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2015 Fiscal Year Research-status Report

膜電位存在下での膜タンパク質の赤外分光解析系の開発

Research Project

Project/Area Number 26640047
Research InstitutionInstitute for Molecular Science

Principal Investigator

古谷 祐詞  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学研究領域, 准教授 (80432285)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords赤外分光法 / 生物物理 / 膜タンパク質 / 膜電位
Outline of Annual Research Achievements

膜タンパク質は、細胞外の環境情報を細胞内に伝達するなどの役割を果たしている。その分子機構の解明には、原子レベルでの構造情報を得ることが重要である。静的な立体構造についてはX線結晶構造解析によってなされているが、膜電位がどのように構造に影響するのかなど不明な点が多い。パッチクランプ法などの電気生理解析では、様々な膜電位におけるイオンチャネルの機能解析が可能であるが、構造に関する情報を得ることは困難である。
本研究では、膜タンパク質の赤外吸収スペクトルを高感度に計測する顕微赤外分光計測法を開発し、膜電位存在下での膜タンパク質の動的構造変化の計測系を構築することを目指している。研究項目として、1.高感度顕微赤外分光装置の開発、2.膜タンパク質の分子機構解明に向けた研究の2項目を設定している。今年度は、1.に関連して、表面増強赤外分光計測により、カリウムイオンやナトリウムイオンを選択的に吸着するクラウンエーテルのイオン包摂に伴う赤外吸収スペクトル解析の結果を共著論文として発表した(Y. Inokuchi et al. New J. Chem. 2015)。タイのチュラロンコン大学のインターンシップ生とともに、電気化学計測に用いるポテンシオスタットをマイクロ流路に組み込まれた電極に接続し、フェリシアン化カリやシトクロムcなどの酸化還元に伴う赤外吸収スペクトルの変化を赤外顕微鏡で計測することに成功した。表面増強赤外分光と組み合わせることで、電位依存的な赤外吸収変化を計測するための予備的な実験にもなりうるものである。
2.のテーマに関連して、ほ乳動物由来のカリウムチャネルの一種であるTWIK-1のイオン選択性に関する解析を進めたり、GPCRの一種であり視物質ロドプシンと近縁なメラノプシンの分子特性に関する結果を共著論文として発表した(H. Tsukamoto et al. J. Biol. Chem. 2015)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

膜タンパク質の赤外吸収スペクトルを高感度に計測する顕微赤外分光計測赤外分光計測系の構築や膜タンパク質の機能解析に必要となる電気生理実験の計測系の構築に若干の遅れが見られる。一方、プロトン感受性蛍光標識ACMAを用いたイオンチャネル活性測定系については若手研究(A)との関連も有り、順調に進めることができた。

Strategy for Future Research Activity

1.高感度顕微赤外分光装置の開発 赤外顕微鏡に設置されたATR対物鏡を用いて、脂質二重膜に再構成した膜タンパク質試料の赤外吸収スペクトルの計測を行う。どれぐらいの濃度での計測が可能かを検討する。また、ガラス等の基板上に金薄膜を蒸着し、膜タンパク質を表面に修飾する。膜タンパク質由来の赤外吸収シグナルの増強を目指すと共に、最適な増強効果が得られる条件を模索する。
2.膜タンパク質の分子機構解明に向けた研究 前年度に引き続き、培養細胞により種々の膜タンパク質発現を行う。また、精製タンパク質の脂質二重膜への再構成方法を、それぞれの試料に応じて検討する。精製タンパク質が機能的であるかどうかを平面脂質二重膜による電気生理実験などで確認する。全反射赤外分光計測により、イオンやリガンドなどの結合解離に伴う構造変化を明らかにし、基礎データとして活用する

Causes of Carryover

赤外分光測定に使用する試薬、膜タンパク質の調製に必要となる試薬や培地などを節約した。以上の理由により、今年度に必要な研究費を当初の予定よりも少なくすることができたため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度必要となる赤外分光測定に使用する試薬や膜タンパク質の調製に必要となる試薬や培地に使用する予定である。

  • Research Products

    (17 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] トロント大学(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      トロント大学
  • [Int'l Joint Research] バレンシア大学(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      バレンシア大学
  • [Journal Article] Simple and Rapid Fabrication of PDMS Microfluidic Devices Compatible with FTIR Microspectroscopy2016

    • Author(s)
      Monpichar Srisa-Art and Yuji Furutani
    • Journal Title

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      Volume: 89 Pages: 195-202

