lin Zhu, Changsu Kim, Toshimitsu Mochizuki, Tetsuya Nakamura, Mitsuru Imaizumi, Shaoqiang Chen, Hidehiro Kubota, Yoshihiko Kanemitsu, and Hidefumi Akiyama
    • Organizer
      SPIE Photonics West San Francisco
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
    • Year and Date
      2016-02-13 – 2016-02-18
    • Invited
  • [Presentation] "ll-electron first-principles X-ray adsorption spectra calculations for acetone and acetic acid2015

    • Author(s)
      Yoshifumi Noguchi, Miyabi Hiyama, Hidefumi Akiyama, Yoshihisa Harada, Nobuaki Koga
    • Organizer
      THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-17 – 2015-12-17
  • [Presentation] Theoretical study for photoluminescence of firefly-bioluminescence-related molecules2015

    • Author(s)
      Miyabi Hiyama, Yoshifumi Noguchi, Toshimitsu Mochizuki, Kenta Yamada, Hidefumi Akiyama, Nobuaki Koga
    • Organizer
      THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA,
    • Year and Date
      2015-12-16 – 2015-12-16
    • Invited
  • [Presentation] ホタル生物発光の量子化学計算と反応機構2015

    • Author(s)
      樋山みやび
    • Organizer
      量子化学探索研究所講演会
    • Place of Presentation
      東京大学 本郷キャンパス (東京都文京区本郷)
    • Year and Date
      2015-11-29 – 2015-11-29
    • Invited
  • [Presentation] 物発光における量子化学計算2015

    • Author(s)
      樋山みやび
    • Organizer
      第3回津田沼RBKフォーラム
    • Place of Presentation
      千葉工業大学 (千葉県習志野市津田沼)
    • Year and Date
      2015-11-28 – 2015-11-28
    • Invited
  • [Presentation] 量子化学計算によるホタル生物発光関連分子の理論的研究2015

    • Author(s)
      樋山みやび
    • Organizer
      談話会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部 (東京都千代田区 神田駿河台)
    • Year and Date
      2015-11-05 – 2015-11-05
  • [Presentation] 生物発光における分子科学2015

    • Author(s)
      樋山みやび
    • Organizer
      原子衝突学会第40回年会
    • Place of Presentation
      首都大学東京南大沢キャンパス国際交流会館( 東京都八王子市 南大沢)
    • Year and Date
      2015-09-28 – 2015-09-30
    • Invited
  • [Presentation] 生物発光の光制御に向けたケージド・ルシフェリンの分光評価2015

    • Author(s)
      倉田麻貴, 樋山みやび, 挟間優治, 東暉舜, 吉田正裕, 望月敏光, 秋山英文
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(東京都目黒区大岡山)
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] 水溶液中オキシルシフェリンの吸収・蛍光スペクトルにおける振電構造の解析2015

    • Author(s)
      樋山みやび, 野口良史, 秋山英文, 山田健太, 古賀伸明
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(東京都目黒区大岡山)
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] イクオリン生物発光の量子収率測定2015

    • Author(s)
      挾間優治, 東暉舜, 倉田麻貴, 樋山みやび, 吉田正裕, 久保田英博, 井上敏, 秋山英文
    • Organizer
      日本物理学会2015年秋季大会
    • Place of Presentation
      関西大学 千里山キャンパス(大阪府吹田市山手町)
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-17
  • [Presentation] Analysis of Photoluminescence Pathways of Firefly Oxyluciferin in Aqueous Solution"2015

    • Author(s)
      Miyabi Hiyama, Toshimitsu Mochizuki, Hidefumi Akiyama, Nobuaki Koga
    • Organizer
      日本生物物理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス(石川県金沢市角間町)
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] オキシルシフェリン光ルミネッセンスにおける発光反応経路と振動構造2015

    • Author(s)
      樋山みやび、野口良史、望月敏光、秋山英文、古賀伸明
    • Organizer
      物性研究所短期研究会 機能物性融合科学研究会シリーズ(3)
    • Place of Presentation
      東京大学物性研究所(千葉県柏市柏の葉)
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-26

URL: 

Published: 2017-01-06  

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