    • DOI

      10.1246/bcsj.20150357

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Live-cell single-molecule imaging of the cytokine receptor MPL for analysis of dynamic dimerization2016

    • Author(s)
      Akihiko Sakamoto, Takashi Tsukamoto, Yuji Furutani, Yuki Sudo, Kazuyuki Shimada, Akihiro Tomita, Hitoshi Kiyoi, Takashi Kato and Takashi Funatsu
    • Journal Title

      J. Mol. Cell Biol.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 光誘起赤外差分光法による微生物型ロドプシンのイオン輸送機構の研究2016

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Journal Title

      日本レーザー医学会誌

      Volume: 36 Pages: 460-465

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chimeras of channelrhodopsin-1 and -2 from Chlamydomonas reinhardtii exhibit distinctive light-induced structural changes from channelrhodopsin-22015

    • Author(s)
      Asumi Inaguma, Hisao Tsukamoto, Hideaki E. Kato, Tetsunari Kimura, Toru Ishizuka, Satomi Oishi, Hiromu Yawo, Osamu Nureki and Yuji Furutani
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 290 Pages: 11623-11634

    • DOI

      10.1074/jbc.M115.642256

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Specific interactions between alkali metal cations and the KcsA channel studied using ATR-FTIR spectroscopy2015

    • Author(s)
      Yuji Furutani*, Hirofumi Shimizu, Yusuke Asai, Shigetoshi Oiki and Hideki Kandori
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 12 Pages: 37-45

    • DOI

      10.2142/biophysico.12.0_37

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] New Insights into Metal Ion-Crown Ether Complexes Revealed by SEIRA Spectroscopy2015

    • Author(s)
      Yoshiya Inokuchi, Takayuki Ebata, Toshiaki Ikeda, Takeharu Haino, Tetsunari Kimura, Hao Guo, and Yuji Furutani
    • Journal Title

      New J. Chem.

      Volume: 39 Pages: 8673-8680

    • DOI

      10.1039/c5nj01787d

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Retinal Attachment Instability is Diversified Among Mammalian Melanopsins2015

    • Author(s)
      Hisao Tsukamoto, Yoshihiro Kubo, David L. Farrens, Mitsumasa Koyanagi, Akihisa Terakita, and Yuji Furutani
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 290 Pages: 27176-27187

    • DOI

      10.1074/jbc.M115.666305

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ion-Protein Interactions between a Potassium Channel and Alkali Metal Cations Studied by ATR-FTIR Spectroscopy2016

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      60th Annual Meeting of Biophysical Society (selected as a Platform Talk)
    • Place of Presentation
      Los Angeles, California, USA
    • Year and Date
      2016-03-01
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The molecular mechanisms of ion channel proteins studied by stimulus-induced difference FT-IR spectroscopy2016

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      Pure and Applied Chemistry International Conference (PCCON) 2016, The 4th CU-IMS Symposium
    • Place of Presentation
      Bangkok, Thailand
    • Year and Date
      2016-02-10
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 赤外分光法によるレチナールタンパク質の機能発現機構の解明2015

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      第29回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      東京都八王子市(首都大学東京)
    • Year and Date
      2015-09-04
    • Invited
  • [Presentation] Infrared Difference Spectroscopy is a Key Technique for Deciphering the Molecular Mechanisms of Ion Pump and Channel Proteins2015

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      OIIB (Okazaki Institute for Integrative Bioscience) Summer School 2015
    • Place of Presentation
      愛知県岡崎市(岡崎コンファレンスセンター)
    • Year and Date
      2015-08-13
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] イオンチャネルの分子機構解明への赤外分光解析による挑戦2015

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
    • Place of Presentation
      愛知県岡崎市(岡崎コンファレンスセンター)
    • Year and Date
      2015-04-20
    • Invited
  • [Book] 光と生命の事典1(「75 菌類のロドプシン」、第3章光の情報利用 3.1 光環境応答)2016

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Total Pages
      422(内、2ページ担当154-155)
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Book] Optogenetics -Light-Sensing Proteins and Their Applications- (Chapter 5 "Molecular Mechanisms for Ion Transportation of Microbial Rhodopsins Studied by Light-Induced Difference FTIR Spectroscopy")2015

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Total Pages
      409(内、15ページ担当63-76)
    • Publisher
      Springer
  • [Remarks] 分子科学研究所 生命・錯体分子科学研究領域 生体分子情報研究部門 准教授 古谷祐詞

    • URL

      https://groups.ims.ac.jp/organization/furutani_g/

URL: 

Published: 2017-01-06  

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